2000 r. - ustanowienie dnia 6 listopada Dniem Pamięci (obchodzony dla uczczenia pamięci profesorów i innych
członków społeczności akademickiej aresztowanych w 1939 r. przez okupanta niemieckiego, a także pamięci wszystkich zmarłych pracowników Uczelni)
2000 r. - oddanie do użytku nadbudowanej kondygnacji i poddasza budynku „Ustronie”
2000 r. - rozpoczęcie wznoszenia budynku przyszłego Wydziału Finansów
2001 r. - oddanie do użytku poddasza Budynku Głównego
2001 r. - powrót do rekrutacji na kierunki studiów; zniesienie studium podstawowego
2001 r. - wznowienie jednolitych studiów magisterskich na kierunku Towaroznawstwo
2002 r. - zakończenie prac remontowo-modemizacyjnych i oddanie do użytku budynku „Księżówka”
2002 r. - utworzenie Wydziału Finansów
2003 r. - uzyskanie przez Wydział Finansów uprawnień do nadawania stopnia naukowego doktora w zakresie ekonomii 2003 r. - wizyta Prezydenta RP Aleksandra Kwaśniewskiego i Marszałka Sejmu RP Marka Borowskiego
2003 r. - otrzymanie od władz samorządowych Dębicy nieruchomości obejmujących dawne koszary wojskowe
i utworzenie w nich Zamiejscowego Ośrodka Dydaktycznego Akademii
2004 r. - Akademia Ekonomiczna w Krakowie laureatem srebrnego medalu „Cracoviae Merenti”, za szczególne zasługi
dla Stołecznego Królewskiego Miasta Krakowa
2004 r. - pierwsza na Uczelni akredytacja przez Państwową Komisję Akredytacyjną (kierunek Zarządzanie i marketing) 2004 r. - oddanie do użytku pawilonu F
2004 r. - wizyta Prezydenta RP Aleksandra Kwaśniewskiego i Marszałka Sejmu RP Józefa Oleksego 2004 r. - otwarcie Muzeum Akademii Ekonomicznej w Krakowie oraz nowej sali posiedzeń Senatu AE
2004 r. - nadanie Akademii przez Prezydenta Miasta Krakowa tytułu Mecenasa Kultury roku 2003 za wkład finansowy
w rozwój kultury w Krakowie
2005 r. - uroczyste obchody 80-lecia Uczelni m.in. odsłonięcie pamiątkowych tablic rektorów Uczelni i doktorów
honoris causa
2005 r. - uzyskanie przez Wydział Finansów uprawnień do nadawania stopnia naukowego doktora habilitowanego
2006 r. - rozpoczęcie wydawania miesięcznika „Kurier AE”
2006 r. - wprowadzenie studiów stacjonarnych pierwszego i drugiego stopnia w miejsce jednolitych studiów magisterskich
2006 r. - uruchomienie nowych kierunków: Europeistyka; Gospodarka i administracja publiczna
2007 r. - zmiana nazwy Uczelni z Akademii Ekonomicznej na Uniwersytet Ekonomiczny w Krakowie na mocy ustawy
z dnia 6.07.2007 r.
2007 r. - uruchomienie kierunku studiów Turystyka i rekreacja.
2007 r. - uzyskanie uprawnień przez Wydział Towaroznawstwa do nadawania stopnia naukowego doktora habilitowanego i występowania z wnioskami o tytuł naukowy profesora nauk ekonomicznych.
2007 r. - zmiana nazwy Szkoły Przedsiębiorczości i Zarządzania na Krakowską Szkołę Biznesu.
2008 r. - uruchomienie kierunków studiów: Międzynarodowe stosunki gospodarcze oraz Zarządzanie i inżynieria
produkcji