ÿþs
w i c z e n i e n r 3 . M i k r o b i o l o g i a o g ó l n a i d e n t y f i k o w a n i e b a k t e r i i n a p o d s t a w i e i c h c e c h
b i o c h e m i c z n y c h i a n t y g e n o w y c h . O z n a c z a n i e w r a |l i w o [c i b a k t e r i i n a l e k i .
I d e n t y f i k a c j a b a k t e r i i u s t a l e n i e r o d z a j u , g a t u n k u , o d m i a n y l u b t y p u w o b r b i e
w y i z o l o w a n e g o d r o b n o u s t r o j u .
M e t o d y i d e n t y f i k a c j i :
" O c e n a w Ba [c i w o [c i b i o c h e m i c z n y c h
" M e t o d y i m m u n o l o g i c z n e
" M e t o d y m o l e k u l a r n e
O c e n a w Ba [c i w o [c i b i o c h e m i c z n y c h
P o l e g a n a w y k o r z y s t a n i u r ó |n i c w a k t y w n o [c i e n z y m a t y c z n e j m i d z y p o s z c z e g ó l n y m i
g a t u n k a m i b a k t e r i i . O k r e [l o n a a k t y w n o [ e n z y m a t y c z n a j e s t n a o g ó B c e c h s t a B. A k t y w n o [ t a
j e s t n a j c z [c i e j o c e n i a n a p o p r z e z w y k r y w a n i e k o Dc o w y c h p r o d u k t ó w m e t a b o l i z m u d a n e g o
z w i z k u . B a d a n i a t e m o |n a w y k o n y w a p o u z y s k a n i u c z y s t e j h o d o w l i b a d a n e g o
d r o b n o u s t r o j u . ( p o s i e w r e d u k c y j n y )
s u b s t r a t - - - - - - e n z y m - - - - - - - p r o d u k t
O z n a c z a s i w Ba [c i w o [c i b i o c h e m i c z n y c h p o l e g a n a o c e n i e :
" w Ba [c i w o [c i s a c h a r o l i t y c z n y c h
" w Ba [c i w o [c i z w i z a n y c h z m e t a b o l i z m e m a z o t o w y m
" w Ba [c i w o [c i h e m o l i t y c z n y c h
" w Ba [c i w o [c i l i p o l i t y c z n y c h
" p r o d u k c j i k a t a l a z y
" w y s t p o w a n i e f o s f a t a z y
1 . Z e s t a w y d o b i o c h e m i c z n e j i d e n t y f i k a c j i b a k t e r i i t o M e t o d y s z y b k i e j i d e n t y f i k a c j i
b a k t e r i i t e s t A P I
2 . M e t o d y i m m u n o l o g i c z n e w y k r y w a n i e a n t y g e n ó w l u b p r z e c i w c i a B
3 . M e t o d y m o l e k u l a r n e
A n t y b i o t y k i - D r o b n o c z s t e c z k o w e s u b s t a n c j e , k t ó r e d z i a Ba j p r z e c i w d r o b n o u s t r o j o w o ,
z a b i j a j l u b h a m u j r o z m n a |a n i e k o m ó r e k d r o b n o u s t r o j ó w .
N a p o c z t k u z a a n t y b i o t y k i u w a |a n o s u b s t a n c j e p o c h o d z e n i a n a t u r a l n e g o w y k a z u j c e a k t y w n o [
p r z e c i w b a k t e r y j n . O b e c n i e c h e m i o t e r a p e u t y k i ( s u b s t a n c j e w y t w o r z o n e p r z e z c z Bo w i e k a
m e t o d a m i c h e m i c z n y m i ) u z n a w a n e s r ó w n i e | z a a n t y b i o t y k i .
