HisTaq w białku rekombinantowym.
występuje z nim w formie koniugatu (0)
nie można wykrywać western blotem (0)
Można oczyszczać metodą powinowadztwa chromatografii (1)
Wykorzystywany do detekcji (1)
Yac
można stosować do pozycyjnego klonowania (1) - chyba
ma postać liniową (1)
zawiera marker selekcyjny oporności na antybiotyki (1)
zawiera marker komplementujący mutacje auksotroficzne (1)
Polimerazy RNA
do syntezy sond RNA
do amplifikacji RNA
wymagają do działania promotorów
wymagają do działania oligonukleotydów
Amplifikacja RNA
transkrypcja In vitro
polimeraza RNA T3
cDNA
Cięcia restrykcyjnego wymagają metody:
Tail PCR (0)
Inverce PCR (1)
Vectorette (1)
cDNA AFLP (1)
Wewnątrzcząsteczkowa ligacja:
Inverse PCR (1)
DD PCR
Synteza cDNA w metodach: -> też różne wymienione w tym było primer extension
Geny wirulencji
mają białka potrzebne do procesu transformacji
odpowiadają za transfer koniugacyjny
są przenoszone do jądra
Oligonukleotydy Dna
mogą być wykorzystywane jako adaptery i linkery (1)
mogą być zdegenerowane - ?
na końcu 3' znakowane nukleotydami selekcyjnymi ( albo to mogło być w innym pytaniu)
niepełne dopasowanie oligonukleotydu do matrycy uniemożliwia dalszą syntezę (0) - chyba
Metoda Maxama- Gilberta
chemiczna degradacja końców DNA
nie trzeba stosować rozdziału w żelu
syntetyzowane są fragmenty DNA
Directional forcet cloning
transgen można wstawić w wybrane miejsce w genomie
14.CDNA AFLP
a) mniejsza czułość niż hybrydyzacja + /- i różnicowa (0)
b) DNA ma postać dwuniciową (1) - cDNA ma postać 2 niciową
c) dwustopniowa amplifikacja (1)
(d) tu coś innego niż na 1szym terminie)
16. System dwuhybrydowy u drożdzy:
a) bazuje na aktywności genu reporterowego którego ekspresję można wzbudzić przez połączenie się białek przynęty i zdobyczy (1)
b) umożliwia klonowanie białek oddziałujących ze znanymi białkami (0)
c) bazuje na białku fuzyjnym powstałym z DBD stanowiącym miejsce wiązania DNA a przynętą (0)
d) Bazuje na białku fuzyjnym powstałym z AD i zdobyczy (1)
e jest to połączenie kowalencyjne
17. Diferential Display
18. Fragment Klenowa
a) nie ma funkcji korekcyjnej
b) wykorzystywany do Nick translation
c) znakowanie schowanych końców 3'
19.Real time PCR
a) mówi o wyjściowej liczbie kopii wziętej do reakcji (1)
b) nr cyklu w którym wartość fluorescencji osiaga progową - jeśli chodzi o wartość CT to (1)
c) coś o stężeniu matrycy - podobnie jak wyżej
d) mówi o całkowitym wysyceniu Dna sondą Tasman - jeśli jak wyżej to (0)
21. Biblioteki linking
a) enzym gęstotnący, ligacja, enzym rzadkotnący (1)
b) miejsca otaczające sekwencje enzymu radzkotnącego (1)
c) ominięcie sekwencji nieklonowalnych i powtzralnych (1)
22. do Inverce PRC uzywamy starterów:
a) o sekwencji znanej i nieznanej (0)
b) o sekwencji znanej i adaptera (0)
c) o sekwencji znanej i zdegradowanej (0)
d) sekwencji znanej i jakiejś ?
kinaze polinukleotydową
23. Homopolimer tailing:
a) coś z ligacją
b) regeneracja końców
24. Polimeraza Taq
25. Rekombinacja homologiczna
26. Kolonowanie ukierunkowane:
a) wymusza miejsce
b) wymusza orientacje
28. Hybrydyzacja różniocowa Yep
30. Spacer po chromosomie:
a) sekwencje terminalne jako sondy
31. Do pozycyjnego klonowania genu metodą spaceru po chromosomie wykorzystuje się:
A) informacje w markerach molekularnych 1
B)biblioteki genomowe w wektorach BAC lub YAC 1?
C) sondy.....
32. Biblioteki linking (sprzęgające):
A) ?pozwalają na klonowanie? krótki odcinków w pobliżu miejsca restrykcyjnego 0/1
D)Pozwalają uniknąć problemów spowodowanych przez sekwencje nieklonowane i powtarzalne 0/1
33. Markery blisko sprzężone z poszukiwanym genem
a)u roslin o duzych genomach łatwiej znaleźć poszukiwany gen
b)chyba chodzilo o jakies gatunki spokrewnione izo…
c) metoda chromosome landing tylko gdy to nie sa markery molekularne
34. Bałko rekombinantowe25. Gen reporterowy proteomika
35. Touchdown PCR:
A) temperatura idzie do góry 0
B) używamy startera arbitralnego 1
C) polimerazę dodajemy pod warstwą wosku 0
36. Forward genetics [odwrotna genetyka]
A) Punktem wyjścia dla... charakterystyki docelowego genu jest fenotyp molekularny
B)Punktem wyjścia jest... gen, który poddaje się mutacji w celu poznania jego funkcji
C)Mozna wykorzystać... funkcjonalne fenokopie zmutowanych...
37 . Inverse PCR
a) uzywamy starterów o krótkich sekw. znanych i nieznanych
b) uzywamy starterów o sekwencji znanej i adaptora
c) sekwencji znanej i zdegenerowanej (zdegradowanej) nie pamietam
d) sekwencji znanej i jakiejs na amfilo czy cos nie pamietam
38.Hybrydyzacja plus-minus:
c)wykorzystywana do klonowania genów represorowych przez transkrypcje dla badanej populacji komórek
Drożdżowy system dwuhybrydowy
1)aktywuje geny receptorowe
2)wykorzystanie białka zawierającego domenę AD (chyba domenę transaktywującą) i i wiążacego się z przynęta
3)wykorzystanie białka zawierającego domenę DB (wiążącą DNA) i będącego przynętą
4)klasyfikacja genu kodującego białko zawierające domenę oddziałującą z innymi białkami
39markery blisko sprzezone z poszukiwanym genem
-u roslin o duzych genomach
-chyba chodzilo o jakies gatunki spokrewnione ?
-metoda chromosome landind ale tylko gdy to nie sa markery molekularne
40. Wektor binarny:
b)moze byc dostraczany (czy cos w ten desen) metodą koniugacji trójrodzicielkiej .....................(0) 1?
c) nie ma sekwencji homologicznych z Ti....(1)? ma sekwencje homologiczną do Ti (1)
41. Wlasciwość egzonukleazowa 5->3 polimerazy Taq:
b) odpowiada za dużą wierność klonu ..............................................................................................(0)
c) powoduje tępy koniec produktu PCR ...........................................................................................(0)1
42. W pirosekwencjonowaniu
c) luminescencja konsekwencją reakcji odlaczenia sie pirofosforanu................................................ (1)0
d) usuwamy nadmiar dNTPów i ATP ................................................................................................(1)?
43. Mikromacierze
d) tożsamość DNA nieznana ...............................................................................................????..........(0)