praca magisterska, biochemia, mgr


Niektóre mikroorganizmy mogą wytwarzać związki, pod wpływem których błony stają się przepuszczalne dla określonych jonów. Te małe, hydrofobowe cząsteczki, zwane antybiotykami jonoforowymi funkcjonują na zasadzie ruchu posuwisto-zwrotnego w celu transportowania jonów przez błonę. [1,2] Ruch ten jest jednokierunkowy, cyklicznej zmianie ulega tylko zwrot. Związki te skłonne są do wiązania różnych cząsteczek lub jonów w aktywnych częściach swojej struktury na zasadzie tworzenia kompleksów typu gość - gospodarz. Zdolność do wiązania z receptorem uwarunkowana jest powinowactwem, cząsteczki wiążącej a związanego jonu i aktywnością wewnętrzną. Umiejętność tworzenia kompleksu zależy od stopnia dopasowania struktury cząsteczki związku (gościa) oraz miejsca aktywnego kompleksującego receptor (gospodarza).[3] W swojej strukturze jonofory posiadają centra elektrodonorowe, które kompleksują określone jony. Zewnętrzna część cząsteczki jest hydrofobowa, dzięki czemu cząsteczki dobrze rozpuszczają się w błonach i mogą przez nie dyfundować. Jonofory działają jako przenośniki, albo jako elementy tworzące kanał dla jonów Na+, K+ czy Ca2+. Jako przenośniki wiążą jon po jednej stronie przenoszą go na drugą stronę. [1-3]

Powinowactwo antybiotyków jonoforowych w stosunku do koordynowanych jonów może wynikać z zarówno ich trójwymiarowej struktury, jak również różnicy pomiędzy energią desolwatacji jonu a jego skompleksowaniem. Czynnikami wpływającymi na selektywność jonoforów są w szczególności:

Istotną rolę w procesie selektywnego rozpoznania molekularnego odgrywa także pH środowiska, siła jonowa oraz rodzaj rozpuszczalnika. [4,5]

    1. Mechanizm transportu kationów

Mechanizm działania jonoforów typu przenośnikowego polega na tworzeniu wiązań koordynacyjnych pomiędzy jonem metalu i kilkoma atomami tlenu, które tworzą wnękę. Centralnie umieszczone atomy tlenu oraz grupy węglowodorowe, umieszczone na obwodzie przenośnika, pełnią istotną rolę podczas transportowania jonów.

Tworzy się kompleks jon-przenośnik (gość - gospodarz), rozpuszczalny w lipidowym wnętrzu błony. Umożliwia to przepływ jonów przez błonę i uwolnienie ich po drugiej stronie. [6]

0x01 graphic

Rysunek 1. Mechanizm działania jonoforów. Jonofor (oznaczony kolorem zielonym) kompleksuje kation metalu (czerwony) i przenosi na drugą stronę błony komórkowej.

Jonofory są grupą związków, która jak dotąd, nie posada jednolitego systemu klasyfikacji. Podział ułatwia uwzględnienie takich kryteriów: pochodzenie, budowa chemiczna, metody transportu, selektywność wobec kompleksowanych jonów. Najprościej antybiotyki jonoforowe można podzielić, ze względu ich pochodzenie na syntetyczne i naturalne.

0x01 graphic

Schemat 1. Podział jonoforów

    1. Neutralne jonofory

W tej grupie związków wyróznia się zarówno jonofory cykliczne jak i niecykliczne. W tym przypadku antybiotyk jonoforowy jest cząsteczką nie posiadającą ładunku - neutralną, dlatego też uzyskuje on ładunek kompleksowanego jonu. [7,8]

Transport kationów jednowartościowych przez błony, przy użyciu jonoforów neutralnych przedstawia się następująco :

0x01 graphic

Rysunek 2. Schemat transportu jonów przez jonofory neutralne

Jonofor wewnątrz błony (a) dyfunduje do granicy faz (b) gdzie napotyka na jon. Gdy kation znajduje się w odpowiednim położeniu by oddziaływać z jonoforem (c), solwatująca jon cząsteczka wody jest oddalana i zastępowana przez kompleksujące atomy tlenu (d). Stabilny kompleks M+I przechodzi z granicy faz do wnętrza błony, gdzie zachodzą procesy f-h, odwrotne do procesów b-d. Ostatecznie pusty jonofor dyfunduje do przestrzeni międzykomórkowej (i) przywracając początkowe warunki procesu (a).[8]

      1. Walinomycyna

Walinomycyna jest cyklicznym, neutralnym antybiotykiem jonoforowym, należącym do szerokiej klasy depsipeptydów - związków antybakteryjnych, które zmieniają funkcje i integralność dwuwarstwy lipidowej.

