Inicjacja translacji u Eukariota

Mechanizm regulacji translacji mRNA

kodujących białka ATF4 i ATF5

Autoregulacja syntezy białek rybosomowych

w komórkach bakteryjnych

Rola struktury mRNA w inicjacji translacji

A. Komórki bakteryjne

B. Komórki eukariotyczne

Modulacja inicjacji translacji w komórkach eukariotycznych może być

związana z różnymi elementami struktury mRNA, takimi jak:

-Struktura czapeczki

-Pierwszorzędowa struktura otoczenia kodonu AUG – kontekst kodonu inicjującego

-Obecność uORF

-Drugorzędowa struktura występująca powyżej i poniżej kodonu AUG

-Długość sekwencji 5’UTR

-Występowanie specyficznych struktur –potencjalnych miejsc
wiązania białek represorowych lub miRNA

Mechanizm regulacji inicjacji translacji przy

udziale białek

wiążących się z sekwencją 5’ UTR

Mechanizm regulacji inicjacji translacji przy

udziale białek wiążących się z sekwencją 3’

UTR

Stabilność mRNA

Enzymy istotne w degradacji bakteryjnego

mRNA

Endonukleazy: RNaza E (ssRNA), RNaza III (dsRNA)

3’ → 5’ egzonukleazy – RNaza II (ssRNA), RNaza R,
fosforylaza polinukleotydowa (PNPaza),
oligorybonukleaza

Poli(A) polimeraza,

RNA pirofosfohydrolaza (RppH)

5’ → 3’ egzonukleazy – RNaza J

Szlak degradacji bakteryjnego

mRNA (I)

J.G. Belasco, Nat Rev Mol Cell Biol. 2010

Szlak degradacji bakteryjnego mRNA (II)

J.G. Belasco, Nat Rev Mol Cell Biol. 2010

Szlak degradacji bakteryjnego mRNA

zawierającego przedwczesny kodon

terminacyjny

PTC- ang. premature
termination codon

J.G. Belasco, Nat Rev Mol Cell Biol. 2010

Mechanizmy potranskrypcyjnej represji

genów przez ncRNA

w komórkach bakteryjnych

Biogeneza miRNA

Zasady oddziaływania miRNA - mRNA

Możliwe mechanizmy potranskrypcyjnej

represji genów przez miRNA w komórkach

zwierzęcych

Szlaki degradacji eukariotycznego mRNA

Mechanizmy rozpoznania i degradacji

uszkodzonego mRNA,

ang. mRNA-surveillance pathway

PTC- ang. premature
termination codon

EJC – ang. exon junction
complex

a. NMD – nonsense mediated
decay

Szlak interferencji RNA

RISC – ang. RNA-induced
silencing complex

siRNA – ang. small
interfering RNA