Różne rodzaje rekombinacji

Rekombinacja

homologiczna

Rekombinacja

niehomologiczna

– nieuprawniona

Rekombinacja

specyficzna

Transpozycja

replikatywna

Rekombinacja specyficzna



Zachodzi między specyficznymi parami sekwencji DNA np.

integracja faga do chromosomu



Wymagany jest przynajmniej krótki odcinek homologii (np.

attP

i

attB

u faga lambda)



Do rekombinacji swoistej niezbędna jest integraza oraz

białko IHF (

integration host factor

)



Wycięcie faga wymaga również integrazy rozpoznającej

końce genomu faga i białek Xis – enzym

eksisionaza

pomagający w wycięciu faga i IHF.

W jednej orientacji promotor operonu H2 może transkrybować operon który

zawiera dwa geny: H2 i rh1 koduje represor, który blokuje transkrypcję genu

H1. W ten sposób flagelina H2 jest syntetyzowana natomiast, H1 nie jest

syntetyzowana. Jednakże, często

rekombinaza Hin

powoduje inwersję, która

odwraca promotor o 180

o

co odsuwa promotor od operonu H2. Wtedy nie jest

syntetyzowana H2 flagelina i represor Rh1. Natomiast gen H1 jest

transkrybowany i flagelina H1 jest syntetyzowana.

Zmienność fazowa

Salmonella

Gen

hin odpowiada za syntezę

rekombinazy Hin

, która działa

podobnie

do transposaz

, rozpoznaje końce (odwrócone powtórzenia i odwraca

odcinek DNA.

Crossing-over i rekombinacja między

homologicznymi regionami chromosomów

Mechanizm rekombinacji homologicznej

I

Struktura Holliday’a

Region heterodupleksu

Mechanizm rekombinacji homologicznej

W zależności od tego jak zostaną

rozcięte struktury Hollidaya

powstaną rekombinanty lub nie

powstaną

Rozcięcie wzdłuż linii

V i religacja

Horyzontalne

cięcie i

religacja

Heterodupleks i rekombinanty

Heterodupleks i brak

rekombinantów

Białka w rekombinacji homologicznej



RecA

– ATP-aza promuje parowanie zasad między ssDNA i dsDNA,

odpowiada za tzw. asymilację

lub pobranie ssDNA



RecBCD

– egzonukleaza degradująca DNA (tzw. egzonukleaza V),

helikaza w obecności białka SSB



RuvA

–rozpoznaje strukturę Hollidaya i pomaga helikazie RuvB w

przeprowadzaniu procesu migracji nici DNA



RuvB

- ATP-aza dostarcza energii do poruszania się pasm, tworzy

heksamerowy pierścień naokoło dupleksu, łączy dsDNA (nie ssDNA)



RuvC

– endonukleaza, rozpoznaje i przecina strukturę Hollidaya.

Rozcina dwa z czterech pasm, w różnych płaszczyznach



Topoizomerazy

I i II