Jonofor jest 12 członowym cyklicznym dodekadepsipeptydem, składającym się z powtarzalnych trzech jednostek tworzących pierścień.

0x01 graphic

Rysunek 3. Cząsteczka walinomycyny

Ich wzór może być zapisany jako cyklo-(D-walina, L-Lac,L-walina, D-Hyv)3, gdzie Lac oznacza kwas mlekowy, natomiast Hyv - kwas hydroksyizowalerianowy. Walinomycyna została wyizolowana ze szczepu bakterii Streptomyces fulvissimus przez Brockmanna i Schmidta-Kastnera, w 1955 roku. [9-11]

0x01 graphic

Rysunek 4. Powtarzająca się jednostka walinomycyny: (A) L-mleczan, (B) L-walina,

(C) D-hydroksyizowalerianian, (D) D-walina

Prostota molekularnej struktury walinomycny pozwoliła na wykorzystanie cząsteczki jako modelu do opisania selektywnego transportu kationów jedno- jak i dwuwartościowych przez błony biologiczne. Kompleks jonoforu z kationem metalu jest bardzo stabilny. Walinomycyna odgrywa bardzo ważną rolę. Jej działanie zwiększa przepuszczalność membrany dla jonów potasu. [10,11]

Selektywność w stosunku do kationów metali jednowartościowych jest następująca: Rb+>K+>Cs+>Ag+>NH4+>Na+>Li+. [3] Dla jonów dwuwartościowych: Ba2+ > Ca2+ > Sr2+ > Mg2+.

Podczas kompleksowania, K+, walinomycyna przyjmuje konformacje „szwu piłki tenisowej” i owija się wokół kationu. Kompleksowanie kationu następuje przy pomocy atomów tlenu, pochodzących z grup karbonylowych cząsteczek waliny. Podczas kompleksowania kationu zostają również utworzone wewnątrzcząsteczkowe wiązania wodorowe między amidowymi atomami wodoru. Cały kompleks tworzy strukturę rozpuszczalną w błonach, która może transportować kation. [10,11]

0x01 graphic

Rysunek 5. Schemat kompleksu walinomycyny z K+

Konformacja walinomycyny silnie zależy od rodzaju rozpuszczalnika. Badania rentgenograficzne wykazały, że jonofor przyjmuje co najmniej trzy rodzaje konformacji:

0x01 graphic

Rysunek 6. Różne strukturalne formy walinomycyny. Struktura krystaliczna w : rozpuszczalniku niepolarnym (A), rozpuszczalniku polarnym (B), kompleksie z potasem (C). Linie przerywane reprezentują wiązania wodorowe.

Walinomycyna wykazuje silną aktywnośc biologiczną, działa przeciwbakteryjnie, przeciwwirusowo , przeciwnowotworowo i przeciwgrzybiczno. Jednak ze względu na wysoką toksyczność jej zastosowanie jest ograniczone. Jonofor znalazł zastosowanie w elektrodach jonoselektywnych do wykrywania jonów potasu.

    1. Naturalne jonofory tworzące kanał

Błony biologiczne stanowią dynamiczne, złożone jednostki, których struktura i funkcja są ściśle związane ze środowiskiem zewnętrznym. Podstawową właściwością błon jest grubość warstwy hydrofobowej, która ma ogromny wpływ na białka trans - błonowe. [13,14]

Kanały mogą ulegać zmianom związanym z konformacją, zwijaniem i aktywnością. Prowadzić do tego mogą: hydrofobowe niedopasowanie, różnica w długości hydrofobowych białek transbłonowych i sąsiednich pierścieni lipidów. [15-17] W wyniku zmian konformacyjnych w dwuwarstwie lipidowej powstaje kanał, który zależy od stopnia niedopasowania.

