TEST KOŃCOWY 2001/2002

zestaw 1 IMIĘ I NAZWISKO:

1. Fragment DNA powstały po strawieniu enzymem restrykcyjnym dającym wystające lepkie końce

5' najlepiej wyznakować

1. Fragmentem Klenowa polimerazy I z E. Coli

2. T4 polimerazą DNA

3. Kinazą lub terminalną transferazą

4. Polimerazą Taq

2. W skład reakcji random priming wchodzą

1. dwuniciowy ponacinany DNAząI fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP,

losowe oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

2. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP, losowe

oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

3. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -γ-dCTP, losowe

oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

4. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP, losowe

oligonukleotydy, zmodyfykowana DNA zależna T7 DNA polimeraza

3. W metodzie znakowania sondy „ nick-translation” wykorzystywane są następujące enzymy:

A. DnazaI i polimeraza I DNA zależna od DNA z E. coli

B. RnazaI i polimeraza I DNA zależna od DNA z E. Coli

C. DnazaI i fragment Klenowa polimerazy I DNA zależna od DNA z E. Coli

D. DnazaI i polimeraza DNA zależna od DNA z faga T4

4. Hybrydyzację Southern blot można prowadzić:

1. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 42⁰C lub bez formamidu w temeraturze 42⁰C

2. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 68⁰C lub bez formamidu w temeraturze 68⁰C

3. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 68⁰C lub bez formamidu w temeraturze 42⁰C

4. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 42⁰C lub bez formamidu w temeraturze 68⁰C

5. Do znakowania końców 3' można wykorzystać:

1. metodę „extension synthesis”

2. Znakowanie z użyciem terminalnej transferazy

3. Metodą „random priming”

4. A i B

5. A, B i C

6. Wskaż poprawne stwierdzenie:

1. Poprawność integracji transgenu w genomie roślinnym można sprawdzić metodą Western Blot

2. Analizą Northern blot można wykazać poprawność transkrypcji transgenu

3. Zapiekanie membrany ma na celu zablokowanie niespecyficznie wiążących miejsc na membranie

4. Depurynacja zachodzi w 0,4 M NAOH

7. Uszereguj poszczególne etapy Analizy Southern blot (1, 2, 3,.....):

cięcie enzymem restrykcyjnym

hybrydyzacja z wyznakowaną sonda

izolacja DNA

depurynacja DNA

odpłukanie niespecyficznie zwiazanej sondy

blokowanie niespecyficznie wiążących miejsc na membranie

rozdział DNA w żelu agarozowym

denaturacja DNA

transfer DNA na membrane

autoradiografia

zapiekanie membrany

8. Ilość kopii transgenu w genomie można sprawdzić analizą

A. Northern blot

B. Southern blot

C. Western blot

D. żadne z powyższych

9. Stabilność Hybrydowych cząsteczek zależy od:

A. Długości komplementarnych sekwencji i zawartości par G-C

B. Temperatury i stężenia soli w roztworze

C. Temperatury ale nie od stężenia soli

2. A i B

3. A i C

10. Elektroforeza w żelu pozwalającą na rozdział molekuł na podstawie różnic w masie cząsteczkowej jest pierwszym etapem w metodzie:

1. Southern-blot, Northern - blot i Western -blot

2. Southern-blot, Northern - blot i dot -blot

3. Western -blot i in situ hybrydyzacji

4. Hybrydyzacji kolonijnej i łysinkowej

TEST KOŃCOWY 2001/2002

zestaw 2 IMIĘ I NAZWISKO:

1. Elektroforeza w żelu pozwalającą na rozdział molekuł na podstawie różnic w masie cząsteczkowej jest pierwszym etapem w metodzie:

1. Southern-blot, Northern - blot i Western -blot

2. Southern-blot, Northern - blot i dot -blot

3. Western -blot i in situ hybrydyzacji

4. Hybrydyzacji kolonijnej i łysinkowej

2. W metodzie znakowania sondy „ nick-translation” wykorzystywane są następujące enzymy:

A. DnazaI i polimeraza I DNA zależna od DNA z E. coli

B. RnazaI i polimeraza I DNA zależna od DNA z E. Coli

C. DnazaI i fragment Klenowa polimerazy I DNA zależna od DNA z E. Coli

D. DnazaI i polimeraza DNA zależna od DNA z faga T4

3. Ilość kopii transgenu w genomie można sprawdzić analizą

1. Southern blot

2. Norhtern blot

C. Western blot

D. Żadne z powyższych

4. Do znakowania końców 3' można wykorzystać:

1. metodę „extension synthesis”

2. Znakowanie z użyciem terminalnej transferazy

3. Metodą „random priming”

4. A i B

5. A, B i C

5. Wskaż poprawne stwierdzenie:

1. Poprawność integracji transgenu w genomie roślinnym można sprawdzić metodą Western Blot

2. Analizą Northern blot można wykazać poprawność transkrypcji transgenu

3. Zapiekanie membrany ma na celu zablokowanie niespecyficznie wiążących miejsc na membranie

4. Depurynacja zachodzi w 0,4 M NAOH

6. Fragment DNA powstały po strawieniu enzymem restrykcyjnym dającym wystające lepkie końce

5' najlepiej wyznakować

1. Fragmentem Klenowa polimerazy I z E. Coli

B. T4 polimerazą DNA

3. Kinazą lub terminalną transferazą

4. Polimerazą Taq

7. W skład reakcji random priming wchodzą

1. dwuniciowy ponacinany DNAząI fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP,

losowe oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

2. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP, losowe

oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

3. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -γ-dCTP, losowe

oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

4. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP, losowe

oligonukleotydy, zmodyfykowana DNA zależna T7 DNA polimeraza

8. Hybrydyzację Southern blot można prowadzić:

A. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 42⁰C lub bez formamidu w temeraturze 42⁰C

B. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 68⁰C lub bez formamidu w temeraturze 68⁰C

C. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 68⁰C lub bez formamidu w temeraturze 42⁰C

D. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 42⁰C lub bez formamidu w temeraturze 68⁰C

9. Stabilność Hybrydowych cząsteczek zależy od:

A. Długości komplementarnych sekwencji i zawartosci par G-C

B. Temperatury i stężenia soli w roztworze

C. Temperatury ale nie od stężenia soli

4. A i B

5. A i C

10. Uszereguj poszczególne etapy Analizy Southern blot (1, 2, 3,.....):

cięcie enzymem restrykcyjnym

hybrydyzacja z wyznakowaną sonda

izolacja DNA

depurynacja DNA

odpłukanie niespecyficznie zwiazanej sondy

blokowanie niespecyficznie wiążących miejsc na membranie

rozdział DNA w żelu agarozowym

denaturacja DNA

transfer DNA na membrane

autoradiografia

zapiekanie membrany

TEST KOŃCOWY 2001/2002

zestaw 3 IMIĘ I NAZWISKO:

1. Elektroforeza w żelu pozwalającą na rozdział molekuł na podstawie różnic w masie cząsteczkowej jest pierwszym etapem w metodzie:

1. Southern-blot, Northern - blot i Western -blot

2. Southern-blot, Northern - blot i dot -blot

3. Western -blot i in situ hybrydyzacji

4. Hybrydyzacji kolonijnej i łysinkowej

2. Ilość kopii transgenu w genomie można sprawdzić analizą

1. Southern blot

2. Norhtern blot

C. Western blot

D. Żadne z powyższych

3. W metodzie znakowania sondy „ nick-translation” wykorzystywane są następujące enzymy:

A. DnazaI i polimeraza I DNA zależna od DNA z E. coli

B. RnazaI i polimeraza I DNA zależna od DNA z E. Coli

C. DnazaI i fragment Klenowa polimerazy I DNA zależna od DNA z E. Coli

D. DnazaI i polimeraza DNA zależna od DNA z faga T4

4. Hybrydyzację Southern blot można prowadzić:

1. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 42⁰C lub bez formamidu w temeraturze 42⁰C

2. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 68⁰C lub bez formamidu w temeraturze 68⁰C

C. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 68⁰C lub bez formamidu w temeraturze 42⁰C

D. w roztworze z 50 % formamidu w temperaturze 42⁰C lub bez formamidu w temeraturze 68⁰C

5. Do znakowania końców 3' można wykorzystać:

1. metodę „extension synthesis”

2. Znakowanie z użyciem terminalnej transferazy

3. Metodą „random priming”

4. A i B

5. A, B i C

6. Wskaż poprawne stwierdzenie:

1. Poprawność integracji transgenu w genomie roślinnym można sprawdzić metodą Western Blot

2. Analizą Northern blot można wykazać poprawność transkrypcji transgenu

3. Zapiekanie membrany ma na celu zablokowanie niespecyficznie wiążących miejsc na membranie

4. Depurynacja zachodzi w 0,4 M NAOH

7. Fragment DNA powstały po strawieniu enzymem restrykcyjnym dającym wystające lepkie końce

5' najlepiej wyznakować

1. Fragmentem Klenowa polimerazy I z E. Coli

B. T4 polimerazą DNA

3. Kinazą lub terminalną transferazą

4. Polimerazą Taq

8. W skład reakcji random priming wchodzą

1. dwuniciowy ponacinany DNAząI fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP,

losowe oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

2. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP, losowe

oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

3. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -γ-dCTP, losowe

oligonukleotydy, fragment Klenowa polimerazy DNA

4. dwuniciowy zdenaturowany fragment DNA, mieszanka dezoksyrybonukletydów, ³²P -α-dCTP, losowe

oligonukleotydy, zmodyfykowana DNA zależna T7 DNA polimeraza

9. Stabilność Hybrydowych cząsteczek zależy od:

A. Długości komplementarnych sekwencji i zawartosci par G-C

B. Temperatury i stężenia soli w roztworze

C. Temperatury ale nie od stężenia soli

D. A i B

5. A i C

10. Uszereguj poszczególne etapy Analizy Southern blot (1, 2, 3,.....):

cięcie enzymem restrykcyjnym

hybrydyzacja z wyznakowaną sonda

izolacja DNA

depurynacja DNA

odpłukanie niespecyficznie zwiazanej sondy

blokowanie niespecyficznie wiążących miejsc na membranie

rozdział DNA w żelu agarozowym

denaturacja DNA

transfer DNA na membrane

autoradiografia

zapiekanie membrany

---