6703851771

Centrum Nauk Biologiczno-Chemicznych Uniwersytetu Warszawskiego

Zespół dr Anny Karnkowskiej z Zakładu Filogenetyki Molekularnej i Ewolucji poszukuje magistrantów w ramach EMBO Installation Grant Evolution of phototrophy in eukaryotes

Proponujemy trzy tematy prac magisterskich dotyczące ewolucji i ekologii mikroorganizmów eukariotycznych:

1.    Występowanie i ewolucja rodopsyn typu I u mikroorganizmów eukariotycznych

W ramach tego projektu planujemy analizę amplikonów 18S rDNA, amplikonów rodopsynowych oraz metatranskryptomów z prób terenowych pobranych z wód słodkich oraz analizę funkcjonalną badanych rodopsyn in situ.

Zalecana jest znajomość powszechnie stosowanych technik genetyki molekularnej. Mile widziany licencjat z dziedziny biologii molekularnej lub genetyki oraz chęć pracy przy komputerze.

2.    Analiza funkcjonalna in silico rodopsyn typu I

W ramach tego projektu planujemy opracowanie model predykcyjnego, umożliwiającego korelowanie sekwencji białkowych rodopsyn typu I z ich maksimami absorpcji, na podstawie danych dostępnych w publicznych repozytoriach.

Zalecana jest znajomość podstaw programowania (Python, R lub inny język skryptowy). Mile widziane doświadczenie w pracy bioinformatycznej.

3.    Ewolucja plastydów i genomów plastydowych wtórnie bezbarwnych euglenin

W ramach projektu zostanie wykonane sekwencjonowanie i złożenie genomów plastydowych oraz transkryptomów dwóch wtórnie niefotosyntetyzujących gatunków. Zaobserwowane w nich zmiany ewolucyjne zostaną następnie porównane z gatunkami zarówno fotosyntetycznymi, jak i innymi wtórnie bezbarwnymi.

Zalecana jest znajomość podstawowych technik genetyki molekularnej. Mile widziane umiejętności hodowli mikroorganizmów na podłożach płynnych oraz chęć pracy zarówno w laboratorium jak i przy komputerze.

Oferujemy

Dla magistrantów przewidziane jest wynagrodzenie. Oferujemy również możliwość prezentacji wyników na zagranicznych konferencjach i udział we współpracach międzynarodowych, a także przyjazną, koleżeńską atmosferę oraz wsparcie ze strony młodego, dynamicznie rozwijającego się zespołu biologów i bioinformatyków.

Zgłoszenia

Nabór trwa w trybie ciągłym do czasu wyłonienia odpowiednich kandydatów, ostateczny termin przesyłania zgłoszeń przypada na 23 września 2019. Rozpoczęcie projektu od października 2019 r. W momencie przesyłania zgłoszenia nie jest wymagane ukończenie studiów licencjackich, ale będzie ono wymagane w momencie rozpoczęcia projektu.

Wszelkie pytania oraz zgłoszenia wraz z krótkim opisem zainteresowań naukowych prosimy przesyłać na adres mailowy kierownika projektu [e-mail].