Objawy alarmujące nasuwają mocne podejrzenie organicznej przyczyny bólu:
1) ostry ból brzucha z wymiotami lub nagłym zatrzymaniem stolca - wskazuje na niedrożność (ostry brzuch)
2) nieprawidłowości w badaniu przedmiotowym (m.in. żółtaczka, zmiany w okolicy odbytu, guz brzucha)
3) obecność krwi w stolcu i przewlekły ból brzucha - mogą być objawem raka jelita grubego lub nieswoistych zapaleń jelit; może im towarzyszyć niedokrwistość mikrocytowa z powodu przewlekłego krwawienia, a w zapaleniach także gorączka
4) ostry ból brzucha z krwawieniem z dolnego odcinka przewodu pokarmowego - może świadczyć o niedokrwieniu jelit lub infekcyjnym zapaleniu jelita grubego
5) zmniejszenie masy ciała i przewlekły ból - są objawami niepokojącymi i wskazują na chorobę nowotworową lub nieswoiste zapalenia jelit; podobnie guz w jamie brzusznej
6) ból brzucha w nocy (budzi chorego).