2. Proste powst. nukleotydów
3. Integracja fragmentów T z genomem rośliny
Oprócz tego:
• geny wirulencji
• geny katabolizmu opin
Geny fragmentów T są zaopatrzone w sekwencje rozpoznawane przez czynniki transkrypcyjne roślin: TATA - sygnał rozpoczęcia transkrypcji; AATAAA - sygnał terminacji i poliadenylacji.
Opiny są źródłem C i N dla bakterii, żyjących w przestrzeniach międzykom. Rodzaj wytwarzanej opiny jest podstawą klasyfikacji szczepów A. tumefaciens. Przykładowe opiny: oktopina. nopalina. leucynopina. agropina.
Geny wirulencji (24 geny wir. ułożone w 8 operonach)
• wytworzenie celulozowych włókien mocujących kom. bakteryjną do ściany komórki roślinnej
• białka błonowe tworzące kanały (pilusy) umożliwiające przeniesienie T - DNA przez ścianę i błonę cytoplazmatyczną komórki roślinnej (vir B)
• czynniki wycinające odcinek T (vir D)
• białka chroniące i transportujące odcinek T (vir C i vir E)
• białka neutralizujące związki roślinne utrudniające rozwój guzów (vir F i vir H)