IV. Część Czwarta (Dowodzenie istnienia Boga)
Bóg istnieje ze względu na to. ze wiemy ze istnieje. Należy przyjąć zasadę Myślę wiec jestem gdyż jest ona jako jedyna na początku metody niezachwiana i pewna. Można przyjąć, że rzeczy które pojmuje się za jasne i wyraźne istnieją przy czym należy bardzo dokładnie określić co znaczy jasne i wyraźne.
Można wyobrazić sobie cos co jest mniej doskonale od siebie, mimo Iz niekoniecznie musi to istnieć. Nie można jednak tego samego sądzić o idei istoty doskonalszej od siebie, ponieważ wyobrażenia o czymś doskonalszym nie można stworzyć samemu, musi być ono dane z góry. Rzecz doskonała nie może pochodzić od rzeczy mniej doskonalej stad wizja boga w człowieku musi być dana właśnie od Boga jako istoty doskonalej.
To samo tyczy się duszy, która jednak nie może być poznana przez człowieka na poziomie zmysłowym, bo na takim nie istnieje. Nie można poznać duszy zmysłami, to tak jak chciałoby się cos zobaczyć zmysłem smaku.
V. Część Piąta (Fizyka i dusza ludzka i zwierzęca)
Piąta cześć Rozprawy o Metodzie Kartezjusz poświęcił na badanie zagadnie z fizyki a w szczególności, mchom serca. Starał się tez wyjaśnić różnice miedzy dusza ludzka dusza zwierzęcia. Kartezjusz uważa ze zwierzęta to maszyny a tym co odróżnia je od człowieka to brak umiejętności myślenia. Dusza rozumna (człowiecza) nie wywodzi się z materii i z takowej nie jest stworzona. Dusza nie jest tylko włożona w ciało aby nim sterowała, ale również sprzęga się z nim w pewien sposób, zachowując jednak autonomiezność. gdyż nie umiera po śmierci ciała.
VI. Część Szósta (Badania przyrody i świata)
W badaniach nad czymkolwiek, a w szczególności nad wszelkimi prawami przyrody należy trzymać się pewnego porządku:
L Znalezienie ogólnej zasady, czyli pierwszej przyczyny wszystkiego tego co jest. lub tego co może być na świście, nie biorąc dla tego celu pod rozwagę nic ponad samego Boga. oraz wysnuwając je z pewnych zaczątków prawd, które naturalna droga znajdują się w naszych duszach.
2 Badanie pierwszych i najzwyklejszych skutków tych zasad i przyczyn (na tej drodze Kartezjusz znalazł niebo, gwiazdy, ziemie).
3. Przejście do rzeczy bardziej szczegółowych (co nie udało się Kartezjuszowi ze względu na ich mnogość), i dopasowanie ich od odpowiednich kategorii i zasad.
Prawda jest ze każdy człowiek powinien działać dla dobra ludzkości i potomnych, w miarę swoich możliwości
poznawczych, z tymże należy bardziej myśleć o przyszłych pokoleniach niż o sobie współczesnych.
2