I
wiele kombinacji podwójnych czy nawet potrójnych barwień fluorescencyjnych. j
Omówione zostaną barwienia najczęściej stosowane w cytogenetyce roślin. Szerokie i
zastosowanie w barwieniu chromosomów ma DAPI (4'-6'-diamidyno-2-fenoloin- |
doi), nie tylko do barwienia prążków, ale również jako metoda podbarwiania j
chromosomów po hybrydyzacji in situ, czy do pomiarów zawartości DNA. DAPI 1
preferencyjnie barwi DNA bogaty w pary AT, podobnie jak inny barwnik !
distamycyny A (DA) lub aktynomycyny D (AMD). Fluorochromem stosowanym do barwienia DNA bogatego w pary GC jest antybiotyk chromomycyna A3, wywołująca żółtoczerwoną fluorescencję. Zastosowanie dwóch fluorochromów '
DAPI i chromomycyny A3 (DAPI/CMA) pozwała odróżnić prążki bogate w pary GC (jasny prążek CMA) i prążki bogate w pary AT (jasny prążek DAPI). Stosuje się również sekwencyjne barwienie CMA, DA i DAPI (CDD), a następnie po analizie preparatów — odbarwienie i podwójne barwienie DAPI/AMD. Zanalizo- j
wane preparaty można ponownie odbarwić i zabarwić metodą C-prążków, w ten j
sposób w tych samych chromosomach można analizować położenie prążków j
różnego typu (ryc. 2.5 — Tabl. II). j
Jednym z głównych zastosowań różnicowego barwienia chromosomów jest 1
identyfikacja poszczególnych chromosomów w celu opracowania kariotypu danego j
osobnika czy gatunku. Standardowy kariotyp danego gatunku powinien prezentować '
najczęściej spotykany typ wzorów prążkowych. Prążki dostarczają istotnych |
danych dotyczących morfologicznych cech chromosomów. Cechy te są nie tylko j
lub zabiegów biotechnologicznych albo hodowlanych (ryc. 3.5). Różnicowe |
barwienie chromosomów znalazło szczególnie szerokie zastosowanie w cytogenetyce człowieka. W medycynie różne metody barwienia chromosomów są rutynowo wykorzystywane w diagnostyce chorób dziedzicznych, nowotworowych i innych związanych ze zmianami w liczbie i strukturze chromosomów. .
Ćh 4 2.2.6. Typy chromosomów j
W jądrze komórkowym, oprócz podstawowego zespołu chromosomów, zwanych j
często standardowymi, mogą występować chromosomy dodatkowe, takie jak chromosomy B czy minichromosomy. Szczególnym rodzajem są również chromosomy płci, które występują u nielicznych tylko gatunków.
2.2.6.1. Minichromosomy
Jednymi z najmniejszych tego typu chromosomów są, występujące u niektórych :
odmian pszenicy, „midget chromosome”. Mają one 0,9 pm długości, co odpowiada wielkości połowy satelitarnego odcinka chromosomu IB pszenicy. Ich zachowanie :
podczas mitozy i mejozy wskazuje, że mają wszystkie funkcjonalne struktury, takie jak centromer, telomery i sekwencje do inicjacji replikacji DNA. Analiza molekularna i genomowa hybrydyzacja in situ wykazały, że pochodzą one prawdopodobnie od jednego z chromosomów żyta (IR) jako wynik krzyżówek tych dwóch gatunków w czasie zabiegów hodowlanych mających na celu otrzymanie lepszych odmian pszenicy. Bardzo małe, nietypowe chromosomy były również opisywane u niektórych gatunków roślin w komórkach kalusa lub hodowli zawiesinowej in vitro.
2.2.6.2. Chromosomy B
„Chromosomy B” zostały tak nazwane dla odróżnienia od standardowych, „normalnych” chromosomów A u kukurydzy. Znane są również pod nazwą „chromosomy nadliczbowe” lub „dodatkowe”. Występują w naturalnych populacjach wielu gatunków roślin i zwierząt. U roślin występują u gatunków obcopylnych (tab. 2.2). Nie są to chromosomy niezbędne do życia organizmu, ale nie są też obojętne dla jego rozwoju i wzrostu, szczególnie gdy występują w dużej liczbie. Na podstawie fenotypu rośliny nie można stwierdzić obecności chromosomów B; niezbędna jest do tego analiza cytologiczna.
Chromosomy B mają cechy morfologiczne i strukturalne podobne do innych chromosomów, ale mogą być odróżnione od chromosomów standardowych na podstawie ich zachowania i kilku charakterystycznych cech. Jedną z nich jest ich występowanie w obrębie gatunku. Mogą być obecne u niektórych osobników danej populacji, a ich liczba może być różna i czasami przekracza liczbę chromosomów
TABELA 2.2
Liczba chromosomów B u wybranych gatunków roślin (wg Jones i Rees, 1982)
Gatunek I |
Ploidalność 2 x |
Liczba chromosomów 2n |
Liczba „B” |
Aegilops speltoides |
2 x |
14 |
0-6 |
Altium cepa |
2 x |
16 |
0-1 |
Betula papyrifera |
6 x |
84 |
0-8 |
Brachycome lineariloba |
2 x |
4 |
0-22 |
Cardaminopsis arenosa |
4x |
32 |
0-3 |
Crepis capillaris |
2 x |
6 |
0-5 |
Festuca pratensis |
• 2 x |
14 |
0-21 |
Haplopappus gracilis |
2x |
4 |
0-6 |
Lolium perenne |
2 x |
14 v |
0-3 |
Oenothera lamarckiana |
2 x |
14 |
1 |
Picea glauca |
2 x |
24 |
0-5 |
Secale cereale |
2 x |
14 |
0-8 |
Vicia faba |
2 x |
12 |
0-2 |
Taraxacum officinale |
3 x |
24 |
2 |
Tradescantia virginiana |
4 x |
24 |
1-6 |
Zea mays |
2 x |
20 |
0-34 |
59