Absolwenci studiów II stopnia mogę kontynuować naukę na studiach doktoranckich na wszystkich wydziałach, które sę objęte programem MISHiS:
■ Wydział Anglistyki
■ Wydział Filologii Polskiej i Klasycznej
■ Wydział Nauk Społecznych
■ Wydział Historyczny
■ Wydział Nauk Politycznych i Dziennikarstwa
■ Wydział Neofilologii
■ Wydział Prawa i Administracji
■ Wydział Studiów Edukacyjnych
■ Wydział Teologiczny
Studenci MISHiS maję prawo do uczęszczania i uzyskiwania zaliczeń na wszystkich zajęciach prowadzonych na kierunkach i specjalnościach funkcjonujęcych w ramach Programu MISHiS. Dzięki MISHiS możliwy jest szybszy start w karierze naukowej. Nasi studenci wiedzę o bieżęcych konferencjach, posiadaję więcej możliwości publikacji w pismach naukowych (tworzę też własne), a dzięki instytucji tutora maję kontakt z pracownikami naukowymi. Dla osób, które sę zainteresowane karierę naukowę, MISHiS jest wspaniałym przygotowaniem do pracy zawodowej. Wielu absolwentów studiów II stopnia w ramach MISHiS kontynuuje naukę na studiach III stopnia.