S Tępe końce: efekt przecięcia obu nici DNA w miejscach położonych
naprzeciwko siebie, co powoduje powstawanie krótkich fragmentów DNA nie będących komplementarnymi dla siebie.
pojedyncze kolonie po przeniesie hodowane w płynnej pożywce
2 Schemat klonowania DNA przy zastosowaniu wektora bakteryjnego
Tępe końce można
poddać odpowiednim modyfikacjom umożliwiając ich wykorzystanie w procesie
rekombinacji DNA.
Jedną z nich jest
dołączenie
cząsteczek
adaptorowych
bądź linkerów
(przed
dołączeniem
linkerów
niezbędna jest
metyzacja
genomowego
DNA dla ochrony
przed enzymem
restrykcyjnym używanym do wytwarzania lepkich końców po przyłączeniu linkerów)
Metoda elektroforezy posiadających ładunek związków organicznych uwzględnia ich różną szybkość w poruszaniu się w polu elektrycznym. Przeprowadza się ja umieszczając roztwór DNA w studzienkach wyciętych w agarozowym bloczku umieszczonym w płaskim naczyniu wypełnionym roztworem soli oraz posiadającym elektrody podłączone do źródła stałego prądu na przeciwległych brzegach. Fragmenty DNA wędrują do elektrod poruszając się w polu elektrycznym odpowiednio do swojej wielkości. Po zakończeniu procesu umieszcza się bloczek w roztworze barwiącym DNA, który wybarwia prążki cząsteczek DNA o określonej długości.
Ligaza DNA jako metoda łączenia ze sobą rozdzielonych nukleazami restrykcyjnymi fragmentów DNA (zarówno tych o lepkich, jak i tępych końcach).