Ściana komórkowa bakterii gramdodatnich jest stosunkowo gruba i względnie jednorodna. Zawiera kilkadziesiąt warstw peptydoglikanu. W ich ścianie występują ponadto kwasy tejchojowe, lipotejchojowe i białka.
Ściana bakterii gramujemnych jest cienka i ma budowę wielowarstwową. Jedną do trzech warstw peptydoglikanu pokrywa błona zewnętrzna -dominujący u nich element. Peptydoglikan oddzielony jest od błony zewnętrznej przestrzenią peryplazmatyczną. Błona zewnętrzna stanowi warstwę plastyczną ściany komórkowej; zbudowana jest z fosfolipidów, białek, lipoproteiny Brauna oraz lipopolisacharydu (LPS).
Rzęski są elementami budowy niektórych bakterii, zwłaszcza cylindrycznych, które dzięki nim wykazują w środowisku płynnym lub półpłynnym, a nawet w cienkiej warstwie cieczy na podłożu stałym, zdolność poruszania się. Są to nitkowate wyrostki jednym końcem zaczepione w błonie cytoplazmatycznej i łączące się z cytoplazmą. Rzęski mają kształt lekko skręconej spirali i składają się z helikalnie zwiniętych cząsteczek białka zwanego flageliną. W komórkach bakterii występuje najczęściej jeden z trzech typów urzęsienia: monotrichalny - jedna rzęska na biegunie, lofotrichalny - pojedyncza rzęska lub ich pęczek na obu biegunach, perytrichalny - wiele rzęsek dookoła komórki. Ruch krętków warunkuje włókno osiowe, które składa się z pęczka włókienek przypominających budową rzęski. Wyrastają one z bieguna komórki i tworząc włókno osiowe spiralnie ją oplatają.
Rzęski można oglądać w mikroskopie elektronowym lub po odpowiednim wybarwieniu w zwykłym mikroskopie świetlnym. Barwienie rzęsek jest jednak trudne i kłopotliwe.
Fimbrie są włókien ko waty mi powierzchniowymi strukturami niektórych komórek bakteryjnej. Spotykamy je przede wszystkim u bakterii gramujemnych. Są liczne i występują na całej powierzchni komórki. Są cieńsze i krótsze niż rzęski. Widoczne są tylko w mikroskopie elektronowym. Odmianą fimbrii są sztywne wyrostki zawierające kanał dla transportu DNA w procesie koniugacji - noszą one nazwę fimbrii płciowych (pili). Jedna komórka wytworzyć może tylko jeden pilus.