Clostridium pectinoucrum
Chlorobacterium
Tlenowce:
Azotobacter chroococcum
Azotobacter agilis
Azotobacter indicum
Azotobacter vinelandii
Azotobacter beijennckii
Azotobacter zużywa tlen dzieki czemu rozwija się beztlenowo Clostridium, który daje mu kwas masłowy i maślany. Przez rok żyjąc w symbiozie mogą związać 10kg N2/1 hektar.
Diplpcoccus Pneumoniae
Aerobacter Aerogenes
Pseudomonas sp
Bacillus asterosponus
Clostrilium beztlenowo wiąże 2 -3mg N2 / 1g glukozy
Azotobacter tlenowo wiąże 16 - 20 mg N2 / 1g glukozy
(sinice na polach ryżowych 30 -50 kg N2 / 1ha x rok)
BAKTERIE SYMBIOTYCZNE (WIĄŻĄCE N2)
Rhizobium leguminosarium - groch
Rhizobium trifolii - koniczyna
Rhizobium phaseoli - fasola
Rhizobium meliloti - lucerna
Rhizobium japonicum - soja
Rhizobium lupini - łubin
Actinomycetes alni - olcha
Actinomycetes eleagni - oliwki
Klebsiella sp - liście roślin tropikalnych
!!!Bakterie Rhizobium wiążą 100 - 200
GNICIE (rozkład białek):
Tlenowce przetrwalnikujace
Bacillus subtilis
Bacillus cereus
Tlenowce nieprzetrwalnikujace
Pseudomonas fluorescens
Serratia marcescens
Proteus vulgaris
Bacterium linens
Beztlenowce
Clostridium perfringens
Clostridium sporogens
Clostridium botulinum!!!
Pleśnie
Aspergillus niger
Mucor
Cladosporium
Botrytis
Trichoderna
Wszystkie m. wytwarzają enzymy proteolityczne do przemian wewnątrzkomórkowych ale tylko część wydziela je na zewnątrz i rozkłada białko poza komórką - proteolity.
Dalszy proces rozkładu białka to amonifikacja.
AMONIFIKACJA - rozkład aminokwasów do amoniaku z jego wydzieleniem, pogłębiony proces gnicia.
Rozkładające mocznik:
Bacillus subtilis
Bacillus cereus
Micrococcus ureae
Bacillus pasteuri
Sarcina ureae
Sarcina hansenii
Eubacterium ureolyticum
Eubacterium coli
Kw. ၢ - indolooczowy - heteroauksyna (jeżeli bakterie w glebie przeprowadzają ten rozkład to rośliny lepiej rosną).
Chemoautotrofy - z utleniania związków chemicznych czerpią energię.
NITRYFIKACJA
NH4+ +
O2 → 2H+ + H2O + NO2 + 66kcal (270.6kJ)
Nitrosomonas europea
Nitrococcus sp (amerykański) 1 CO2 - 35NH3
NO2- +
O2 → NO3- + 17.5 kcal (71.7kJ)
Nitrobacter Winogradski
Nitrobacter Agilis 1 CO2 - 135NH3
DENITRYFIKACJA - przebiega zależnie od warunków, w jakich znajduje się gleba.
NH2OH → NH3 amonifikacja azotowa
NO3- → NO2- → NO
N2O → N2 denitryfikacja (tu zachodzi strata azotu)
NO3- → NO2- :
Escherichia coli
Bacillus subtilis
Bacillus mycoides
Aerobacter aerogenes
Proteus vulgaris
Vibro cholerae
NO3- → NH2 :
Neurospora crossa
NO3- → N2 :
Bacterium denitrificans
Pseudomonas fluorescens
Pseudomonas stutzere
Thiobacillus denitrificans
Vibro denitrificans
TYP MYCOTA, FUNGI (GRZYBY)
KLASY:
Chytrydiomycetes - strączkowce
Oomycetes - lęgniowce
Zygomycetes - sprzężaki
Hyphochytriomycetes - strzępkowce
Trichomycetes - włosowce
Ascomycetes - workowce
Basidiomycetes - podstawczaki
Deuteromycetes lub Fungi imperfelti - grzyby niedoskonale
TYP MYXOMYCOTA (śluzowce)
Nie maja chlorofilu, nie maja barwników do syntetyzowania związków organicznych i wiązania węgla w powietrzu, heterotrofy żyjące z rozkładu podłoża organicznego.