0x01 graphic

Rysunek 7. Jonofor tworzący kanał

Kanały jonowe są białkami, które regulują transbłonową przepuszczalność jonów przez błony komórkowe. Stanowią one ważną klasę cząsteczek ze względu na swoją zdolność do łączenia wnętrza komórki z jej zewnętrzną stroną, w sposób selektywny. [18,19]

      1. Gramicydyna A

Liniowa gramicydyna należy do rodziny jonoforów tworzących kanał. Antybiotyk wytwarzany jest przez glebowe bakterie Bacillus brevis i składa się z 18 naprzemiennie ułożonych L- i D-aminokwasów. Tworzą one dobrze określone, selektywne dla kationów kanały jonowe w błonach komórkowych. [20,21]

Strukturę kanału „głowa” do „głowy” zaproponował Urry, w 1971 roku.[22,23] Wnętrze kanału ma skład [24]:

HCO-L-Val1-Gly2-L-Ala3-D-Leu4-L-Ala5-D-Val6-L-Val7-D-Val8-L-Trp9-D-Leu10-L-Trp1l-D-Leu12-L-Trp13-D-Leu14-L-Trp15-NHCH2CH2OH

Hydrofobowe łańcuchy znajdują się na zewnątrz dimeru, wnętrze natomiast jest hydrofilowe. Gramicydyna wykazuje zależność od środowiska, dlatego też przyjmuje różne konformacje. Szczegółowy mechanizm działania gramicydyny w membranie nie jest znana. [20,21]

Kanał utworzony jest poprzez transbłonową asocjację dwóch jednoniciowych monomerów. Oba peptydy przypominają strukturę β-harmonijki. Forma ta jest stabilizowana przez piętnaście wewnątrzcząsteczkowych i sześć międzycząsteczkowych wiązań wodorowych. Wielkość porów kanału (średnica około 4 Å) jest wystarczająco duża, aby zapewnić przepływ kationów metali jednowartościowych. [20, 21]

Selektywność wobec kationów jest następująca: Cs+ > Rb+ > K+ > Na+ > Li+.

0x01 graphic

Rysunek 8. Dimer gramicydyny A spleciony razem (po lewej) i tworzący kanał (po prawej)

Istnieją także homologi gramicydyny - gamicydyna B oraz C, różnące się charakterem reszty aromatycznej umiejscowionej w pozycji 11. Reszta tryptofanowa zastąpiona jest odpowiednio fenyloalaniną i tyrozyną. [21]

Niekorzystną cechą jonoforu jest niska selektywność, związana z transportem. Przez kanał mogą przechodzić zarówno jony jak i substancje niepożądane.

Gramicydyna A wykazuje szeroką aktywność biologiczną. Stosowana jest jako środek przeciwbakteryjny wobec bakterii Gram-ujemnych oraz bakterii Gram-dodatnich, za wyjątkiem bakterii z rodzaju Bacillus.

    1. Jonofory karboksylowe

Jonofory karboksylowe nazywane także antybiotykami polieterowymi, stanowią dużą grupę występujących naturalnie, biologicznie czynnych związków. Są rozpuszczalne w tłuszczach i zdolne do transportu kationów metali przez błony biologiczne. Znanych jest ponad 120 jonoforów karboksylowych występujących naturalnie.[25] Komercyjnie jonofory wykorzystuje się jako środek hamujący kokcydiozę oraz stymulator wzrostu u przeżuwaczy. [26]

Wszystkie zastosowania jonoforów karboksylowych są ściśle związane z ich zdolnością do tworzenia kompleksów z kationami metali i transportowaniu ich przez membranę lipidową. Kation metalu mieści się w „klatce” utworzonej przez atomy tlenu zawarte w strukturze jonoforu. Tworzą się obojętne kompleksy antybiotyku polieterowego z jedno- lub dwuwartościowymi kationami metalu oraz z zasadami organicznymi. Całość staje się lipofilowa i jest transportowana przez błonę. Struktura kompleksu stabilizowana jest przez wewnątrzcząsteczkowe wiązania wodorowe wytworzone między grupą karboksylową i grupami hydroksylowymi.

