KOLOKWIUM 1:
1. Cechy dziedziczenia autosomalnego dominującego:
- pionowa transmisja choroby
- jednakowa częstość występowania u obu płci
- występuje u heterozygot
2. Gen zawiera:
- promotor
- intron
- egzon
- 3' UTR
3. Z czego można wyizolować DNA:
- wszystko prócz erytrocytów i krwi pobranej na skrzep
4. Gdzie występuje DNA:
- jądro
- mitochondria
5. Co warunkuje specyficzność reakcji PCR:
- primery
6. PCR:
- wszystko prócz tego, że PCR jest rutynowym sposobem sprawdzania czegoś tam
7. W reakcji PCR wykorzystuje się:
- 2 primery
- DTP
- pomilerazę DNA
8. Elektroforeza:
- DNA migruje od - do + (w kierunku anody)
- bromek etydyny sprawia, że DNA jest widoczne
9. Etapy reakcji PCR:
- denaturacja
- dodawanie primerów
- synteza (elongacja)
10. W sekwencjonowaniu występuje:
- PCR preparatywny
- PCR sekwencyjny
- elektroforeza
(bez izolacji i barwienia)
11. W PCR sekwencyjnym wykorzystuje się:
- 1 primer
- ddNTP
- polimerazę DNA
12. Materiał najczęściej wykorzystywany do badań:
- z DNA
(nie z białek, RNA itp.)
13. Zasady występujące w DNA
- A, T, G, C
14. PCR sekwencyjny:
- matrycą jest produkt PCR
(nie służy do rozdziału białek)
15. Cechy dziedziczenia recesywnego:
- występuje u homozygot
- jednakowa częstość występowania u obu płci
- pozioma transmisja choroby
16. Gen to:
- fragment DNA kodujący białko
17. Co to jest mutacja
18. Real-Time PCR:
- pozwala kontrolować wyniki podczas trwania PCRu
- nie stosuje się elektroforezy
- używa się barwników
- namnożenie in vitro
KOLOKWIUM 2
1. Mutacje predysponujące do nowotworów:
- germinalne
- konstytucyjne
2. odp prawidłowe to "populacja homogenna" i "mutacje założycielskie" ale nie wiem jakie było pytanie:(
3. Mutacje założycielskie:
- występują w populacji homogennej
- występują w Polsce
- dziedziczą się
- powstają od jednego przodka
4. W inicjacji transkrypcji udział biorą:
- elementy cis i trans
5. W regulacji ekspresji genów udział biorą
- elementy cis (związane z promotorem)
(nie biorą udziału elementy trans, które są czynnikiem transkrypcyjnym)
6. W translacji udział biorą:
- rybosomy
- tRNA
- mRNA
7. Biosynteza białka - ogólne informacje
8. Związki mające strukturę 3- i 4-rzędową:
-białka
9. Modyfikacja pre-mRNA polega na:
- dodaniu czapeczki cap
- dodaniu łańcucha poliadenylowego
- wycięciu intronów
10. Substytucja 1 nukleotydu może spowodować:
- mutacje missense
- mutacje nonsense
- polimorfizm
11. Delecja A poza egzonem może spowodować:
- polimorfizm
- mutację regulatorową
- mutację miejsca splicingowego
(bez mutacji missense i nonsense)
12. Delecja A powoduje:
- frameshift
13. Mutacja w promotorze powoduje:
- dużą delecję całego genu
14. Mutacja splicing powoduje:
- delecję w egzonie
15. Jaka mutacja nie skraca białka:
- missense
16. Do syntezy RNA potrzeba:
- polimerazę RNA
- dNTP
- zaczyna się w promotorze
(nie potrzeba starterów)
17. Transkrypcja:
- zachodzi w jądrze
- powstaje mRNA
18. Cechy mutacji w egzonie:
- powoduje uszkodzenie białka
- powoduje choroby
KOLOKWIUM 3
1. Badania cytogenetyczne to:
- FISH
2. Wykryć aberracje chromosomową możemy za pomocą:
- kariotypu
- FISH
3. Kariotyp możemy wyizolować:
- z żywych komórek
4. Aberracje liczbowe to:
- 45, X
- 47, XY+21
5. 46, XY del3p oznacza:
- delecję ramienia krótkiego chromosomu 3
6. FISH:
- wykrywa aberracje chromosomalne
- można wykonywać na jądrach interfazalnych
- wykorzystuje się sondy
(nie służy do wykrywania małych mutacji)
7. Metody wykorzystujące komórki w interfazie:
- FISH
(nie kariotyp)
8. Metody wykrywania małych mutacji:
- SSCP
- DHPLC
- HET
- sekwencjonowanie
9. DHPLC:
- wykorzystuje heterodupleksy
- wykorzystuje analizę chromatograficzną
10. Zmiana wykryta dzięki DHPLC:
- może być mutacją
- może być polimorfizmem
- musi być zweryfikowana sekwencjonowaniem
11. Metoda o czułości bliskiej 100%
- DHPLC
12. Sekwencjonowanie wykrywa:
- substytucje
- delecje
- insercje
(nie wykrywa dużych delecji i aberracji chromosomalnych)
13. Metody wykrywania znanych mutacji:
- ASA-PCR
- TaqMan
- RFLP-PCR
14. Techniki wykorzystujące sondy molekularne:
- TaqMan
- FISH
15. Techniki wykorzystujące enzymy restrykcyjne:
- RFLP
- Southern Blotting
16. Gdzie wykorzystuje się 1niciowe DNA:
- SSCP
17. Dużą delecję wykryjemy za pomocą:
- Southern Blotting
- MPLA
18. MPLA:
- wykrywa duże delecje
- namnaża DNA
19. Metody cytogenetyczne:
- wykrywają delecję chromosomu
- FISH
20. Metody pośredniego wykrywania mutacji:
- HET
- SSCP
- DHPLC
(bez FISH)