fito druk, Ogrodnictwo UP Lbn, fittopatologia, ściągi testy egzaminy


FITOPATOLOGIA WYKŁAD 1 2006 - 02 - 20

FITOPATOLOGIA - nauka o chorobach roślin.

Choroba rośliny; negatywny wpływ pewnych czynników na organizmy roślinne powodujący zachwiania równowagi funkcjonowania organizmu roślinnego

Infekcyjne czynniki chorobotwórcze to główny obiekt zainteresowań fitopatologii. Jeden czynnik zakłóca równowagę biologiczną.

Patogeny to organiczne (żywe) czynniki chorobotwórcze rośliny

CZYNNIK CHOROBOTWÓRCZY - wszystko co nie jest rośliną, a występuje w środowisku rośliny,

PODZIAŁ:

TENDENCJE

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 2 2006 - 02 - 27

czynniki nieożywione chorobotwórcze;

zanieczyszczenia środowiska

chemiczne środki ochrony roślin

PATOGENY

żywe, chorobotwórcze czynniki infekcyjne.

- zakażają rośliny, żyją z nimi jako pasożyty

zachowanie patogenów:

- niektóre zakażają tylko jeden gatunek lub odmianę - Monofagi

- zakażają kilka gatunków lub kilkanaście - Oligofagi

- zakażają wszystkie rośliny - Polifagi

podział w zależności od miejsca występowania w roślinie:

- na powierzchni rośliny, do komórek skórki wrastają tylko ssawki itp. - PASOŻYTY ZEWNĘTRZNE

- wnikają do roślin i rozwijają się :

* wewnątrz komórek - INTRACERULARNE,

* rozwijają się między komórkami - INTERCELLULARNE

* takie które cały cykl rozwojowy odbywają wewnątrz komórek żywiciela - ENDOBIONY

Bardzo inwazyjne wnikanie patogenów do roślin powoduje groźne skutki uboczne

Podział ze względu na możliwość korzystania z roślin:

- pasożyty obligatoryjne, ścisłe, bezwzględne: żyją wyłącznie na żywych roślinach. Nie są padlinożercami, potrafią czerpać tylko pokarm z żywych komórek, dążą do tego aby nie zabić rośliny, bo nie miałyby z czego korzystać.

- pasożyty okolicznościowe, fakultatywne: są pasożytami wtedy tylko gdy część rośliny jest zabita, czerpią pokarm tylko z martwych roślin. Wydzielają substancje, które zabijają komórki roślinne, potem z tego korzystają.

- saprotrofy okolicznościowe: mogą pobierać pokarm zarówno z żywej jak i martwej rośliny. Są związane z cyklem rozwojowym roślin w sezonie wegetacji jest on pasożytem, a w zimie kiedy nie ma żywych roślin prowadzą saprotroficzny tryb życia, ich uzdolnienia pasożytnicze są bardzo duże, potrafią żyć z rośliną nie czyniąc jej dużej szkody, z reguły one wytwarzają najwięcej szkód np. nekrozy. ??

Rozpoznawanie patogenów

- to, że patogen jest obecny na roślinie to nie znaczy, że jest odpowiedzialny za chorobę,

Warunki świadczące o obecności prawdziwego patogenu, Postulaty kocha:

  1. za patogena można uznać organizm, który nie zawodnie jest izolowany ze wszystkich chorych roślin, zawsze jest na wszystkich chorych roślinach

  2. musimy wyizolowany organizm, hodować na pożywce, stworzyć jego kulturę i ją opisać.

  3. Organizmem pobranym z kultury musimy zarazić roślinę zdrową z tego samego gatunku i odtworzyć te same objawy

  4. Ze sztucznie zakażonej rośliny odzyskać patogena, utworzyć jego kulturę potwierdzić te same warunki.

- stosuje się je w przypadku chorób nowych

- nie dla wszystkich patogenów postulaty Kocha się spełniają np. przy wirusach, wiroidach, bo one nie żyją na pożywkach.

