1. Elementy składowe makrocząsteczek:
• Aminokwasy jako składniki białek
• Aminokwasy kwaśne i zasadowe i mostki solne
• Aminokwasy siarkowe i mostki siarkowe
• Nukleotydy jako składniki kwasów nukleinowych
• Wiązanie peptydowe, fosfodiestrowe i wodorowe
2. Podstawowe struktury drugorzędowe białek wg Paulinga (arkusz; helisa) i motywy strukturalne: heliks-pętla-heliks, heliks-zwrot-heliks suwaki leucynowe, palec cynkowy, „szpilki do włosów” (ang. harpin loop) - spinka, motyw „klucza greckiego", motyw
3. Degradacja białek- znaczenie rodzaju aminokwasu N-końcowego na okres półtrwania białka, ubikwityna; kaskada ubikwitynacji; struktura i funkcja proteasomu http://bioinfo.mol.uj.edu.pl/articles/Zieba04
4. Cykl Komórkowy (regulacja aktywności CDK [kinaz zależnych od cyklin]; stopień ufosforylowania, a aktywność katalityczna na przykładzie kompleksu cyklina-CDK; rola białek kieszeniowych w cyklu komórkowym.
5. Geny RET i MET (receptory o aktywności kinazy)- jako przykłady proonkogenów
6. Podstawowe systemy naprawy DNA
1. Metody amplifikacji DNA:
• klonowanie w wektorach
• typy wektorów
• PCR
• elektroforeza w żelu
• ASA-PCR
• Multiplex-PCR
• Long-PCR
2. Amplifikacja RNA
• RT-PCR
3. Mutacje
• mutageny i ich rodzaje (chemiczne, fizyczne, biologiczne)
• powstawanie mutacji (spontaniczne, indukowane; konstytucyjne, de novo; genowe, chromosomowe, genomowe)
• lokalizacja mutacji (rodzaje komórek: somatczne, germinalne) i ich znaczenie
• rodzaje mutacji (delecje, insercje, subtytucje: tranzycje, transwersje)
• efekty na poziomie białka (missens, nonsens, z i bez przesunięcia ramki odczytu)
• mutacje a polimorfizmy
4. Techniki wykrywania mutacji
• oparte na PCR
• oparte na hybrydyzacji
5. Eznymy restrykcyjne
• typy enz. restrykcyjnych
• zasada dziełania
• aktywność STAR
6. Techniki przesiewowe wykrywania zmian w genach
1