Metoda praktycznie już nie stosowana.
)••* prow*d#ons
długo *by imMo «V(>odirt«Mo* tr«4mo
*ł n*.
tOKWl pW»y tmoriĄ j* «yrna*cmOT« na ho*e«t*
Degradacja wyznakowanych na 5' końcu cząsteczek DNA związkami chemicznymi przecinającymi specyficznie wiązania fosfodiestrowe za nukleotydem odpowiadającym określonej zasadzie azotowej.
Wynik - zbiór fragm. DNA różnej długości ( dobór warunków, tak aby w poszczególnych cząsteczkach przecinane było tylko jedno lub dwa wiązania). Fragmenty z czterech niezależnych reakcji (G; G i A; C; C i T) rozdzielane elektroforetycznie następnie autoradiografia.
Prążki na autoradiogramie odpowiadają fragmentom DNA posiadającym na końcu 5' znakowany fosfor a na końcu 3' określoną zasadę.