RÓŻNICE W BUDOWIE PROCARYOTA i EUCARYOTA
|
PROCARYOTA (bakterie, sinice) |
EUCARYOTA (grzyby, rośliny) |
Typowa ၪ komórki |
1 |
10 (u roślin 100) |
Błona jądrowa |
- |
Dwuwarstwowa |
Liczba chromosomów |
1 |
>1 |
Reticulum enoloplazm |
- |
Występuje |
Mitochondria |
- |
Występuje |
Chloroplasty |
- |
Mogą występować |
Wodniczki |
Rzadko |
Powszechnie |
mureina |
Występuje |
rzadko |
Jednokomórkowe grzyby to zawsze grzyby wodne lub drożdże.
GRZYBNIA (MYCELIUM) - splot nitek grzyba.
Istotną sprawą jest budowa ściany komórkowej, na podstawie której można odróżnić np. pleśnie od drożdży.
Budowa ściany komórkowej:
Drożdży:
Warstwa zewnętrzna - mannan + białko
Warstwa środkowa - glukan
Warstwa wewnętrzna - białka
Pleśni:
- chityna, celuloza, glukon lub celuloza, glukan.
Ściany komórki grzybów są czasami pokryte śluzem powstałym z cukrów.
Ściana komórkowa drożdży łatwo ulega zszuszeniu.
Pleśnie - ścian komórkowa trudna do strawienia i dlatego trudno stosować białko pleśniowe jako pożywienie.
PROTOPLAST - to zawartość pozostała po odjęciu ściany kom., to cytoplazma i jądro komórki
BŁONA CYTOPLAZMATYCZNA (MEMBRANA) - reguluje dostęp środków odżywczych do wewnątrz i wydziela metabolity na zewnątrz.
Wodniczki - substancja zapasowa, produkt przemiany
Retikulum endoplazmatyczne - ścianki wewnątrzkomórkowe dzielące komórkę na przedziały gdzie zachodzą różne przemiany metaboliczne.
CYTOPLAZMA - roztwory koloidalne zawierające białka. Zależy od wieku komórki. Młode komórki maja przezroczyste cytoplazmy.
RYBOSOMY - miejsce syntezy białek, powstają enzymy.
MITOCHONDRIUM - tu następuje uwalnianie energii w wyniku reakcji spalania cukrów. Zbudowane z 80% białka i 20% tłuszczy. Centra energetyczne.
JĄDRO KOMÓRKOWE - nośnik informacji genetycznych. Może być ich różna ilość. Stanowi do 40% objętości komórki. Wewnątrz jest małe jąderko.
PORY - przez nie może przemieszczać się cytoplazma.
SEPTY - ściany poprzeczne.
GRZYBNIA - zbudowana ze strzępek. Rośnie atikalnie (wierzchołkowo), czasem podzielona błonami poprzecznymi (septami), pory (mikropory).
Wgłębna - wrasta w podłoże. Czerpie z niego składniki odżywcze, rozkłada to podłoże. Niektóre wytwarzają lyzoidy.
Powietrzna - grzybnia szybko rozprzestrzenia się w powietrzu. Rośnie pod wgłębną, rozmnażanie grzyba, tworzy służące do grzyba na powierzchni.
Twory plekterichyny - zbite komórki grzybni odporniejsze na trudne warunki.
Owocniki to plektenchyna.
Długość grzybni to kilkadziesiąt ၭm, kilkanaście m.
PLEKTENCHYDY - obfite sploty grzybni, odporne na warunki otoczenia (sklerocja), ciała owoconośne.
DIMORFIZM - podwójna forma np. Rhizopus w warunkach beztlenowych tworzy pojedyncze drożdże mucorowe, a w tlenowych tworzy sploty komórek; długie nitki, regularna grzybnia.
ROZMNŻANIE GRZYBÓW
Rozmnażanie
Płciowe
Kopulacja gamet
Kopulacja gametangiów
Kopulacja somatyczna
Bezpłciowe
Rozszczepianie (schizosaccharomyces)
Pączkowanie (pseudomycelium) - powstaje pseudogrzybnia gdy komórka się nie odrywa
Zarodnikowanie
Artrospory
Spory członowe
Oidia (oospora)
Chlamydospory
gemmy
Twory specjalne
Egzospory (Penicillium, Aspergillus)
Endospory (Mucor, Rhizopus)
U bakterii powstają 2 nowe komórki. U grzybów jest komórka macierzysta i potomna. (rozmnażanie przez podział).
Mycelium - między komórkami pleśni kontakt prze pory, septy.
Pseudomycelium - w niby grzybni (drożdże) nie ma połączenia między komórkami, są po prostu zszczepione.
Przy rozmnażaniu bezpłciowym powstaje bardzo wiele zarodników. Jeżeli jest mało zarodników to mikroorganizmy są bardziej odporne na wpływ otoczenia.
Drożdże dzikie - szybko zarodnikujące.
