2008/2009

1. jak duzy klonowany DNA mozemy umiescic: plazmidzie, fagu, sztucznych chromosomach
2. co ta sa miejsca att
3. jakimi sekwencjami sa ograniczone klony w wektorze niezdolnym do transkrypcji (attL1 i L2)
4. ile procent stanowiły klony negatywne
5. mutacje w p53 a apoptoza
4. cos o kolagenie- który okres warunkuje stabilność chyba
5.krzywe kaplana-mayera
6. jaka wartość rokowniczą ma NM23
7. produkty genów o znaczeniu rokowniczym w raku okręznicy
8. cos o hipoksji w guzach
9. markery nowotworowych komórek pseudośródnabłonkowych
10. angiostatyna- mechanizm działania
11. co to linia komórkowa
12. co to hodowla in vitro
13. pasażowanie
14. kom. adherentne
15. komora laminarna
16. jak duzy wycinek pobieramy zeby wyhodowac fibroblasty
17. jak sie odddziela naskorek od skory
18.jak sie uzyskuje pojedyncze kom. naskorka
19. po ilu podzialach zanika akt. replikacyjna
20. kiedy wykonujemy krioprezerwacje?
21. obrazek mlode/stare keratynocyty

22. jak można uzyskać domeny białkowe bez wykorzystania inżynierii genetycznej
23. dendrogram
24. biblioteki genowe
25. penetracja tlenu w guzie - 1mm
26. warunki hodowli keratynocytów
27. osteogenesis imperfecta
28. choroba reumatyczna czy coś takiego(?)
29. co pogarsza rokowanie w raku sutka- MMP2,MMP9, czy rośnie, czy maleje
30. aktywatory angiogenezy
31. kompleks MRE11
32. mutacja genu- głuchota
33. mikromacierze- zastosowanie
34. coś o fibronektynie
35. mapowanie genów
36. cyklina D, jakieś inne literki- czy rosną czy maleją w nowotworach
37. co może być materiałem do klonowania
38. wymagane sekwencje podczas klonowania- ori, amp, ...?

2010/2011

To co pamiętam (ok..10 się powtórzyło):
- Na którym chromosomie jest kodowany Czynnik Von Willebranda - 12 (
nie sugerować się zapisem p i q, dokładnym locus genu..po prostu
wybrać odpowiedni chromosom, całe szczęście Zbysiu jest na tyle ludzki
ze nie daje tych samych chromosomów)
- Chromosom z fenyloketonurią
- Delecja jakiego aminokwasu występuje najczęściej przy fenyloketonuri
- To samo tyle ze z mukowiscydozą
- źródło komórek macierzystych - blastocysta, dziesięciodniowy zarodek
ludzki i listwy płciowe...
- był długi opis choroby z możliwymi odpowiedziami: CCD (central core
disease), dystrofia mięsniowa duchen like (coś takiego)..2 nie
pamiętam..
- chyba było gdzie wystepuje gen dla B-galaktozydazy ( pojawiają się
też pytania na testach jaki kolor przyjmują odpowiednie kolonie: "pUC
- zawierający gen lac Z kodujący β- galaktozydazę działającą na
substrat X-gal w wyniku czego powstaje barwny produkt- niebieski
(plazmid pUC ze wstawką -obcym DNA); gdy gen lac Z jest nieczynny,
powstają kolonie białe. ")
- Dużo pytań o rekombinacje homologiczną - 3-4, głównie o to jaki
kompleks powstaje w pierwszym etapie, co jest nicią atakującą.
- wymień charakterystyczną cechę enzymów restrykcyjnych: odpowiedzi do
wyboru - tworzą tępę końce, tworzą lepkie końce i coś jeszcze ;p
- Która metoda pozwala na sekwencjonowanie w czasie rzeczywistym -
pirosekwencjonowanie
- chyba był bakulowirus?
- co oznacza zapis 46 X, (Xiq)
- technika wykorzystująca fluorescencję - FISH
- coś z porównywawczą hybrydyzacją genomową - chyba do czego wykorzystujemy..
- kwas hialuronowy - co się w nim powtarza
- co to jest by stander effect i gdzie go wykorzystujemy
- dlaczego są lepiej tolerowane komórki krwi pępowinowej niż inne..
- Beta-kateina co aktywuje
- w mięsaku Kaposiego stwierdzamy - kolagen XIX
- wskaż prawidłowe połączenie z macierzą pozakomórkową -
Kadheryny/filamenty aktynowe , integryny/filamenty pośrednie
(wszystkie możliwe kombinacje z tego)
- chyba jaki kolagen w chrząstce - ...
- aaa no i coup de grâcec / cresendo Zbysia- jakie aminokwasy
pozwalają na identyfikacje fibronektyny - [ ..:: ? ? ? ::.. ]

2011/2012

pierwszy test z wykładów powtórzony. drugi mamy w tym tygodniu.

