2. Z obniżeniem stężenia PGE, wiążą się zaburzenia żołądkowo-jelitowe, wynikające z podwyższonej motoryki jelit oraz zmniejszenia wydzielania jonów Na+ i wody przez nerki. Zaburzenia czynności nerek w większości przypadków nie przybierają nasilenia o znaczeniu klinicznym i cofają się po odstawieniu leków. Czasem dochodzi jednak do ostrej niewydolności nerek.
3. Niedobór PGE, stwarza niebezpieczeństwo zamknięcia Ductiis artenosus Botalli.. Obecnie syntetyczna PGE, (Ąlprostił, MINPROG) stosowana jest u noworodków z wrodzoną
wadą serca, paliatywnie do czasu zabiegu chirurgicznego, celem rozszerzenia przewodu tętniczego BotalTa.