3582323891

enzymologia

2011-11-30

mutacje indukowane i naturalne

sekwencje aminokwasowe mogą zmieniać się drogą mutacji. Wlabolatorium indukowanie mutacji punktowych powdouje że his 323 w białku „dzikim" zastąpiona przez Asn (his 232 asn)

Mutacje w białkach zachodzą drogą naturlaną. W większości nie mają one wpływu nawłaściwości białka ale w niektórych przypadkach mają charakter mszczący. W ani mii sierpowatej reszta 6 Glu (pirwszy od N końca - zawsze od N końca) w łańcuchu beta Hb wykazała że glu 6 kontakutje się z sowantem (polarny łańcuch boczy) W formie deoxy Hb reszty Val (hydrofitowy) zbliżają się do siebie żeby odizolować się od polarnego rozpuszczalnika - agregują. Powstają włókna Hb a kształt krwinki adaputje się do ich formy; sierpotwatej.

Swobodna rotacja wokół obu wiązań każdego aminokwasu pozwala na zwijanie się białek na rożne sposoby. Z powodu zawad sterycznych 3/4 z możliwych kombinacji kątów fi i psy nie występują w białkach.

Kąty fi i psy determinują strukturę Ilrz białek. Z wyjątkiem glicyny wykres obserwowanych wartości jest taki jak widać na wykresie Ramachandrana dla Ala w krysztale białka x-180 - +180 y-180 - +180

przy-180; 0 i przy -180;+18Q

Dwa zgrupowania w strókurze beta kartki i alfa helisy Struktura alfa helisy

stabilizowana przez wiązania wodorowe między tlenem karbonylowym jednej reszty i a protonem azotu reszty i +4

Wiąz wodorowe są możliwe z powodu ułożenia grupy C=0 i N-H wzdłuż osi helisy Pojedyncze wiązania peptydowe są wydłużone w tej strukturze ogólny moment dipolowy co także działa stabilizująco na strukturę

łańcuchy sterczą na zewnątrz względem wiązań wodorowych struktura beta kartki.

przedstawia w pełni rozciągnięte łańcuchy polipeptydowe połączone wiązaniami wodorowymi między sąsadującyi łańuchami

Takie rówoległe łąńcuchy mogą pochodzić z dwóch różnych połipetydów lub z z dwóch rosiadujących regionów tego samego peptydu (intermoleluma i intramolekulame

zwrot beta

krótkie segmenty łańcucha polipep co pozwala na zmianę kierunku, za te zmiany kirunku są odpowiedzalnne strugkury wstęga zwrot wstęga (=zwrot beata) co reszty i grupy NH reszty i+3 ich częste występowanie zozwala przybrać cząstecze zwartą trójwymiarową strukurę

pętle omega

odpowiadają za kierunek zwrotu łąńcucha w odróżnieu od wcześniej omówionych nie maja regularnej okresowej struktury, są czsto struktury sztywne i ściśle określone, zwroty beta i pętle omega zawsze znajdują się na powieszchni białka domeny białkowe