Redukcyjne aminowanie a-oksokwasów
O
OH NH, ,
NaBH4 O
J
W roztworze kwasowym, czyli przy niskim pH, cząsteczka aminokwasu jest protonowana i występuje głównie jako kation. W roztworze zasadowym, przy wysokim pH, aminokwas traci proton i występuje głównie jako anion. Pośrednie pH, przy którym istnieje dokładna równowaga między formą kationową i anionową aminokwasu i występuje on jedynie jako obojętny, dipolowy jon obojnaczy nazywamy punktem izoelektrycznym, p/, aminokwasu.
aJ- -WUI, R 0 |
H,0+ R O -OH |
R O |
pH HgNCHcoH |
-— +1 11 _ -— H3NCHCO |
= 1 f • HgNCHCO |
io omuwoWOA njskjepH (protonowany) |
PH |
wysokie pH |
punkt izoelektryczny |
zdeprotonowany | |
jcyfaoty cfoo^Jmp. |
(neutralny jon obojnaczy) |
IgL. Na czym polega proces elektroforezy? J tlektroforeza to metoda separacji makrocząsteczek. Pod wpływem przyłożonego napięcia cząsteczki te, obdarzone ładunkiem elektrycznym, wędrują w polu elektrycznym. Prędkość przemieszczania zależy od ładunku makrocząsteczki, jej rozmiaru, kształtu, a także oporów ruchu środowiska. Technika ta jest najczęściej stosowana do rozdzielenia DNA i jego analizy w żelu, a także do rozdzielania RNA czy białek.
Wyróżnia się dwa rodzaje żeli:
żele agarozowe i żele poliakrylamidowe
Aparaty do elektroforezy:
aparat i żel poziomy - żel umieszcza się poziomo; nalewamy do zbiornika odpowiedni bufor i przykładamy napięcie - to wywołuje migrację DNA (ma ładunek ujemny) od elektrody ujemnej (katody) do elektrody dodatniej (anody);
aparat pionowy - stosuje się go głównie do rozdziału w żelach poiiakrylamidowych; żel umieszcza się pionowo; od góry i od dołu żelu są zbiorniki z buforem; kierunek migracji jest od elektrody ujemnej do elektrody dodatniej.
Rozdział elektroforetyczny zależy od kilku czynników: konformacji DNA;