Różnice między zarodnikami grzybów i przetrwalnikami bakterii:
Zarodniki: Ⴓ 1 forma rozmnażania giną w temperaturze < 100ႰC, z jedenj komórki wiele zarodników, z jednego zarodnika wiele komórek.
Przetrwalniki: zwykle 1 forma przetrwania odporne na temperaturę > 100ႰC, z jednego przetrwalnika powstaje jedna komórka.
Grzyby - rozkładają wszystko, maja rozbudowany układ enzymatyczny i są saprofitami, ale także są pasożytami. W większości są tlenowcami a czasami względne beztlenowce (drożdże) (większość to saprofity)
Z cukrów prostych korzystają prawie wszystkie mikroorganizmy.
Cukry złożone - głównie pleśnie gdyż wytwarzają specjalne enzymy rozkładające polisacharydy.
Ze skrobi podczas fermentacji powstaje etanol.
Grzyby nie zawierają chlorofilu, wybitne heterotrofy, korzystają tylko z organicznych związków C, ale też z organicznych i nieorganicznych związków azotu.
Głównie tlenowce (prawie wszystkie pleśnie).
Mikoryza - symbioza z drzewami.
Pasożyty (pleśnie i drożdże).
Dla drożdży optymalna temperatura to 25ႰC - 28ႰC
Niektóre szczepy - 34ႰC
Maksymalnie około 40ႰC
W przemyśle stosowane są termofilne rosnące w optymalnej temperaturze około 36ႰC, ponieważ szybsze przemiany metaboliczne i mniej zakażeń drobnoustrojami.
Kwasowość środowiska - 2.8 - 8 pH, pH opt 5.5 - 6
Min pH = 2.5
Drożdże rosną > 2,5pH, giną poniżej około 2,2. wytrzymują do 8. w zależności od pH wytwarzają gliceryny (pH>7) lub wytwarzają etanol (pH kwaśne).
Drożdże są wzglednymi beztlenowcami.
Stosunek do tlenu - obecność tlenu w podłożu - w warunkach beztlenowych powstaje etanol.
Stosunek do źródeł węgla - wykorzystują mono- i disacharydy. Cecha diagnostyczna nie wykorzystują poli - związków np. skrobi, celulozy.
Stosunek do N2 - by mógł budować białka. Mogą przyswajać azot nieorganiczny (azotyny, azotany) - zdolność przyswajania różnych form.
Substancje wzrostowe - witaminy z grupy B. Niektóre same syntetyzują np. witamina D.
Beztlenowa fermentacja:
Warunki tlenowe: wzrost biomasy i minimalne wytwarzanie alkoholu. Część drożdży to wybitne tlenowce (kożuchujące). Nie fermentują cukrów tylko spalają cukry do CO2 i H2O, wytwarzają dużą ilość biomasy.
Zdolność rozkładu cukrów jest cechą diagnostyczną, można określić ich umiejscowienie w systematyce.
Drożdże wykorzystują we wszystkich organizmach azot aminokwasowy. Nie rozkładają białek. Wykorzystują azot amonowy (nieorganiczny) wbudowany do ich białek. Przyswajanie różnych form N to także cecha diagnostyczna.
Drożdże są źródłem witamin gdyż gromadzą je w komórkach. Są podłożem mikrobiologicznym. Wytwarzają witaminy z grupy D.
Praktyczny podział drożdży:
Pożyteczne
Fermentacja
Gorzelnictwo
Winiarstwo
Piwowarstwo
Piekarstwo
Oddychanie tlenowe
Biomasa drożdży piekarskich
Biomasa drożdży paszowych
Wzbogacanie żywności
Drożdże spożywcze
Witaminy D
ၢ - karoten
laktaza laktoza
inwertaza
tłuszcz
białko
Szkodliwe
zmętnienie (piwo, wino)
zmiana smaku (soki, kompot)
zmiana zapachu
Drożdże nie mają właściwości trujących.!!!
Drożdże należą do grupy GRAS - ogólnie uznane za bezpieczne.
Drożdże:
szlachetne - hodowane przez człowieka, ich cechy są chronione.
Drożdże górnej (gorzelnictwo) i dolnej (piwowarstwo) fermentacji. Drożdże ten nie powinny rozkładać wytworzonego alkoholu, trudno zarodnikują.
- saccharomyces cerevisiae
-saccharomyces carsbergensis - fermentują rafinozę, szybko fermentują cukry, nie powinny rozkładać wytworzonego alkoholu.
dzikie
- słabo lub nie fermentują cukrów. Rozkładają alkohol do CO2 i H2O, rozkład kwasów organicznych (np. kwasu mlekowego - psucie kiszonek). Wykorzystują substancje nie wykorzystywane przez drożdże szlachetne. Łatwo szybko zarodnikują, dużo zarodników.