UPDATE: drugi test również się powtórzył

a to zbieranina pytań z zaliczeń bloków:

Test u dr Pokory:
1.Częstość występowania zespołu Klinefeltera
2.Wskazać prawidłową definicję wśród nieprawidłowych - Southern-Blot, RT-PCR, mikroczipy DNA,...
3.Wektor 2 mi - episomalny plazmi drożdżowy.
4.Transpozony - rekombinacja nieuprawniona
5.Gen pUC odpowiada u E.coli odpowiada za - niebieskie zabarwienie kolonii
6.Coś o AcMNPV - że uzywane są komórki Sf9 i SF21
7.W met. Sangera nie używamy w mieszaninie
8.Fragment Klenowa - polimeraza
9.Miejsce inicjacji replikacji, centromer, telomery - YAC
10.Wektory wahadłowe - co to jest
11.Poprawna kolejność procesów zachodzących podczas pracy oczyszczania plazmidowego DNA - wszystkie prawidłowe (?)
12.Wektory plazmidowe są używane w klonowaniu terapeutycznym ze względu na szybkość namnażania w komórkach gospodarza
13.Najczęstsza aneuploidia - z.Turnera, z.Downa, z.Edwardsa, z.Klinefeltera (?)
14.Mutacja w genie kodującym kanał sodowy w chorobie LQT -> LQT3
15.Coś o mukowiscydozie i NBD
16.Defekt, którego enzymu w MPS IV = z.Mirquio - B-galaktozydaza lub 6-sulfataza galaktozaminy
17.Rzekoma choroba von Willebranda - brak dużych multimerów vWF w krążeniu
18.W zespole Goodpasteure'a mamy przeciwciała przeciwko łańcuchowi alfa kolagenu - IV
19.ADAMTS-2 -> zespół Ehlersa - Danlosa VIIC
20.Choroba Glanzmanna - defekt integryn
21.Enaktyna - łączy kolagen IV z lamininą
22.Pęcherzyca zwykła - autoprzeciwciała przeciwko desmogleinie 3
23.Opis zespołu Williamsa - elfia twarz
24.Jakiej metody genetycznej użyjesz, aby wykryć zespół Angelmana - CGH
25.Do FISH możemy badać chromosomy meta-,pro- i interfazowe (?)
26.Pytanie co to jest EMBL
27.M13 - kopiowanie jednoniciowego DNA

z zapamiętanych pytań od sz.p. mgr Sieronia:

- prążki R- przeciwieństwo prążków G
- co to jest CESH - Pierwsza technika pokazująca pełen profil ekspresji genów bezpośrednio w chromosomach (Lu et al., 2001). Zasad taka sama jak w przypadku CGH.
- house keeping - podstawa w każdej kom.
- co musi mieć wektor - na pewno ORI i gen selektywny
- co aktywuje kinazę C - DAG
- nadmiar zębów wyst. w chorobie - dysplazji obojczykowo-czaszkowej
- co to jest transdyferencjacja
- przykładami genów reporterowych są...
- temp. denaturacji nici - 94
- za dystrofię D. i B. odpowiada mutacja w genie - DMD
- funkcja propeptydu w kolagenie
- modyfikacja FISH w której każda para chromosomów ma inny kolor - SKY
- barwienie Giemsy uwidacznia - prążki G
- chromosom Y należy do gr. G
- opis genu i jak to zapiszesz

mgr Sieroń

1. Skąd pozyskujemy kom embrionalne?
a. blastocysta
b. cewa nerwowa
c. krew pepowinowa
d. ?

2. Fosfataza alkaliczna co robi z plazmidem?
a. hamowanie restrykcji
b. fosforylacja koncow nici DNA
c. wydluzanie linijne
d. splatanie superhelis

3. prążki R:
a. dużo AT
b. dużo GT
c.?
d.?

4. prązek G co przedstawia?
a. heterochromatyne
b. euchromatyne
c. centromer
d.?

5. Liczba prążkow zalezy od:
a. czasu barwienia
b. rodzaju komórki
c. nie zależy/brak zależności ( nie pamietam dokladnie jak to szło)
d. stopnia kondensacji chromatyny

6. Temperatura elongacji PCR - 72 st

7. Temp. działania enzymow restrykcyjnych?

8. Mutacja RUNX2 - dystrofia obojczykowo-czaszkowa

9. Gdzie filamenty pośrednie łączą się z białkami?
a.desmosom
b.hemidesmosom
c.nexus
d.strefa przylegania (nie pamietam czy byla ta odpowiedz ;/)

10. Co pobudza fibroblasty do wydzielania prokolagenu ? - wit C
11. Zahamowanie wrzeciona kariokinetycznego, co?
a.bufor fosforanowy
b. wit c
c. kwas borowy(?)
d.?

