2011-03-10
1
Badania hemogenetyczne
w medycynie sądowej
Marek Sanak
Collegium Medicum UJ
Genetyka układu głównego ABO krwi człowieka
układ ABO odkryty przez Karla Landsteinera 1900
Cztery fenotypy determinowane przez trzy warianty genu
(allele): I
A
, I
B
, i.
Gen koduje enzym – glikozylotransferaze, na powierzchni
czerwonych krwinek syntezowane są antygeny grupowe: A, B
albo ich brak :O
Różnica między A i B polega na przyłęczeniu przez enzym -N-
Różnica między A i B polega na przyłęczeniu przez enzym N
galaktozaminy albo galaktozy
antygen = cząsteczka, która może być rozpoznana przez układ
odporności i spowodować produkcje przeciwciał
przeciwciało = immunoglobulina rozpoznająca swoiście
antygen
1930: Karl Landsteiner (Rockefeller Institute)
Przeciwciała układów grupowych
krwi
1.
Naturalnie obecne:
- ABO
- Anti-Hi, P1, E
Powstające w wyniku uodpornienia
2.
W ciąży:
- Rhesus, Kell, Fy
a
+ Others
3.
Po przetoczeniach:
- Rh, Kell, Fy, JK
a
+ Others
2011-03-10
2
Przykład innych grup krwi
wskazane zamiany
aminokwasowe białka
krwinek czerwoncyh
W i
t M
1 (S
Wariant M – seryna 1 (Ser-
1) i glicyna 5 (Gly-5)
Wariant N – leucyna 1 (Leu-
1) i glutamina 5 (Glu-5)
Oznaczanie (typowanie) grup
krwi
schemat interpretacji wyników: + oznacza
zlepianie krwinek
PT 1
PT 2
PT 3
PT 4
Anti A
+
-
+
-
w
e
cia
ła
krwinki pacjentów
A
A
A
n
n
n
t
t
t
i
i
i
B
B
B
-
-
-
+
+
+
+
+
+
-
-
-
Anti AB
+
+
+
-
A
B
AB
O
testo
w
pr
zeciw
krwinki pacjenta vs
testowe przeciwciała
surowica pacjenta vs
testowe krwinki
2011-03-10
3
nowoczesna metoda typowania
grupa krwi
Grupa ?
p
RhD ?
Częstość głównych grup krwi w
Europie
•Grupa O
56%
•Grupa A
31%
•Grupa B
11%
•Grupa AB
2.5%
•Rh (D) dodatni
85%
•Rh (D) ujemny
15%
przy zastosowaniu 8 układów grupowych krwi – w
94% dochodzeń spornego ojcostwa nie można
wykluczyć pozwanego
Trudny początek badań DNA w
medycynie sądowej
lata 1986 - 1994 - dyskusja dotycząca
wartości dowodowej DNA w kontekście
genetyki populacyjnej: Bruce Budowle vs. Eric
Lander
Orenthal James Simpson
2011-03-10
4
Budowa kwasu
deoksyrybonukleonowego (DNA)
sekwencja DNA jest
dziedziczna
AB0
można
badać
sekwen-
sekwen
cjonując
gen
Układ grupowy Rh
2011-03-10
5
polimorfizm długości fragmentów
restrykcyjnych (RFLP)
sonda jednolokusowa – fragmenty
sonda wielolokusowa – fragmenty
restrykcyjne pochodzą z różnych
chromosomów
sonda jednolokusowa fragmenty
restrykcyjne pochodzą z
pojedynczego miejsca w genomie
Badanie profilu DNA
krew
ślad
biologiczny
krew
ślad
biologiczny
krew
ojciec dziecko matka
izolacja DNA
cięcie enzymem
l k
f
elektroforeza
transfer na
membranę
hybrydyzacja z
sondą
detekcja sondy
sygnatura
wielolokusowa
sygnatura
jednolokusowa
krew
ślad
biologiczny
krew
ślad
biologiczny
ojciec dziecko matka
wykorzystanie RFLP w medycynie
sądowej
a
podejrzani
ma
tk
a
dzi
ec
ko
poz
w
an
y 1
poz
w
an
y 2
identyfikacja –
sonda
wielolokusowa
dochodzenie ojcostwa
sondy
jednolokusowe
of
ia
ra
śla
d
sonda 1
M D P
sonda 1
M D P
Ilość DNA w śladach biologicznych
50 l krwi (plama)
5-10 g
50 l nasienia
7-15 g
wymaz z pochwy
0 1 – 3 ng
wymaz z pochwy
0,1 3 ng
cebulka włosa
30 ng
trzon włosa
0,1 ng
do badania metodą RFLP
10 – 20 g / 1 układ
do badania metodą PCR (STR) 1-3 ng / 3-10 układów
2011-03-10
6
Amplifikacja techniką polimerazowej
reakcji łańcuchowej (PCR)
polimorfizm krótkich powtórzeń
tandemowych (STR)
wykorzystanie STR do badania
profilu DNA
wzorzec alleli – „drabinka”
badany ślad DNA
pary
zasad
2011-03-10
7
Identyfikacja śladu – DNA izolowane z fragmentu włosa
Identyfikacja
śladów gwałtu
- DNA
wyizolowane z
barwionego
rozmazu
cytologicznego
Postępowanie z materiałem DNA
zabezpieczonym od podejrzanego
2 wymazy z błony
śluzowej j. ustnej
1 ekstrakcja DNA
pomiar ilości DNA
jeśli pasuje 13 z 14
STR
weryfikacja 2
zlecenie badania DNA
1 przechowywany w
temp. -80ºC