P o d z i a B z e w z g l d u n a p o c h o d z e n i e
- N a t u r a l n e
- P ó Bs y s n e t y c z n e
- S y n t e t y c z n e
- C h e m i o t e r a p e u t y k i
P o d z i a B z e w z g l d u n a m e c h a n i z m d z i a Ba n i a
M e c h a n i z m d z i a Ba n i a a n t y b i o t y k ó w
M e c h a n i z m d z i a Ba n i a M i e j s c e d o c e l o w e a n t y b i o t y k i
H a m o w a n i e s y n t e z y P B P ( b i a Bk a w i |c e p e n i c y l i n ) m a j p o w i n o w a c t w o d o ’ - l a k t a m y
[c i a n y k o m ó r k o w e j p e n i c y l i n y i i n n y c h a n t y b i o t y k ó w ²- l a k t a m o w y c h ( g Bó w n i e
t r a n s p e p t y d a z y i k a r b o k s y p e p t y d a z y )
K o Dc e d i p e p t y d o w e p o d s t a w o w e j c e g i e Bk i p e p t y d o g l i k a n u , Bc z c e g l i k o p e p t y d y
s i z i n n y m i e l e m e n t a m i [c i a n y k o m ó r k o w e j . H a m o w a n i e
p o l i m e r y z a c j i
H a m o w a n i e s y n t e z y P o d j e d n o s t k a 3 0 S r y b o s o m u t e t r a c y k l i n y
b i a Bk a
P o d j e d n o s t k a 5 0 S r y b o s o m u M a k r o l i d y
k l i n d a m y c y n a
P o d j e d n o s t k a 3 0 S r y b o s o m u a m i n o g l i k o z y d y
P o d j e d n o s t k a 5 0 S r y b o s o m u c h l o r a m f e i k o l
P o d j e d n o s t k a 5 0 S l i n e z o l i d
S y n t e t a z a t R N A - i z o l e u c y n y ( e n z y m w i |c y i z o l e u c y n z t R N A m u p i r o c y n a
H a m o w a n i e s y n t e z y G y r a z a D N A , T o p o i z o m e r a z a I V c h i n o l o n y
D N m o w a n i e s y n t e z y D N A - z a l e |n a p o l i m e r a z a R N A
A
H a r y f a m p i c y n a
R N A
N i s z c z e n i e b Bo n y L i p i d y b Bo n y c y t o p l a z m a t y c z n e j i z e w n t r z n e j P o l i p e p t y d y
z e w n t r z n e j i ( p o l i m y k s y n A -
c y t o p l a z m a t y c z n e j E )
d a p t o m y c y n a
H a m o w a n i e s y n t e z y E n z y m y u c z e s t n i c z c e w s y n t e z i e k w a s u f o l i o w e g o S u l f o n a m i d y
n u k l e o t y d ó w
T r i m e t o p r i m
P o d z i a B z e w z g l d u n a z a k r e s d z i a Ba n i a
- w s k o w i d m o w e d z i a Ba j n a w y b r a n g r u p d r o b n o u s t r o j ó w n p . t y l k o n a b a k t e r i e t l e n o w e
- s z e r o k o w i d m o w e o b e j m u j s w o i m s p e k t r u m k i l k a g r u p d r o b n o u s t r o j ó w t l e n o w e , b e z t l e n o w e ,
G r a m - d o d a t n i e , G r a m - u j e m n e
A n t y b i o t y k i o d z i a Ba n i u b a k t e r i o s t a t y c z n y m
G r u p a S p e k t r u m d z i a Ba n i a
a n t y b i o t y k ó w
m a k r o l i d y i " D z i a Ba j p r z e d e w s z y s t k i m n a b a k t e r i e G r a m - d o d a t n i e t l e n o w e i
k e t o l i d y b e z t l e n o w e
" D u |e z n a c z e n i e k l i n i c z n e m a i c h a k t y w n o [ w o b e c b a k t e r i i
w e w n t r z k o m ó r k o w y c h , t a k i c h j a k M y c o p l a s m a , C h l a m y d i a i
L e g i o n e l l a ( b a k t e r i e a t y p o w e )
" W m n i e j s z y m s t o p n i u n a b a k t e r i e G r a m - u j e m n e w t y m t l e n o w e i
b e z t l e n o w e p a Be c z k i o r a z N e i s s e r i a i M o r a x e l l a
l i n k o z a m i d y " B a k t e r i e G r a m - d o d a t n i e
" B a k t e r i e b e z t l e n o w e
c h l o r a m f e n i k o l B a k t e r i e G r a m - d o d a t n i e
B a k t e r i e G r a m - u j e m n e
K r t k i
R i k e t s j e
C h l a m y d i e
m y k o p l a z m y