12. "Fra" w obrazie cytogenetycznym - miejsce złamania chromosomu
13. Jaki zapis - ramię krótkie chromosomu X, pierwszy prążek, drugi podprążek:
a.Xp21.2
b Xp2.1.2
c.Xp 22.1
d. Xq....

14. Komplementacja genu:
a. mutacja dominująca
b. mutacja recesywna
c.?
d.?

15. Hamowanie w których mutacjach się wykorzystuje jako leczenie:
a. mutacja dominujaca
b. recesywna
c. zakazenia wirusami
d. a i c

16. Lipopleksy ( wprowadzanie DNA do ludzkich komórek, na jakiej zasadzie):
a. transformacja
b. transdukcja.
c. transfikacja
d. brak poprawnej odp

17. Holiday, kolejnosc kombinacji (?)
18. "house keeping' :
a. wzrost ekspresji wraz z różnicowaniem się kom macierzystych
b. taka sama ekspresja we wszystkich komórkach
c. ?
d?

19. DAG - aktywacja - kinazy C białkowej
20, Nabłonek:
a.kolagen IV
b.kolagen I
c. kolagen III
d.?

21. Zespół Goodspastera - IgG
22. 750 aminokwasów - elastyna
23. propeptyd odcina - BMP1
24. jak rosnie PCR - 2 do n
25. matrycą może być do klonowania :
a. hodowla fibroblastów DNA
b DNA z kom macierzystych
c. DNA z krwi
d.?

26. Rekombinacja homologiczna
a-. napraw 1-niciowy DNA
b. naprawa 2-niciowy DNA
c. crossing-over
d. wszystkie odp prawidlowe

27. Kiedy wzrost swoistości ekspresji wprowadzonego genu?
a. swoistość ligandó dla receptora
b. swoistość promotora swoistego dla tkanki
c. a i b
d. brak poprawnej

28. Jaka grupa 6-12 + X chromosomów - C ( odpowiedzi byly A, B, C, D )
29. Cytometria przepływowa - wszystko (d)
30. Western blott - białko troche tego belkotu ktory zapamiętałam aczkolwiek mgr sieron z wielka radoscia mowil ze nie powtarza pytan..

1. choroba tkanki łącznej z niedoborem miedzi - menkesa (chociaz początkowo w kluczu miał goodpasteure'a lol)
2. prawda o PG/GAG - kurczą się w (-)
3. miesnie lacza się przez alfa-dystroglikan czy cos z - lamininą
4. jaka modyfikacja kolagenu zachodzi w er- odcinanie c-propeptydu, odcinanie n-propeptydu, i jakas która chyba miala być dobra
5. co barwi metoda CREST albo co swieci ? chyba CREST.. - \
6. rodzaje c-proteinazy - odp. BMP-1, BMP-1/His, mTLB
7. czemu PG/GAG mają dlugi okres przezycia? - bo dlugo trwa proces detoksykacji
8. jaki enzym aktywuje fosfoinozytol - fosfolipaza C ? bodajze
9. w których prazkach wystepuje euchromatyna? - wedlug Sieronia w prazkach G ;p
10. co jest w prazkach C? - heterochromatyna
11. cos o fazie plateau w PCR
12. wektory wg wzrostu pojmności? - plazmid, kosmid , YAC
13. jakies restryktazy *#$&@Q(# <- o podobnej nazwie - tną w niespecyficznych miejscach
14. co nie jest POŚREDNIĄ metodą niszczenia nowotworów ? - wszczepianie genow samobojczych
15. co nie jest dobra metoda na leczenie mutacji monogenowych? - wszczepianie dobrego genu ?

i to jeszcze do poprzedniego:


w 15 jeszcze była inaktywacja i korekcja mutacji albo dobre inaktywacja i wszczepianie nowego genu ( w sensie a i c )

16. gdzie znajduje się miejsce polilinker w wektorze

17. było coś że materiał genetyczny wprowadzony do plazmidu i namnażany w bakteriach to a. biblioteka dna b. wektor wahadlowy i jeszcze jakies dwie odpowiedzi

18. cechami wektorów wirusowych stosowanych w biolologii molekularnej są a. sa zdolne do zakażenia komórki b. nie są zdolne do samodzielnego rozmnazania w komórkach. c a i b .d żadna nieprawidłowa

19. co decyduje o hydrfilności mazierzy pozakomórkowej - chyba proteoglikany i GAGi

20. było coś o obróbce DNA i nie pamiętam nawet dobrej odpowiedzi

Do genów House keeping należy .. nie wiem jaka była prawidłowa

22. Geny house keeping odpowiedzialne sa za metabolzim komórki ? cos w tym stylu

23. powtórzyło się pytanie gdzie odpowiedź była że prążkowanie ( chyba ? ) zalezy od stopnia kondensacji chromatyny

24. alfa dekstroglikan łączy się odp. z lamininą // pewne

25. cechą proteoglikanów prócz hydrofilności jest : chyba to że sie kurczy w ładunku ujemnym

---