Wirusy

- Mejer (Niemcy)

- Iwanowski (Rosja)

- Bering (Holandia)

przepuścili sok z tytoniu przez filtry, okazało się, że sok wolny już od bakterii, był nadal zakażony i okazało się, że cos jeszcze mniejszego od bakterii infekuje rośliny - WIRUSY

Są to patogeny zwierząt, ludzi a także roślin. Wirusy są organizmami posiadającymi cech istot martwych i żywych, dlatego uznawane są za patogeny infekcyjne.

Wyróżniamy wirusy :

- pałeczkowate (sztywne, proste)

- nitkowate (wygięte, powyginane)

- kuliste - tak naprawdę wielościany - dwudziestościan foremny czyli IKOSAEDR.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 3 2006 - 03 - 06

WIRUSY:

mozaika tytoniu

Pałeczkowaty, trwały łatwo izolowany, posiada kanał w którym znajduje się kwas nukleinowy, związany z poszczególnymi jednostkami białkowymi, które tworzą okrywę i nadają kształt wirusowi (kapsyd). Wirus mozaiki tytoniu 64000 nukleotydów (RNA).

KONSTRUKCJA CZĄSTECZKI WIRUSA

CAŁA CZASTECZKA WIRUSA WIRION = KAPSYD + KWAS NUKLEINOWY

Niektóre wirusy posiadają dodatkową otoczkę glikoproteinową pożyczoną z komórki roślinnej.

Kapsomer, nukleokapsyd, podjednostka białkowa; peptyd o kowalencyjnych wiązaniach- pełni funkcję ochronną , zabezpiecza przed czynnikami np przed nukleazami. Składa się z 2300 podjednostek białkowych identycznych, w każdej z nich 158 aminokwasów. Struktura białka nie musi być zapisana w genomie - odtwarzana jest podczas namnażania.

Podjednostka morfologiczna, strukturalna - grupa podjednostek białkowych dających się wyróżnić w mikroskopie elektronowym lub w badaniach krystalograficznych (promieniowanie X)

izomeryczne wirusy:

IKOSAEDR (20 x 3 = 60) i podziały na 4 lub 9 co jest zmienione przez to, że podjednostki białkowe mogą układać się w polimerazy i heksametry tworzące podjednostki strukturalne b. dobrze zorganizowane wewnątrz cząsteczki wirusa.

pałeczki heliakalne, TMU:

6400 nukleotydów, 2130 podjednostek białkowych, 3 nukleotydy prawoskrętnej helisy ssRNA na I podjednostce, 15 - 18 mm średnicy kanał 2,3 nm, na 1 skok spirali 49 nukleotydów i 161/3 podjednostek białkowych

wirusy nitkowe:

powyginane ze względu na różnicę we wzajemnym oddziaływaniu, podjednostek białkowych w pobliżu małej i dużej średnicy,

WIRUSY

- występuje tu zjawisko rekombinacji genetycznej

- występuje tez pewna nieciągłość, różnice w sekwencjach kwasów nukleinowych,

Wirusy podobne do siebie różnią się w 10 % ustawieniem nukleotydów

Inne różnią się o 30 % sekwencją nukleotydów (innych różnic niż o 10 % i 30 % nie ma ) - czyli są homologiczne w 90 i 70 %.

Różnice w sekwencji to podstawa do wyróżniania gatunków, gatunki łączą się w rodzaje, rodzaje w rodziny i w rzędy.

Cechy wirusa są równo cenne, wirusy wielocząsteczkowe są podzielone - ich genom nie mieści się w jednej cząsteczce (dopiero po złączeniu cząsteczek tworzą całość).

Wyróżniamy

- dsDNA

- ssDNA

- dsRNA

- ssRNA(+)

- ssRNA(-)

ETAPY NAMNAŻANIA WIRUSÓW W GENOMIE (+) ssRNA;

  1. wirus wnika do komórki w czasie wnikania Lu zaraz potem RNA uwalnia się z okrywy białkowej.