Mechanizm transportu kationu przez jonofor wynika z jego zdolności do wymiany kationu i protonu. W tego rodzaju transporcie najpierw następuje deprotonacja jonoforu, tworzy się anion jonoforu. Anion antybiotyku wiąże kation metalu (M+), po zewnętrznej stronie, z wytworzeniem obojętnej soli. Kompleks przesuwa się wzdłuż błony, uwalniając po jej wewnętrznej stronie kation. Powstaje anion wiążący proton (H+), tworzy się neutralny polieterowy jonofor w postaci kwasu. Cząsteczka dyfunduje przez błonę, aby znów po zewnętrznej stronie związać kation.

Tylko nienaładowana cząsteczka, zawierająca M+ lub H+, może swobodnie poruszać się w błonie.

0x01 graphic

Rysunek 9. Mechanizm transportu kationów przez jonofory karboksylowe

Selektywność jonoforów wynika z wielkości „klatki”. Tylko kationy o odpowiednich rozmiarach mogą idealnie dopasować się we wnękę, zbyt duże odkształcają wnękę natomiast małe nie znajdują optymalnej koordynacji.[27-31]

      1. Salinomycyna

Salinomycyna jest nowym antybiotykiem jonoforowym, wytwarzanym przez szczep Streptomyces albus. Jest związkiem o wzorze cząsteczkowym C42H70O11, wykazującym aktywność przeciwko bakteriom Gram-dodatnim, w tym prątków i niektórych grzybów nitkowatych, i jest skuteczna w leczeniu kokcydiozy u drobiu. Wykazuje także właściwości przeciwnowotworowe.

0x01 graphic

Rysunek 10. Cząsteczka salinomycyny

Salinomycyna jest 100 razy skuteczniejsza wobec komórek raka piersi, niż Taxol - powszechnie stosowany lek chemoterapeutyczny na raka piersi.[32] Antybiotyk przejawia preferencję do kompleksowania kationów jedno- i dwuwartościowych w układzie dwufazowym i pośredniczy w ich transporcie przez błony biologiczne. Selektywność salinomycyny wobec kationów jest następująca: K+ > Na+ > Cs+ > Sr2+ > Ca2+ > Mg2+. [33,34]

      1. Grizoryksyna

Grizoryksyna jest antybiotykiem jonoforowym, z grupy nigerycyn, wyizolowane ze szczepu Steptomyces griseus. [35-37] W swojej budowie związek zawiera otwarty wielopierścieniowy łańcuch polieterowy, mający funkcje kwasową. Występuje w postaci białego proszku, który rozpuszcza się w rozpuszczalnikach organicznych, ale nie rozpuszcza się w wodzie.[35]

Antybiotyk silnie wiąże kationy jednowartościowe, tj.: Na+, K+, Ag+, Li+, Rb+, Cs+, Tl+. Kationy K+ i Ag+ po połączeniu z grizoryksyną dają sole izomorficzne, natomiast kationy Li+, Rb+, Cs+ dają sole amorficzne w postaci ciał stałych. [36] Grizoryksyna wykazuje również powinowactwo do kationów dwuwartościowych, a selektywność zmienia się w szeregu K+ > Na+ > Cs+ > Sr2+ > Mg2+ > Ca2+.

0x01 graphic

Rysunek 11. Struktura grizoryksyny

Podobnie jak w większości antybiotyków z grupy nigerycyn, kompleksy soli tworzone są gdy kation otoczony jest przez łańcuch cząsteczki. Kation połączony jest wiązaniami koordynacyjnym z czterema atomami tlenu łańcucha polieterowego. [36] Grizoryksyna wykazuje silne działanie przeciwbakteryjne (przeciwko bakteriom Gram-dodatnim) i przeciwgrzybiczne, jednak z powodu dużej toksyczności ma ograniczone zastosowanie przy leczeniu. [35-37]

      1. Monenzyna

Monenzyna A jest znanym naturalnym, polieterowym antybiotykiem jonoforowym, zdolnym do transportu jednowartościowych kationów metali przez błony lipidowe, tworząc z jonami pseudo-makrocykliczne kompleksy. Należy więc do grupy cząsteczek wysoko bioaktywnych.[2,38]

Monenzynę wyizolowano, po raz pierwszy w 1967 roku, ze szczepu Streptomyces cinnamonensis. Cząsteczka składa się z podstawowego szkieletu zawierającego: trzy pierścienie tetrahydrofuranowe oraz dwa pierścienie tertahydopiranowe. Cząsteczka monenzyny posiada ponadto trzy grupy hydroksylowe oraz grupę karboksylowa.

