Działalność człowieka powoduje powstawanie zanieczyszczeń, które mogą mieć charakter punktowy lub obszarowy. Źródła punktowe stanowią wyloty kolektorów ścieków lub wód podściekowych, nieuszczelnione szamba, wylewiska ścieków, gnojowicy, wysypiska ścieków. Zanieczyszczenia obszarowe powodowane są głównie przez działalność rolniczą. Intensyfikacja rolnictwa wpłynęła na zwiększenie się w wodach gruntowych i powierzchniowych substancji nawozowych. Dodatkowo następuje eliminacja naturalnych barier: zadrzewień śródpolnych, oczek wodnych, terenów bagiennych które ograniczały migrację substancji chemicznych