14.7.1. Azot atmosferyczny
Najbardziej rozpowszechnionym źródłem azotu w środowisku naturalnym jest azot atmosferyczny, stanowiący 78% składu powietrza, jednakże tA forma azotu nie jest dostępna dla większości drobnoustrojów. Drobnoustrojami zdolnymi asymilować azot atmosferyczny są przede wszystkim bakterio środowisk naturalnych: bakterie fotosyntctyzujące, tlenowce z rodzaju Azotobacter, mikroaerofilc z rodzaju Achromobacter, beztlenowce z rodzaju Clostridium, a także bakterie brodawkowe z rodzaju Rhizobium, które żyją w symbiozie z korzeniami roślin oraz sinice.
Azot w związkach organicznych występuje w formie grup NH2 lub NH, tak więc wykorzystanie azotu atmosferycznego przez drobnoustroje polega na jego redukcji. Proces ten wymaga dużego nakładu energii, gdyż wiązanie pomiędzy atomami azotu w cząsteczce jest bardzo silne. Asymilację azotu atmosferycznego zapewnia układ enzymatyczny, w skład którego wchodzą dehydrogenaza pirogronianowa, nitrogenaza i ferredoksyna. Donatorem protonów i elektronów do procesu redukcji jest pirogronian. Na związanie 1 mola N2 potrzeba około 20 moli ATP. Chcmizm wiązania azotu atmo- | sferycznego oraz znaczenie tego procesu omówiono w rozdziale 24.
14.7.2. Wykorzystanie azotu mineralnego
Zdolność tę wykazuje wiele drobnoustrojów. Łatwiej przyswajalne są sole amonowe niż azotany, które przed wbudowaniem w związki organiczne muszą być zredukowane do jonu NH*. Azotyny ze względu na swoją toksyczność są źródłem azotu jedynie dla nielicznej grupy drobnoustrojów. Reakcje przekształceń azotanów i azotynów do amoniaku zostały przedstawione w rozdziale 14.5.
14.7.3. Rozkład białek i aminokwasów
Liczne grupy bakterii charakteryzują się właściwościami proteolitycznymi, tzn. wykazują zdolność do hydrolizy białek, a następnie rozkładu aminokwasów. Enzymy odpowiedzialne za ten proces nazywamy proteazami (enzymy proteolityczne); rozszczepiają one wiązanie peptydowe pomiędzy resztami aminokwasów i są syntetyzowane m. in. przez bakterie z rodzaju Proteus, Bacillus, Clostridium, a także niektóre grzyby. Proteazy, podobnie jak wspomniane wyżej lipazy, nie wykazują swoistości substratowej, tzn. są zdolne hydrolizować różne białka. Wśród tych enzymów wyróżniamy cn-dopeptydazy hydrolizującc białko z wytworzeniem poli- i oligopeptydów oraz egzopeptydazy odszczepiające pojedyncze aminokwasy, włączane bezpośrednio do biosyntezy biiiłck lub rozkładane w reakcjach dcaminacji, dckarboksylacji lub tranutminocji.
Deaminacja jest procesem odłączenia od aminokwasu grupy NH2. Wyróżniamy dcaminację oksydacyjną, redukcyjną, desaturacyjną, hydrolityczną oraz typu Sticklanda. Deaminacja oksydacyjna zachodzi wg schematu:
COOH
NAD+ -> NADH, !
h2o
i I
NH3 R
Aminokwas
Iminokwas
Ketokwas
Przykładem takiej reakcji może być rozkład kwasu glutaminowego oraz fenyloalaniny.
COOH
COOH
NAD +
COOH
NH2—C—H
i I
NH, (CH2)2 COOH
Kwas 2*okso-glutarowy (a-kctoglutarowy)
NH.
Fenyloalanina
Kwas fenylopirogronowy
Deaminacja redukcyjna jest przemianą polegającą na przekształceniu aminokwasu do kwasu nasyconego wg schematu:
COOH
COOH
1
nh3 r
H2N—C—H CH2
R