SPRAWDZIAN ĆWICZENIOWY I
AMINOKWASY I BIAŁKA, ENZYMY
Aminokwasy, peptydy i białka:
budowa (wzory chemiczne aminokwasów), wiązanie peptydowe, struktury I- , II- , III- i IV- rzędowe, motywy i domeny funkcjonalne,
właściwości chemiczne: właściwości kwasowo-zasadowe, punkt izoelektryczny,
techniki rozdziału
Funkcje biologiczne aminokwasów, peptydów i białek:
podział aminokwasów na egzogenne i endogenne, hydrofobowe i hydrofilowe, pochodne aminokwasów jako neurotransmitery i hormony
peptydy biologicznie czynne (glutation, hormony, antybiotyki)
białka: strukturalne, enzymatyczne, transportowe,odpornościowe, hormony, toksyny
zależność między budową a funkcją białek na przykładzie białek fibrylarnych: kolagen, keratyna, elastyna, miozyna, oraz białek globularnych: mioglobina i hemoglobina (allosteryczność, efekt Bohra, regulatory allosteryczne, hemoglobiny patologiczne),
białka osocza krwi i ich funkcje.
Potranslacyjne modyfikacje białek
glikacje,
fosforylacje,
acylacje;
białka złożone
Klasyfikacja enzymów – typy reakcji katalizowanych przez poszczególne klasy enzymów.
Budowa enzymów – zależność między budową i funkcją:
budowa części białkowej, centrum katalityczne,
kofaktory oraz witaminy będące ich prekursorami
swoistość działania enzymów,
aktywność całkowita i specyficzna, jednostki aktywności.
Mechanizmy działania enzymów:
mechanizmy działania chymotrypsyny i transaminaz,
typy katalizy enzymatycznej przy dwóch substratach.
Kinetyka reakcji enzymatycznych – model Michaelisa – Menten:
szybkość reakcji (równanie kinetyczne; wartości Vmax i KM),
czynniki wpływające na szybkość reakcji enzymatycznej,
rodzaje inhibicji odwracalnej (konkurencyjna, niekonkurencyjna), stała inhibitorowa (Ki), hamowanie nieodwracalne.
Enzymy allosteryczne:
kinetyka (wykres zależności V od [S] ),
zjawisko kooperatywności, efektory
mechanizm działania ( sekwencyjny i jednoprzejściowy).
Regulacja metabolizmu poprzez kontrolę aktywności enzymów:
regulacja przez sprzężenie zwrotne
regulacja kowalencyjna
aktywacja proteolityczna na przykładzie proteaz trzustkowych
izoenzymy – przykłady izoenzymów tkankowych i rozwojowych, znaczenie fizjologiczne zjawiska izoenzymii.
10. Znaczenie diagnostyczne pomiarów aktywności enzymów (LDH, fosfatazy kwaśne i zasadowe, transaminazy).
SPRAWDZIAN ĆWICZENIOWY II
UTLENIANIA BIOLOGICZNE
Błony - struktura, organizacja i funkcja
składniki lipidowe błon,
białka integralne i peryferyjne,
przepuszczalność błon biologicznych.
Transport przez błony biologiczne:
bierny - kanały jonowe (sodowy, wapniowy, potasowy i kationowy niespecyficzny),
bierny wspomagany - (transport anionów kwasowych i ADP/ATP przez błony mitochondrialne)
aktywny - pompy (sodowo-potasowa, protonowo-potasowa.
Transport atomów wodoru przez błonę mitochondrialną:
układ wahadłowy („mostek”) glicerolo-3-fosforanowy,
układ wahadłowy („mostek”) szczawiooctan – jabłczan – asparaginian.