T e t r a c y k l i n y M a j s z e r o k i e s p e k t r u m d z i a Ba n i a ( b a k t e r i e t l e n o w e i b e z t l e n o w e ) :
t i g e c y k l i n a B a k t e r i e G r a m - d o d a t n i e
B a k t e r i e G r a m - u j e m n e
K r t k i
B a k t e r i e a t y p o w e
s u l f o n a m i d y D z i a Ba j n a :
G r o n k o w c e
k o t r i m o k s a z o l P a c i o r k o w c e
E n t e r o b a c t e r i a c e a e
o k s a z o l i d y n o n y b a k t e r i e G r a m - d o d a t n i e
A n t y b i o t y k i d z i a Ba j c e b a k t e i o b ó j c z o
G r u p a S p e k t r u m d z i a Ba n i a
a n t y b i o t y k ó w
’- l a k t a m y Z i a r n i a k i G r a m - d o d a t n i e
Z i a r n i a k i G r a m - u j e m n e
P a Be c z k i G r a m - u j e m e n e ( E n t e r o b a c t e r i a c e a e ,
n i e f e r m e n t u j c e , h e m o f i l n e )
L a s e c z k i G r a m - d o d a t n i e
P a Be c z k i G r a m - d o d a t n i e
K r t k i
P r o m i e n i o w c e
c h i n o l o n y P a Be c z k i G r a m - u j e m n e f e r m e n t u j c e i n i e f e r m e n t u j c e
G r o n k o w c e ( s z y b k o n a b y w a j o p o r n o [! )
P a c i o r k o w c e
E n t e r o k o k i
H a e m o p h i l u s
N e i s s e r i a
B a k t e r i e a t y p o w e
a m i n o g l i k o z y d y D z i a Ba j t y l k o n a b a k t e r i e t l e n o w e :
P a Be c z k i G r a m - u j e m n e
Z i a r n i a k i G r a m - d o d a t n i e
P r t k i g r u zl i c y
g l i k o p e p t y d y D z i a Ba j t y l k o n a b a k t e r i e G r a m - d o d a t n i e t l e n o w e i
b e z t l e n o w e
p o l i p e p t y d y B a c y t r a c y n a d z i a Ba n a b a k t e r i e G r a m - d o d a t n i e
G r a m i c y d y n a d z i a Ba w y Bc z n i e n a b a k t e r i e G r a m -
d o d a t n i e
Z a k r e s d z i a Ba n i a : p a Be c z k i G r a m - u j e m n e f e r m e n t u j c e
i n i e f e r m e n t u j c e
n i t r o i m i d a z o l e D z i a Ba j t y l k o n a b a k t e r i e b e z t l e n o w e
n i t r o f u r a n y B a k t e r i e G r a m - d o d a t n i e
B a k t e r i e G r a m - u j e m n e
S t o s o w a n e w l e c z e n i u z a k a |e D u k Ba d u m o c z o w e g o
" T e r a p i a e m p i r y c z n a o p a r t a j e s t n a d o m n i e m a n i u n a j b a r d z i e j p r a w d o p o d o b n e g o c z y n n i k a
e t i o l o g i c z n e g o z a k a |e n i a i j e g o p r z y p u s z c z a l n e j w r a |l i w o [c i n a a n t y b i o t y k i . E m p i r y c z n y d o b ó r
l e k u m u s i b y o p a r t y n a a n a l i z i e w y n i k ó w b a d a D k l i n i c z n y c h i l o k a l n y c h d a n y c h
e p i d e m i o l o g i c z n y c h .
" T e r a p i a c e l o w a n a j e s t m e t o d , w k t ó r e j w y b o r u a n t y b i o t y k u d o k o n u j e s i p o p o t w i e r d z e n i u w
b a d a n i u m i k r o b i o l o g i c z n y m a k t y w n o [c i l e k u i n v i t r o w o b e c w y i z o l o w a n e g o c z y n n i k a
e t i o l o g i c z n e g o z a k a |e n i a ( a n t y b i o g r a m ) .
T e r a p i a c e l o w a n a = t r a f i e n i e w p a t o g e n
" L e c z e n i e p i e r w s z e g o r z u t u ( l e c z e n i e p o c z t k o w e ) p o l e g a n a z a s t o s o w a n i u a n t y b i o t y k u o
u d o w o d n i o n e j s k u t e c z n o [c i i b e z p i e c z e Ds t w i e .
O c e n a a k t y w n o [c i p r z e c i w b a k t e r y j n e j
A n t y b i o g r a m W y n i k b a d a n i a w r a |l i w o [c i d a n e g o d r o b n o u s t r o j u n a d z i a Ba n i e a n t y b i o t y k ó w .
