Udział w procesach utleniania komórkowego - detoksykacja metabolitów i ksenobiotyków przez ich utlenianie.
P-oksydacja kwasów' tłuszczowych - wytwarzanie z kwasów' tłuszczowych dwu węglowych fragmentów, które następnie przekształcane są w' acetylokoenzym A i transportowane do cytozolu, gdzie wykorzystywane są jako źródło energii w cyklu kwasu cytrynowego.
Substratami są kwasy tłuszczowe nasycone i nienasycone, o długich łańcuchach > 22 atomy węgla.
Biosynteza plazmalogenów' (eterolipidów) - actylotransferaza fosforanu dihydroksyacetonu -zlokalizowana w' peroksysomach, katalizuje pierwszą reakcję szlaku.
Biosynteza cholesterolu - reduktaza-3-hydroksy-3-metyloglutarylo-CoA.