I- rzędowa struktura - sekwencja zasad
II- rzędowa struktura - struktura podwójnej helisy jest utrwalona przez: ^
- wiązania wodorowe i
- oddziaływania stosowe inaczej nazywane efektem asocjacji warstwowej (ang. stacking interactions) pomiędzy zasadami azotowymi
- oddziaływania van der Waalsa i -oddziaływaniajonowe
lll-rzędowa struktura - sposób upakowania helisy DNA w przestrzeni:
• formy superhelikaine
• nukleosomy