Pyliste - kom. otoczone warstewką śluzu (zawierają proteazy, które rozpuszczają ten śluz). Małe trudno sedymentuja, utrzymują się w zawiesinie.
Kłaczkujące - nie oddzielają się od kom. Powstaje Pseudomycelium (pseudogrzybnia) - nie występują septy, komórki są oddzielne sklejone przez otoczkę śluzowa. W grzybni występują septy, a w nich pory.
Drożdże wytwarzają śluz. Jeżeli rozkładają śluz każda komórka osobno, nie zlepiają się i nie opadają na dno.
Skład chemiczny drożdży:
H2O 75%
s.m. 25%
białko 50%
glikogen 30% - skrobia zwierzęca
tłuszcz 2 -3%
hemiceluloza 8 - 9%
popiół 10% w tym:
P2O5 52%
K2O 35%
MgO 0.4%
CaO 1.5%
Witaminy w drożdżach (mg / 100g)'
|
PIWOWARSKIE |
PIEKARSKIE |
B1 |
24 |
3,5 |
B2 RYBOFLAMINA |
1,5 |
2,5 - 3,8 |
B6 |
3,0 - 7,5 |
- |
B12 |
- |
- |
Niacyna |
10 - 100 |
|
Kw foliowy |
5 |
Żeby drożdże stanowiły źródło witamin trzeba je wrzucając je do gorącego mleka lub podgotować, gdyż wychwytują witaminy z przewodu pokarmowego.
W przemyśle korzystne jest aby otrzymać z wysokiego stężenia cukru wysokie stężenie alkoholu w stosunkowo krótkim czasie.
Drożdże gorzelnicze - 2-3 dni, około 11% alkoholu.
Drożdże winiarskie - z wysokiego stężenia cukru wysokie stężenie alkoholu do 18-20% alkoholu. Drożdże winiarskie powinny być odporne na SO2, który wpływa niekorzystnie na smak.
Garbniki - winogrona dają dobre wina ale garbniki hamują rozwój drożdży. Łatwo osiadają na dnie.
Drożdże:
Winiarskie (Sacchyromyces cerevisiae) - wyizolowane z winogron - charakteryzują się zawartością barwników, odporne na stosunkowo wysokie stężenie SO2, odporne na wysokie stężenie cukru; osmofilność - miody pitne.
Piwowarskie (Sacchyromyces carlsbergensis) - dolnej fermentacji, łączą się i osiadają na dnie, piwo łatwo się klaruje, zawartość alkoholu w piwie około 4-5%, muszą być odporne na garbniki chmielu nadające piwu właściwy smak.
Piekarskie - musza szybko fermentować, żeby ciasto szybko rosło, duża trwałość. Duża siła podnoszenia ciasta, podobne do gorzelniczych.
Pastewne (paszowe)- TORULOPSIS UTILIS, MONILIA MURMANICA - wykorzystują cukry niewykorzystywane przez Sacchyromyces, zawierają dużo białka, nie zamieniają cukrów na alkohol - brak właściwości fermentacyjnych.
Wytwarzające tłuszcze - ENDOMYCES VERNALIS, RHODOTORULA GRACILIS, THORULOPSIS LIPOFERA - ok. 60% wyselekcjonowanego tłuszczu.
Wytwarzające witaminy -
ASHBYA GOSSYPII, EREMOTHECIUM ASHBYII, CANDIDA GUILLIERMONDI, CANDIDA FLAVERI - B2
SACHAROMYCES CEREVISIAE - D
RHODOTORULA - ၢ - karoten
Niektóre drożdże wrażliwe na brak witamin.
Chorobotwórcze -
CANDIDA ALBICANS - powoduje grzybice, u niemowląt pleśniawki
CANDIDA TROPICALIS
CANDIDA PSEUDOTROPICALIS
CRYPTOCOCCUS NEOFORMANS - powoduje zapalenie opon mózgowych i grzybicze zapalenie płuc
Na grzyby nie działają antybiotyki
Szczególne cechy pleśni:
Szczególna budowa ściany komórkowej z chityny
Bardzo bogaty kompleks enzymatyczny, rozkładają wiele substancji nierozkładalnych dla innych;
Tlenowość (wyjątki np. Mucor)
Odporność na szeroki zakres pH (2 - 1,1)
Mezofile - ale w niskich temperaturach tez powoli rosną
Osmofilne - lubią wysokie stężenie cukrów.
Znaczenie pleśni pożyteczne:
Zdolność do wytwarzania antybiotyków
Zdolność do wytwarzania enzymów potrzebnych w wielu technologiach (amylazy, proteazy, celulazy) i kwasów organicznych
Dojrzewanie serów
Produkcja tłuszczu
Oznaczanie zawartości witamin gdyż niektóre są wrażliwe na ich niedobór.
Stosowane do produkcji tłuszczów
Znaczenie szkodliwe pleśni:
Psucie się surowców i produktów, wytwarzanie enzymów które rozkładają np. mięso;
Wytwarzają mikotoksyny - (prawie wszystkie pleśnie) w niewielkich ilościach w zależności od podłoża i warunków. Odkładają się w tkankach nerek, wątroby, mają właściwości kancerogenne (wywoływanie nowotworów właściwych) , nie niszczy ich temperatura. Należy zachować higienę produkcji aby nie dopuścić do pleśnienia, stwarzać warunki beztlenowe.
Zahamowanie wzrostu pleśni:
Zachować czystość i higienę produkcji
Warunki beztlenowe
Pasteryzacja
Wysuszenie wody poniżej 15%
Dodanie soli kwasu propionowego lub kwasu propionowego
BAKTERIE I WIRUSY
Jednokomórkowe rozmnażają się przez podział prosty.
morfologia - kształt komórki zależy od temperatury, obecności tlenu, podłoża, składu środowiska. Przy kształcie trzeba podawać warunki, w których występuje.
Są 4 podstawowe kształty:
ziarniaki
pałeczka (cylindryczny)
skrętniak
przecinkowce
Bakterie nie maja wykształconego jądra, materiał genetyczny w postaci kwasu nukleinowego zawieszonego w komórce (Procaryota).
Komórka = protoplast + ściana komórkowa.
Na zewnątrz ściany komórkowej bakterii znajdują się otoczki, rzęski i pile - fimbrie.
OTOCZKI - galaretowata masa białkowo- węglowodanowa, czasem jej grubość większa niż sama komórka. Wytwarzanie otoczki uwarunkowane genetycznie, warunki środowiska wpływają czy ta zdolność się ujawnia czy nie. Otoczki mają charakter antygenowy. Chronią komórkę przed wysychaniem. Chronią przed wirusami bakteryjnymi - bakteriofagi. Chronią przed fagocytozą organizmu wyższego. Rola w odżywianiu.
RZĘSKI - występują na zewnątrz komórki, narząd ruchu zbudowany z białka, często dłuższe niż komórka, cieniutkie, zakotwiczone są w błonie cytoplazmatycznej, powstają z uwzględnieniem genetyki. Szybkość poruszania to 50ၭm / s, antygenowe.
FIMBRIE - występują niezależnie od rzęsek, grubsze i krótsze od rzęsek. Charakter antygenowy (komórka łączy się z podłożem).
ŚCIANA KOMÓRKOWA - jej budowa jest wskaźnikiem przynależności do bakterii. 25% komórki to ściana komórkowa. Zbudowana jest z:
PEPTYDOGLIKANU = GLIKOPEPTYD = MUKOPEPTYD = MUROPEPTYD= MUREINA = N - ACETYLOGLUKOZAMINA + KWAS N -ACETYLOMURAMINOWY + D - AMINOKWASY + KWAS MEZO - DWUAMINOPIMELINOWY.
G(+) KWASY TEJCHOJOWE (POLIMERY)
Fosforan glicerolu (kw. glicerolotejchojowy)
Fosforan rybitolu (kw. rybitolotejchojowy)
Cechy ściany komórkowej G+:
Grubsze od G- (G+ - 20nm, G- - 10nm)
Wrażliwe na lizozym
Wrażliwe na penicylinę
Wrażliwe na detergenty
Mniej wrażliwe na telluryn potasowy, azydek sodowy, octan talu
Antygenowy charakter
Ściana komórkowa to sito molekularne przy odżywianiu.
Pod ścianą znajduje się błona cytoplazmatyczna (membrana), odpowiedzialna za pobieranie składników pokarmowych i wydzielanie metabolitów.
BŁONA CYTOPLAZMATYCZNA - skład: 70%białka, lipidy (transport do komórki), transport na zasadzie biernej dyfuzji lub przy udziale permeaz (enzymy). Błona inicjuje podział komórki. W niej osadzone są rzęski. Nie ma jądra wyodrębnionego tylko nici DNA zawieszone w cytoplazmie. Zawieszone w cytoplazmie są plazmidy. Gromadzą się substancje zapasowe.
Aparat jądrowy:
Spirala kwasu nukleinowego, długa i cienka.
Rybosomy - miejsce syntezy białka. Różnią się od rybosomów grzybów stałą sedymentacji.