M e t o d y o z n a c z a n i a l e k o w r a |l i o w [c i d r o b n o u s t r o j ó w
J a k o [c i o w a
" D y f u z y j n o - k r |k o w a
I l o [c i o w a
" S e r y j n y c h r o z c i e Dc z e D
" E - t e s t
P ó Bi l o [c i o w a
1 . M e t o d a d y f u z y j n o - k r |k o w a
O p a r t a j e s t n a d y f u z j i a n t y b i o t y k u z a w a r t e g o w k r |k u d o p o d Bo |a . A n t y b i o t y k d y f u n d u j e
p r o m i e n i [c i e , t w o r z c g r a d i e n t s t |e D. N a j w i k s z a j e g o k o n c e n t r a c j a w y s t p u j e p r z y b r z e g a c h
k r |k a i s p a d a w r a z z o d l e g Bo [c i o d k r |k a . W i e l k o [ s t r e f y z a h a m o w a n i a w z r o s t u b a k t e r i i j e s t
w p r o s t p r o p o r c j o n a l n a d o s t o p n i a w r a |l i w o [c i b a k t e r i i n a a n t y b i o t y k - i m w i k s z a j e s t s t r e f a
z a h a m o w a n i a , t y m b a k t e r i a j e s t b a r d z i e j w r a |l i w a . W z a l e |n o [c i o d w i e l k o [c i s t r e f y , b a k t e r i e
o k r e [l a s i , j a k o : w r a |l i w e , [r e d n i o w r a |l i w e l u b o p o r n e n a p o d s t a w i e p r z y j t y c h s t a n d a r d ó w
( r e k o m e n d a c j e ) .
W r a |l i w y S w r a |l i w o [ d r o b n o u s t r o j u n a s t a n d a r d o w e d a w k i l e k u , w y s o k i e
p r a w d o p o d o b i e Ds t w o s u k c e s u k l i n i c z n e g o
Zr e d n i o w r a |l i w y I s z c z e p y w z a k r e s i e M I C p o m i d z y w r a |l i w y m a o p o r n y m , s u k c e s
t e r a p e u t y c z n y n i e p e w n y , m o |e b y o s i g n i t y , g d y l e k j e s t z a g s z c z a n y ( n p . w d r o g a c h
m o c z o w y c h ) l u b m o |e b y s t o s o w a n y w w i k s z e j d a w c e ( n p . p r z y n i s k i e j t o k s y c z n o [c i )
O p o r n y R w y s o k i e p r a w d o p o d o b i e Ds t w o n i e p o w o d z e n i a t e r a p e u t y c z n e g o , n i e z a l e |n i e o d
d a w k i l e k u i l o k a l i z a c j i i n f e k c j i
2 . M e t o d a s e r y j n y c h r o z c i e Dc z e D
p o z w a l a j n a o k r e [l e n i e m i n i m a l n e g o s t |e n i a a n t y b i o t y k u ( M I C m i n i m u m i n h i b i t o r y
c o n c e t r a t i o n ) h a m u j c e g o w z r o s t b a k t e r i i . S e r y j n e r o z c i e Dc z e n i a a n t y b i o t y k u p r z y g o t o w u j e s i w
p o d Bo |u p By n n y m l u b p o d Bo |u a g a r o w y m , d o k t ó r y c h n a s t p n i e d o d a j e s i o d p o w i e d n i e i n o c u l u m
i i n k u b u j e . M e t o d y p r a c o c h Bo n n e , w y k o r z y s t y w a n e g Bó w n i e w b a d a n i a c h n a u k o w y c h .
3 . E - t e s t
" Bc z y d y f u z j a n t y b i o t y k u w a g a r z e i i l o [c i o w e o k r e [l e n i e s t |e n i a h a m u j c e g o M I C .
W y k o r z y s t u j e s i p a s k i n a s y c o n e a n t y b i o t y k i e m w g r a d i e n c i e s t |e D.
M B C ( m i n i m a l b a c t e r i o c i d a l a c t i v i t y ) n a j m n i e j s z e s t |e n i e b a k t e r i b ó j c z e
M I C ( m i n i m a l i n h i b i t o r y c o n c e n t r a t i o n ) n a j m n i e j s z e s t |e n i e h a m u j c e
M e c h a n i z m y o p o r n o [c i
O p o r n o [ s t a n , w k t ó r y m a n t y b i o t y k n i e d z i a Ba p r z e c i w d r o b n o u s t r o j o w o ( n i e z a b i j a a n i n i e
h a m u j e n a m n a |a n i a ) . T a k i s z c z e p b a k t e r y j n y j e s t o p o r n y n a d a n y a n t y b i o t y k . L e c z e n i e t a k i m
a n t y b i o t y k i e m j e s t n i e s k u t e c z n e .
N a t u r a l n a ( p i e r w o t n a ) u w a r u n k o w a n a g e n e t y c z n i e n i e w r a |l i w o [ p e w n y c h g a t u n k ó w ,
r o d z a j ó w l u b g r u p b a k t e r i i n a d a n y a n t y b i o t y k . J e s t t o c e c h a s t a Ba b a k t e r i i , k t ó r a b y Ba o b e c n a
j e s z c z e p r z e d o d k r y c i e m i z a s t o s o w a n i e m a n t y b i o t y k ó w .