  2. RNA wnika, wiąże się z rybosomami i ulega translacji do polimerazy RNA, a być może są tworzone i inne białka

  3. polimeraza RNA produkuje na wzorcu (+) RNA kopię (-) RNA

  4. kopia (-) RNA użytkowana jest przez polimerazę RNA do produkcji potomnych kopi (+) RNA i etapem pośrednim jest tzw. forma replikacyjna lub pośrednia; mogą być tworzone pełne kopie lub częściowe ( fragmenty) jednym z takich fragmentów może być Messenger dla białka kapsydu.

  5. Monocistronowy RNA będący messengerem dla białka kapsydu, ulega translacji i powstają duże ilości białka - kapsydu.

  6. podjednostki białka kapsydu i (+) RNA wirusa są montowane w nowe cząstki wirusa gromadzące się w cytoplazmie.

GENOM - zawsze DNA, fragmenty DNA przepisywane na RNA i na białka.

- ds. DNA Wirusy : Cullimovirus

Kolisty DNA 8 kb., ulega transkrypcji, druga nić jest niekodująca, ma dwa pękniecia, co tworzy dwie nici .

SORF zidentyfikowano funkcje;

I. transportowa

  1. wektory

III. kapsyd

IV. odwrotna transkryptaza

VI. inkluzje typu wirioklazmy

DNA replikuje się w procesie odwrotnej transkrypcji z pośrednią formą. RNA ds. RNA dostaje się do jądra komórkowego, pęknięcia zamykają się i jest używany jako mikrochromosom przez polimerazę RNA, z których jest mRNA dla ORF VI

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 4 2006 - 03 - 13

JAK WIRUS KORZYSTA ZE SWOJEGO ŻYWICIELA

Korzysta z aminokwasów i nukleotydów do budowy własnych cząstek, czasem z innych substancji (poliamidy, lipidy inne).

Do budowy cząstek wirusa jest potrzebna energii ATP.

Wirus angażuje układ translacyjny komórki (rybosomy, ARNA i inne związane z tym układem enzymy i czynniki) wykorzystywany jest układ rybosomów cytoplazmatycznych (80s) - nie ma dowodów by wirusy roślin były w stanie korzystać z innych układów rybosomów (np.. mitochondrialnych).

Wszelkie przemiany post translacyjne angażują również enzymy żywiciela

Transkrypcja, wirus buduje własne enzymy, ale np. replikacja TYMU-RNA składa się częściowo z peptydów gospodarza i CAUUMOWIRUSY- DNA; wnika do jądra i ulega transkrypcji do RNA przy zaangażowaniu polimerazy RNA zależy od DNA gospodarza.

Do biosyntezy wirusa wykorzystywane są też układy błon gospodarza - synteza RNA odbywa się w układzie związanych z błonami MMOVIRUS np. w inwaginacjach błon chloroplastów, białko wirusowe na retikulum endoplazmatycznym

Przemieszczanie wirusów na terenie komórki oraz we floemie też wymaga użytkowania mechanizmów transportowych gospodarza.

SZKODLIWOŚĆ WIRUSÓW POLEGA PRZEDE WSZYSTKIM NA TYM , ŻE UKŁAD TRANSLACYJNY GOSPODARZA, KTÓRY ZAMIAST BUDOWAĆ WŁASNE BIAŁKA BUDUJE PRZEDE WSZYSTKIM BIAŁKO KAPSYDU WIRUSA !!!

TRANSKAPSYDACJA : wymiana kapsydów po miedzy 2 cząsteczkami wirusa, MIESZANIEC FENOTYPOWY: powstaje nowa fenotypowo jednostka, ale nie dziedziczą się te cechy.

NAMNAŻANIE WIRUSÓW :

  1. etap -namnażanie kopi wirusa- czasem mogą zajść mutacje = przyczyna zmienności wirusa / dziedziczna.