Substancje zapasowe:
polimer kwasu ၢ - hydroksymasłowego u bakterii tlenowych
wolutyna
wielocukry - granuloza barwi się na fioletowo, odpowiednik glikogenu
tłuszcze
Formy przetrwalne bakterii:
promieniowce (Actinomycetales) - konidia
bakterie śluzowe (MYXOBACTERIALES) - mikrocysty
Azotobacter - cysty
Bacillaceae - endospory (w żywności)
Sporosarcina (SARCINA UREAE) - endospory
Spirillum (niektóre gatunki) - endospory
Oscillospira guilliermondi - endospory
PRZETRWALNIKI GDY:
brak pożywienia
zbyt duże nagromadzenie metabolitów, zatruwających środowisko.
Przejście z komórki wegetatywnej do przetrwalnika - kilka godzin. Sucha masa komórki koncentruje się w jednym miejscu (w ok. 1/10 objętości). Zbita masa otoczona podwójną warstwą błony cytoplazmatycznej.
przetrwalnik - to cecha genetyczna niektórych bakterii.
KWAS DWUPIKOLINOWY (kwas pirydyno - 2, 6 -dwukarboksylowy)
HOOC COOH (15% s.m. przetrwalnika) - występuje w postaci soli
wapniowej.
N
Żeby przetrwalnik wrócił do formy wegetatywnej potrzebny jest impuls (bodziec cieplny, aminokwas...). przetrwalnik nabiera wody, wydzielają się białka, zniknie kwas dwupikolinowy, normalny metabolizm, komórka traci odporność - ok. 1h proces kierunkowania przetrwalników.
Cechy przetrwalników:
duża odporność na wysuszanie (do kilkuset lat w formie wysuszonej);
odporność na temperaturę;
odporne na UV (trzeba stosować duże dawki i przez długi czas);
większa odporność na środki dezynfekujące (nawet 70% alkohol nie niszczy przetrwalnika. Dopiero alkohol + jod niszczy przetrwalniki);
mała aktywność oddechowa;
wysoki stosunek DNA do RNA;
wysoki stosunek kwasów nukleinowych do białka;
duża zawartość kw. dwupikolinowego;
mniejsza zawartość wody ok. 70% (gdy w komórce powyżej 90%). Dlatego odporniejszy na działanie temperatury, a także z powodu zawartości soli wapniowej kwasu dwupikolinowego, związki wapnia działają ochronnie na białka, w tym enzymy.
RIKETSJE (RICKETTSIALES) - DR. H.T.RICKETTS (1871 - 1910)
RICKETTSIA PROWAZEKI - DUR PLAMISTY (G-, ziarniaki lub krótkie pałeczki, 0,5-1μm, ściana komórkowa z mureiny, rozmnażanie przez podział, bezwzględne pasożyty, czyli występują tylko na żywym gospodarzu, a nie na martwym lub pożywce).
COXIELLA BURNETII - GORĄCZKA Q (QUEENSLAND LUB QUERY) - przenoszona przez mleko.
PROMIENIOWCE - ACTINOMYCETALES
Rodzaje:
MYCOBACTERIUM - prątek, występuje w glebie, wytwarzają konidia
STREPTOMYCES - streptomycyna antybiotyk produkowany przez te bakterie. Rozmnażają się przez fragmentacje plechy na konidia, zapach świeżej gleby, rozkładają celulozy, chemicelulozy i inne trudno rozkładalne.
NOCARDIA - zmiany chorobowe u ludzi i zwierząt.
ACTINOMYCES - u zwierząt i ludzi promienica (chorobowe zmiany skóry), występują w oborniku powodując przemiany obornika, wśród nich termofilne powodujące zagrzewanie się obornika.
Rosną w postaci strzępek (strzępki cienkie i zawierające w ścianie komórkowej mureinę), niektóre maja rzęski, niektóre chemoaututrofy, G(+), niektóre mają zapach świeżej, uprawnej gleby.
SYSTEMATYKA BAKTERII:
-nomenklatura binarna (nazwa rodzajowa i gatunkowa)
ORGANIZM |
STOPIEN HOMOLOGII DNA (%) |
||
ESCHERICHIA COLI |
100 |
||
SALMONELLA TYPHIMURIUM |
71 |
||
AEROBACTER AEROGENES |
51 |
||
PROTEUS VULGARIS |
13 |
||
SERRATIA MARCESCENS |
7 |
||
PSEUDOMONAS AERUGINOSA |
1 |
||
BACILLUS SUBTILIS |
1 |
||
MAŁPA RHESUS |
100 |
||
CZŁOWIEK |
76 |
||
SZYMPANS |
76 |
||
MAŁPA SOWIA |
68 |
||
MYSZ |
27 |
||
KURA |
11 |
||
ŁOŚ |
5 |
||
ESHERICHIA COLI |
0 |
GRUPY SYSTEMATYCZNE (TAKSONY)
KRÓLESTWO REGNUM
GROMADA DIVISO
KLASA GLASSIS
RZĄD ORDO
RODZINA FAMILIA
RODZAJ GENUS
GATUNEK SPECIES
Systematyka Sztuma pomijała powiązania organizmów ale łączyła gatunki w grupy charakteryzujące się podobnymi cechami.