0x01 graphic
Rysunek 12. Cząsteczka monenzyny A

Podczas tworzenia kompleksów powstaje pseudo-cykliczna struktura stabilizowana przez wiązania wodorowe, tworzone między grupą karboksylową, a dwoma grupami hydroksylowymi. W kompleksie prawie wszystkie atomy tlenu skierowane są do wewnątrz, dzięki czemu cząsteczka staje się lipofilowa i może transportować kationy wzdłuż błon. Strona zewnętrzna jest hydrofobowa. Monenzyna jest w stanie tworzyć kompleksy z kationami metali podobne do niektórych sztucznych analogów, takich jak etery koronowe. [2, 39] Powinowactwo do jonów maleje w szeregu: Na+>K+>Rb+>Cs+>Li+>NH4+.

Monenzyna hamuje wzrost bakterii Gram-dodatnich (aktywność przeciwbakteryjna), oraz skutecznie hamuje kokcydiozę u drobiu i bydła. Wykazuje również aktywność przeciwmalaryczną, antybiotyczną. Reguluje wiele funkcji komórkowych, w tym apoptozę komórek nowotworowych. [39-43]

Niestety monenzyna wykazuje stosunkowo dużą toksyczność. Do tej pory różne modyfikacje monenzyny pozwoliły uzyskać mniej toksyczne pochodne, co umożliwia rozszerzenie spektrum zastosowania antybiotyku. [44]

    1. Syntetyczne jonofory

Obecnie poznano wiele metod syntezy związków wykazujących właściwości kompleksujące w stosunku do kationów metali pierwszej i drugiej grupy układu okresowego. Syntetyczne antybiotyki odgrywają bardzo ważną rolę we współczesnej chemii, biologii, ochronie środowiska. Tworzą podłoże do budowy wielu biomolekularnych urządzeń, których wykorzystanie ciągle wzrasta. [3]

      1. Syntetyczne cykliczne jonofory

Do tej grupy związków zaliczamy etery koronowe, kryptandy, sferandy oraz karcerandy. Jonofory te wytwarzane są przez działalność człowieka.

        1. Etery koronowe

Etery koronowe są najbardziej popularnymi syntetycznymi związkami makrocyklicznymi, które mogą spełniać rolę gospodarzy w stosunku do kationów. [45] Budowa heteromakrocyklicznych cząsteczek zazwyczaj składa się z powtarzających się jednostek eterowych [ - (CH2CH2O)n - ] [46].

Odkrycie, w 1967 roku, eterów koronowych oraz ich zdolność do kompleksowania kationów i cząsteczek zawdzięczamy Pedersenowi. [47]

Etery koronowe znane są z wysokiego i selektywnego powinowactwa do kationów metali jedno- i dwuwartościowych, kationów niemetali i cząsteczek obojętnych. Selektywność wynika z ilości elektrodonorowych atomów tlenu występujących w cząsteczce.

0x01 graphic

Rysunek 13. Przykładowe struktury eterów koronowych, różniące się wielkością pierścienia.

Cząsteczka eteru wiąże ściśle określony jon, np. wyłącznie K+ lub Mg2+. Trwałość kompleksów zależy od:

Istotną właściwością tych makrocyklicznych związków jest bardzo dobra rozpuszczalność w rozpuszczalnikach polarnych, jak i niepolarnych, wynikająca ze zmianami konformacyjnymi eteru, tzw. „zwijania” i „rozwijania się” [48]

0x01 graphic

Rysunek 14. Zmiana konformacji ze względu na rodzaj rozpuszczalnika.

Etery koronowe mają bardzo szarokie zastosowanie m.in. w: