1. Kto pierwszy przedstawiÅ‚ koncepcje filogenezy w postaci drzewiastej i krzaczastej ?Jð
2. Autorzy pierwszych podejść algorytmicznych. (odp. Robert Sokal & Peter Sneath)
3. Było drzewo narysowane i jaki to typ (Odp. takson polifiletczny)
4. Był sobie zapis ((A,C),(B,D)); - co można z niego wywnioskować ? (odp. że taksony
siostrzane?)
5. Po co stosowane sa zimne i gorące łańcuchy? (odp. cos z wyznaczeniem obszaru w
przestrzeni Jð)
6. Co reprezentują wezły? (odp. tutaj trzeba tac odp. że wszystkie odpowiedzi prawidowe)
7. Zadanie otwarte: opisać miękką politomię.
8. zadanie otwarte: opisać metodę Branch and Bound w parsymoni.
9. Co można zastosować w NJ? (tu chodziło o metody: Jackknife i Bootstrap)
10. wskaż zdanie nieprawidłowe odnośnie kladogramu. (odp. kladogram ukośny pokazuje
więcej danych niż kladogram prostokątny)
11. Co jest potrzebne do ukorzenienia drzewa za pomocÄ… zegara molekularnego?
12. zadanie otwarte: opisać acctran
13. Co może obrazować zjawiska hybrydyzacji? (chodzi o retikulogram)
14. Wskazac nieprawdziwe zdanie o UPGMA. (nie pamiętam, ale chodziło coc o dane muszą
być po części zultrametyzowane)
15. Co to za model ewolucji:  frekwencje nukleotydów i są równe, ale tranzycie i trans wersje
wystepują w róznych proporcjach (Kimura 2 parametrowy)
16. Wielkość próbki dla bootstrap ( odp. 100% !!)
17. Co to za par symonia: zezwala na rewersje, wszystkie cechy uporzÄ…dkowane (odp
Wagnera)
18. cos w stylu: jakie cechy sa szkodliwe dla Maksymalnej Parsymoni (chodzi chyba o
homoplazje w LBA)
19. rozpoznaj jaka to metoda  Jakie jest prawdopodobieństwo P powstania danych D i tak
dalej i tak dalej Jð  (Odp. Maximum Likelihood)
20. Tutaj nie napiszę dokładnie tresci pytania, bo nie pamiętam, ale trzeba znać tą tabelkę ze
zdarzeniami ewolucyjnymi : Wikariancja, kospecjacja itp.
21. Sposób działania par symonii Brooksa. (tutaj ważne, czy drzewo pasożytów na
gospodarzach czy odwrotnie)