U organizmów wyższych gatunek tworzą te, które krzyżują się i dają potomstwo płodne.
Linneusz (Carol von Linne) 1735 - nomenklatura binarna.
WIRUSY:
wywołują choroby roślin, zwierząt i zmniejsza się podaż surowca dla przemysłu spożywczego lub jego pogorszeniu;
niszczenie kultur produkcyjnych np. kultury mleczarskie, np. w winiarstwie;
żywność przenosi wirusa ze środowiska na człowieka.
Bezwzględne pasożyty - nie da się ich wyhodować na sztucznym ani naturalnym podłożu lecz martwym;
Zwierzęce, roślinne, bakteryjne, pleśni, drożdży, promieniowców;
Nie maja możliwości samodzielnego rozmnażania i odżywiania;
Nie mają enzymów;
Śladowe ilości enzymów do atakowania żywych organizmów;
Informacja genetyczna zawarta w postaci kwasów nukleinowych.
1892 - Iwanowski, Beijerinck - stwierdzili skutki występowania wirusów, chociaż o tym nie wiedzieli.
1898 - Loffler, Frosch
1915 - Twost, D'herelle
Bakteriofagi - „czynnik pożerający bakterie”.
Stanley - wirus w postaci czystej mozaiki tytoniowej, nagroda Nobla.
BUDOWA:
helikoidalna - budowa skręconej nici kwasu nukleinowego w postaci pałeczki;
ikozaedralna - wielościan, zbliżony do kuli;
mieszana - połączenie pałeczki z kulą (większość wirusów bakteryjnych - fagów).
Wielkość:
Niewidoczne w mikroskopie świetlnym, tysięczne, setne części μm.
STRUKTURA:
genom - jednostka kwasu nukleinowego;
kapsyd - otoczka białkowa;
kapsomer
nukleokapsyd - kwas nukleinowy z otoczką nukleinową;
peplos - kwas nukleinowy + osłonka (płaszcz);
peplomery - jednostki składające się na budowę płaszcza. W płaszczu mogą być komórki gospodarza.
Powielanie - wirus wprowadza kwas nukleinowy do komórki gospodarza. Gospodarz produkuje aminokwasy, białka i kwasy nukleinowe według informacji genetycznej wprowadzonej przez wirusa. Podsunięta inna matryca do replikacji.
Namnażanie fagów:
adsorpcja - wirus umiejscawia się na powierzchni, wirusy są nieruchliwe. Im większa ruchliwość bakterii tym większe prawdopodobieństwo. Adsorpcja zależy do: pH, temperatury.
Replikacja - wirus ma enzymy pozwalające rozluźnić ścianę komórkową, wstrzykuje kwas nukleinowy, reszta zostaje na zewnątrz w postaci . kwas nukleinowy - lizogenizujący. Wraz z rozmnażająca się komórką przechodzi do następnych, gdy pojawią się okoliczności wirus się ujawnia. Powstają nowe fagi wewnątrz komórki i następuje jej śmierć.
Rozwój faga wewnątrz komórki:
faza eklipsy (okres rozwoju utajonego) - nie ma objawów, wirus nie jest widoczny, po około 20-22 min cząstki niezdolne do zakażenia. Cytoplazma się zmienia, powstają ziarnistości, komórka traci zdolności rozmnażania.
liza - rozpad komórki, wydostaje się około100 nowych fagów. Od zakażenia do lizy około1h, czasem nawet 15min.
Fagi wykazują specyficzność:
Każda bakteria ma swojego wirusa, wirusy są specyficzne nawet do szczepów bakterii.
BAKTERIOFAGI - wirusy bakterii, niszczą komórki przez lizę. Mogą powodować zahamowanie produkcji np. mleczarskiej. Komórka bakteryjna musi się spotkać z bakteriofagiem i zależy to od:
ruchliwości bakterii
ilości komórek bakteryjnych
od temperatury
od pH
od obecności kationów, które przyśpieszają absorpcje kom.
Wewnątrz komórki po wniknięciu nici:
okres utajony
wbudowywanie DNA do DNA bakteryjnego
tworzenie fagów
liza produktów პ od środka rozkładanie ścian komórkowych
powstałe fagi atakują (po wydobyciu się z komórki bakteryjnej) nowe komórki
okres zakażenia do lizy trwa około 30 minut.
Wirusy roślinne:
mogą się replikować tylko w komórce roślinnej;
nie adsorbują się lecz są wprowadzane przez uszkodzenia komórki bądź owady;
wirus krąży wraz z sokami i zakaża całą roślinę
mogą powodować zmianę kształtu lub barwy, utratę zdolności wytwarzania chlorofilu.