PCR – badanie 14
układów STR przez 2
niezależne osoby,
kontrolowane przez
3 osobę
ocena wyniku
baza danych
profili DNA
weryfikacja 2
próbki
ponowna ocena
świeżo pobranego
materiału DNA
raport o pozytywnej
identyfikacji
Forensic Science Service, Birmingham,
Wlk. Brytania
2011-03-10
8
Moc statystyczna badania DNA zależy od
liczby zbadanych układów
dochodzenie ojcostwa
moc wykluczenia
średnia szansa wykluczenia
TH01
0,62
0,52 (1:2)
kombinacja
identyfikacja śladu
prawdopodobieństwo
przypadkowego dopasowania moc dyskryminacji
6 STR
0,9925
0,9871 (1:80)
TH01
0,352
0,919 (1:12)
kombinacja
6 STR
0,9195
0,999998 (1:0,5 mln)
Moc statystyczna badania DNA
• przy badanych 15 układach STR średni iloraz
wiarygodności identyfikacji:
• ojca biologicznego – badane 3 osoby = > 10
• ojca biologicznego badane 3 osoby > 10
miliardów
• ojca biologicznego – matka nie badana = > 10
milionów
• identyfikacja śladu jednej osoby = > 100
miliardów
• identyfikcja ze śladu pozostawionego przez 2
osoby = > 10 milionów
Inne rodzaje badania DNA
• przy identyfikacji mężczyzny; np. ślady
biologiczne gwałtu, identyfikacja NN, jeśli
dostępni tylko krewni mężczyźni – badanie
układów STR na chromosomie Y
• przy identyfikacji, jeśli dostępny materiał
archiwalny, np. fragment szkieletu, włosa, oraz
materiał porównawczy – badanie DNA
mitochondrialnego
• prawdopodobieństwo identyfikacji, jeśli nie
stwierdza się wykluczenia, tylko na podstawie
częstości wystąpienia profilu w bazie zbadanych
osób
Źródła błędu w ocenie badania
DNA
• badanie nie pozwala na ustalenie kolejności
czasowej naniesienia śladu biologicznego
• w przypadku więcej niż 2 uczestników
zdarzenia pozostawiających ślad oszacowanie
ich liczby, profilu DNA i prawdopodobieństwa
identyfikacji jest mniej wiarygodne
• wiele przedmiotów codziennego użytku
akumuluje materiał DNA pochodzący z
naskórka, śliny i innych wydzielin
•identyfikacja profilu DNA osoby o nieznanym pochodzeniu
etnicznym:
częstość alleli układu STR różni się w populacjach, moc
dyskryminacji 1:100000 w jednej populacji może w innej
wynosić 1:1000
2011-03-10
9
Możliwe przyczyny braku
wiarygodności badania DNA
•ułomność naukowych zasad badania (
poznana
)
•niepowtarzalność procesu badania (
wystandaryzowana
)
•błędy techniczne wykonania testu (
możliwe do wyeliminowania
)
•błędna interpretacja wyniku (
częsty zarzut
)
•błąd negatywny (
błędne wykluczenie podejrzanego
)
•błąd pozytywny (
błędny brak wykluczenia podejrzanego
)
nieświadomy błąd przeciwko podejrzanemu, np.
zaprzestanie dalszego badania po uzyskaniu wyniku
„pasującego”
Zebrane zalecenia dotyczące
badania DNA
•zabezpieczenie 2 próbek, z których jedna jest archiwizowana
•dokumentacja przekazania próbek zgodnie z zasadami
ogólnego postępowania dowodowego
•rozdział przygotowania próbek (np. identyfikacji śladów) od
samego badania DNA
samego badania DNA
•zabezpieczenie dostępu do laboratorium
•zachowanie reguł laboratoryjnych: szkolenia, kontrola
wewnętrzna i zewnętrzna, standaryzacja metod (np. CODIS)
•posiadanie własnej genetycznej bazy danych
•centralizacja badań lub rozdzielenie technicznego procesu
badania od jego opiniowania
•wynik w postaci wykluczenia albo prawdopodobieństwa
przypadkowej identyfikacji
Informacje pomocne w
opracowaniu ekspertyzy DNA
• stopień pokrewieństwa między osobami badanymi (powoduje
zmniejszenie wartości prawdopodobieństwa identyfikacji)
• etniczne pochodzenie osób badanych – jeśli nie są narodowości
polskiej zmienia się częstości alleli i wyliczenia
polskiej zmienia się częstości alleli i wyliczenia
prawdopodobieństwa
• dostępność materiału porównawczego do badania DNA od osób
będących jego potencjalnym źródłem – można identyfikować kto
był współuczestnikem w pozostawieniu śladu
• oszacowanie liczby osób, które mogły brać udział w
pozostawieniu śladu