Utlenianie biologiczne:
enzymy uczestniczące w utlenianiu i redukcji (oksydazy, dehydrogenazy, peroksydazy, i oksygenazy)
Łańcuch oddechowy:
potencjały oksydacyjno-redukcyjne, przewidywanie kierunku reakcji na podstawie potencjałów red-oks,
lokalizacja łańcucha oddechowego,
kompleksy łańcucha oddechowego (budowa i funkcja),
inhibitory
Fosforylacja oksydacyjna:
mechanizm sprzężenia utleniań w łańcuchu oddechowym z fosforylacją ADP,
błonowa syntaza ATP (budowa, mechanizm dzialania)
czynniki rozkojarzające i inhibitory
Stres oksydacyjny a potencjał antyoksydacyjny organizmu:
reaktywne formy tlenu, znaczenie biologiczne procesów z ich udziałem,
mechanizmy obronne komórek: dysmutaza ponadtlenkowa, katalaza, peroksydazy ( reakcje katalizowane przez te enzymy), drobnocząsteczkowe antyoksydanty
rola stresu oksydacyjnego w patogenezie.
Procesy utleniań w mikrosomach:
lokalizacja i znaczenie procesów,
enzymy biorące udział w tych procesach (oksydazy i oksygenzy),
rola cytochromu P-450.
Cykl Krebsa:
reakcje i regulacja cyklu,
znaczenie cyklu - powiązania z innymi przemianami ( miejsca powstawania związków wysokoenergetycznych na poziomie substratu i w tlenowej fosforylacji, metabolity glukogenne i wykorzystywane do syntezy aminokwasów endogennych),
kompleks dehydrogenazy a-ketokwasów: enzymy i koenzymy kompleksu, mechanizm tlenowej dekarboksylacji pirogronianu i a-ketoglutaranu.
Ćwiczenia laboratoryjne:
1. Ilościowe oznaczanie witaminy C.
2. Badanie reakcji katalizowanych przez dehydrogenazę bursztynianową i peroksydazę.
3. Oznaczanie aktywności katalazy.
SPRAWDZIAN ĆWICZENIOWY III
PRZEMIANA CUKRÓW
Budowa chemiczna, właściwości i funkcje cukrów prostych i złożonych (heteroglikany).
Trawienie węglowodanów i zaburzenia procesów trawiennych.
Wchłanianie i transport monosacharydów:
typy transportu (aktywny i bierny),
zróżnicowanie tkankowe transportu, regulacja hormonalna (rola insuliny),
fosforylacja monosacharydów: (znaczenie procesu, enzymy).
4. Przemiana glikogenu:
synteza glikogenu (reakcje, enzymy, regulacja),
fosforoliza glikogenu (reakcje, enzymy, regulacja),
zaburzenia przemiany glikogenu (przyczyny i typy glikogenoz).
5. Metabolizm glukozy:
glikoliza (lokalizacja, reakcje, enzymy, regulacja i znaczenie procesu, bilans energetyczny, powiązania z innymi przemianami, przemiany pirogronianu, losy mleczanu),
glukoneogeneza (lokalizacja, reakcje, enzymy, regulacja i znaczenie procesu),
cykl pentozofosforanowy (lokalizacja, reakcje, enzymy, regulacja i znaczenie procesu),
6. Przemiana innych monosacharydów:
przemiana fruktozy – zaburzenia,
przemiana galaktozy – zaburzenia.
7. Glikoproteiny i ich funkcje biologiczne:
składniki cukrowe, cukry nukleotydowie
typy połączeń części cukrowej z białkiem
substancje grupowe krwi
udział glikoprotein w patogenezie niektórych chorób.
8. Proteoglikany i ich funkcje biologiczne
struktura glikozaminoglikanów
mukopolisacharydozy i mukolipidozy.
9. Regulacja przemian cukrów:
regulacja hormonalna metabolizmu węglowodanów (insulina, glukagon, adrenalina: mechanizm działania i rola),
zróżnicowanie tkankowe przemiany cukrowej (wątroba, mózg, mięśnie, adipocyty, erytrocyty),
rola wątroby w ogólnoustrojowej gospodarce węglowodanowej,
zaburzenia regulacji gospodarki węglowodanowej.
Ćwiczenia laboratoryjne:
Ilościowe oznaczanie cukrów redukujących metodą Nelsona.
Wpływ pH na aktywność sacharazy.
Rozkład glikogenu przez enzymy z mięśni.