Wirusy zwierzęce:
Tropizm - działanie na różne układy;
Nerwotropowe - działają na układ nerwowy komórki (wirus wścieklizny);
Dermotropowe - na skórze;
Pantropowe - działają na cały organizm (żółta febra)
Interferencja - komórka zakażona jednym wirusem odporna na zakażenie innym wirusem.
Interferon - substancja wytwarzana przez organizmy cieplostałe, substancja białkowa, zapobiega rozwijaniu się wirusów.
Grupa VI - bakterie spiralne, skręcone, wygięte
Rodzina - SPIRILLACEAE
Rodzaj - SPIRILLUM
- ruchliwe o dość dużej długości, tlenowce bądź aerofile. Występują w wodzie, ściekach, gnojówce świń, dorszach.
Spirillum minor - wywołuje gorączkę szczurzą, przenoszoną przez szczury i dzikie zwierzęta, koty, psy (ukąszenie).
CAMPYLOBACTER
Campylobacter jejuni
Campylobacter coli
Kantylobakterioza - toksyny o charakterze lipidowo - sacharydowym działając jako enterotoksyny (toksyny przewodu pokarmowego) wywołują schorzenia, zapalenie jelita cienkiego. Bakterie te przeżywają w niskich temperaturach 40C dwa tygodnie. Występują w odchodach zwierząt (także ptaków), ściekach.
Dawka infekcyjna - minimalna liczba komórek, która powoduje chorobę.
Rodzaj o niepewnej przynależności: BDELLOVIBRIO
- w kształcie przecinka „bdello” - kijanka. Bardzo ruchliwa, zaliczana do bakterii ze względu na budowę ściany komórkowej (mureina), mniejsze od 1μm, bezwzględne pasożyty bakterii, wnikają do komórki gospodarza, zużywają cytoplazmę i wewnątrz komórki normalnie się rozmnażają, po 5-6 godzinach wytwarzają ok. 6 nowych komórek (wirusów kilkadziesiąt), np. Bdellovibrio, Bacteriororus - działają specyficznie.
Grupa VII
G(-) pałeczki tlenowe i ziarniaki
Rodzina I - PSEUDOMONADACEAE
Rodzaj I - PSEUDOMONAS
Rodzaj II - XANTHOMONAS
Rodzina II - AZOTOBACTERIACEAE
Rodzaj I - AZOTOBACTER
Rodzina III - RHIZOBIACEAE
Rodzaj I - RHIZOBIUM
Rodzina IV - HALOBACTERIACEAE
Rodzaj I - HALOBACTERIUM
Rodzaje o niepewnej przynależności:
Rodzaj ALCALIGENES
Rodzaj ACETOBACTER
Rodzina PSEUDOMONADACEAE
Rodzaj PSEUDOMONAS
Gatunki - P. fluorescens - zatrucie pokarmowe
P.aeruginosa - zatrucie pokarmowe
Urzęsione w różny sposób, tworzą katalazę, bezwzględne tlenowce, nie mają zdolności fermentacji, nieprzetrwalnikujące, opt. 20-370C (mezofile), nie rosną >440C, <6-70C. Wśród nich psychrotrofy (bez względu na optymalną temperaturę wzrostu dają powolny wzrost w temperaturze bliskiej 00C, około 40C), są heterotrofami w stosunku do węgla (wykorzystują tylko C organiczny), nie wydzielają gazu, utleniając glukozę rozkładają białka, tłuszcze (silnie gnilne), wytwarzają śluz, przyczyna psucie składanych jaj, drobiu, ryb, śluz + nieprzyjemny zapach, śluz może być barwny, właściwości lipolityczne - zdolność rozkładu tłuszczy, niektóre chorobotwórcze - pałeczka ropy błękitnej, niebezpieczne szczególnie dla oka.
Azotobacter - bakterie utleniające amoniak, hemoautotrofy bo energia z utlenienia związków nieorganicznych.
Rhisiobiaceae - wiążą azot atmosferyczny, w symbiozie z roślinami motylkowymi.
Halobacteriaceae - sololubne, w wodach morskich, przy stężeniach ok. 12% soli kuchennej, urzęsione, ruchliwe, barwniki pomarańczowe w solankach, rybach solonych, nie są szkodliwe.
Rodzaj ALCALIGENES - pałeczki zbliżone , wybitne tlenowce, alkalizują podłoże, na powierzchni drobiu zmrożonego, mleku, jajach, niektóre wywołują nieprzyjemny zapach.
GATUNKI:
A. VISCOLACTIS - powoduje lepkość mleka.