N a b y t a p o j a w i e n i e s i n i e r w a |l i w o [c i n a d a n y a n t y b i o t y k b a k t e r i i u p r z e d n i o w r a |l i w e j .
P o j a w i a s i w w y n i k u m u t a c j i l u b p r z e n i e s i e n i a g e n ó w o p o r n o [c i z j e d n e j k o m ó r k i b a k t e r y j n e j
d o d r u g i e j . M a t e r i a B g e n e t y c z n y z a w i e r a j c y g e n y o p o r n o [c i m o |e b y p r z e n o s z o n y p o m i d z y
k o m ó r k a m i d r o b n o u s t r o j ó w o d l e g By c h s y s t e m a t y c z n i e .
O p o r n o [ k r z y |o w a r o z w ó j o p o r n o [c i n a j e d e n a n t y b i o t y k p o c i g a z a s o b o p o r n o [ n a
a n t y b i o t y k i t e j s a m e j g r u p y
O p o r n o [ n a a n t y b i o t y k i - s p o s o b y n a b y w a n i a o p o r n o [c i
M u t a c j a p i e r w o t n e z j a w i s k o p r o w a d z c e d o p o w s t a n i a o p o r n o [c i .
M u t a c j e s p o n t a n i c z n e - z a c h o d z s a m o r z u t n i e , n i e z a l e |n i e o d o b e c n o [c i a n t y b i o t y k u w
[r o d o w i s k u . S t o b Bd y p o d c z a s r e p l i k a c j i D N A .
M u t a c j e i n d u k o w a n e p o j a w i a j s i p o z a d z i a Ba n i u m u t a g e n ó w w w a r u n k a c h n a t u r a l n y c h
z a c h o d z i n i e z w y k l e r z a d k o .
S e l e k c j a u t r w a l e n i e m u t a c j i . K o m ó r k i , k t ó r e u l e g By m u t a c j i p r o w a d z c e j d o p o w s t a n i a
o p o r n o [c i n a a n t y b i o t y k o b e c n y w [r o d o w i s k u , p r z e |y w a j w o b e c n o [c i t e g o a n t y b i o t y k u i s t a j
s i p o c z t k i e m p o p u l a c j i o p o r n e j .
L o k a l i z a c j a g e n ó w o p o r n o [c i
" C h r o m o s o m y o p o r n o [ c h r o m o s o m a l n a
" P l a z m i d y o p o r n o [ p l a z m i d o w a
" T r a n s p o z o n y
" I n t e g r o n y
S p o s o b y p r z e n o s z e n i a o p o r n o [c i
" P i o n o w e ( w e r t y k a l n e ) z k o m ó r k i m a c i e r z y s t e j d o k o m ó r k i p o t o m n e j
" P o z i o m e ( h o r y z o n t a l n e ) p r z e n o s z e n i e z j e d n e j k o m ó r k i b a k t e r y j n e j d o i n n e j ( r ó w n i e |
i n n y c h g a t u n k ó w ) g e n ó w o p o r n o [c i z l o k a l i z o w a n y c h n a , n a d r o d z e :
"
- k o n i u g a c j i - w y m i a n a m a t e r i a Bu g e n e t y c z n e g o p o m i d z y k o m ó r k m s k a
|e Ds k ( t e g o s a m e g o g a t u n k u )
- t r a n s d u k c j i p r z e n o s z e n i e m a t e r i a Bu g e n e t y c z n e g o p o m i d z y k o m ó r k a m i
b a k t e r i i ( t e g o s a m e g o g a t u n k u , a n a w e t s z c z e p u ) z a p o [r e d n i c t w e m b a k t e r i o f a g ó w .
- t r a n s f o r m a c j i b e z p o [r e d n i e p o b i e r a n i e m a t e r i a Bu g e n e t y c z n e g o z e
[r o d o w i s k a . M a t e r i a B g e n e t y c z n y w p o b i e r a n y d o s t a j e s i d o [r o d o w i s k a n a s k u t e k [m i e r c i
k o m ó r k i l u b j e j r o z p a d u . W t e n s p o s ó b m o g b y p o b i e r a n e g e n y o p o r n o [c i o d i n n y c h g a t u n k ó w
d r o b n o u s t r o j ó w .
F l o r a f i z j o l o g i c z n a s t a n o w i r e z e r w u a r g e n ó w o p o r n o [c i d l a d r o b n o u s t r o j ó w p a t o g e n n y c h
{y c z y m y o w o c n e j n a u k i