Jednym z ważniejszych etapów w diagnostyce laboratoryjnej płynu mózgowo-rdzeniowego jest analiza białek płynu prowadząca w konsekwencji do oceny bariery krew-płyn i oceny wewnątrzoponowej syntezy immunoglobulin. Badanie płynu zawsze powinno być uzupełnione badaniem tych samych parametrów we krwi żylnej pacjenta.