- u wirusów może dochodzić do rekombinacji pomimo tego iż nie namnażają się one płciowo, dlatego w stosunku do wirusów używamy pojęcia gatunek.

- produkty mutacji i rekombinacji są zmiennością dziedziczną to prowadzi do dziedzicznej zmienności genetycznej, są również zmienności niedziedziczne w wyniku.

# zamiany płaszczami białkowymi podczas namnażanie - transkapsydacja

# mieszańce fenotypowe

- przenoszenie wirusa przez nicienie i owady zleży od budowy białka. Produkt transkapsydacji jest nowa jakością, ale nie jest to cecha dziedziczna. Transkapsydacja zmienność niedziedziczna, namnażanie się wirusa.

II. proces, produkty - mieszańce fenotypowe; nie całe kapsydy ulegają wymianie, tylko ich fragmenty, może to spowodować jednorazowe skutki ale nie jest to dziedziczne, namnażanie wirusa.

WYWOŁYWANIE CHORB PRZEZ WIRUSY

- zakażanie dużej liczby komórek naraz- mało prawdopodobne

- zakażanie małej liczby komórek i wirus przenosi się tez do innych komórek

TRANSPORT WIRUSA W ROŚLINIE

- wirus dostaje się do komórek skórki potem do komórek miękiszu palisadowego albo gąbczastego, potem do wiązek przewodzących hipoteza

- z komórek do komórek transportowane są przez plazmodesmy hipoteza

- zostało odkryte białko, które służy do transportowania przez plazmodesmy

# funkcje białka - struktura białka transportowego, pasuje do struktury błon komórkowych, plazmodesmy. Jeżeli doczepi się tu kwas nukleinowy wirusa zostaje przeciągnięty przez plasmodesmę ( pierwszy raz wykryto to w przypadku wirusa mozaiki tytoniu). Modyfikacja plasmodesm - białka transportowe poszerzają błony. Plazmodesmy się poszerzają.

8 GODZIN - tyle czasu wirus opanowuje 1 komórkę

- wirus może być transportowany przez Felom, najpierw do korzeni a potem dopiero do organów nadziemnych, doświadczenie Samuela

- niektóre wirusy mogą być transportowane przez Ksylem

Transport przez wiązki przewodzące przyspiesz czas w którym wirus opanowuje komórkę- kilka lub kilkanaście na godzinę.

ELEMENT WOLNY OD WIRUSA W ROŚLINIE - MERYSTEMY WIERZCHOŁKOWE , zarówno na łodydze jak i na korzeniu.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 5 2006 - 05 - 15

Ochrona roślin przed wirusami

  1. zdrowy materiał wyjściowy - rośliny z nasion i rozmnażane wegetatywnie

  2. ochrona przed wektorami

- gleba wolna od grzybów i nicieni

- chemiczna ochrona przed mszycami - przypadki przenoszenia trwałego i nietrwałego

- rośliny ochronne na obszarach pól

- folia odblaskowa

- opryskiwanie olejami,

odmiany odporne ( TOMU, PUX, PUV, PVM )

ochrona plantacji nasiennych i matecznych:

- absolutnie zdrowy materiał wyjściowy

- dostatecznie częsta i skuteczna kontrola zawartości

- izolacja od źródeł infekcji wektorów (przestrzeń i bariery; szklarnie )

- wyspecjalizowany personel, wyposażenie i świadomość

ciekawostki:

- wirycydy - inhibitory (Viarazol, chitozom)

- wakcynizacja (szczepienie ochronne)

- merystemy

- termoterapia

PRODUKCJA ZDROWYCH SADZONEK CHRYZANTEMY:

RODZAJE TESTÓW

- Biologiczne:

wykorzystywanie bioindykatorów, roślin wskaźnikowych, które zawsze dają(roślin wzorcowych)

zalety - prosty, bardzo wysoka czułość testu,

wady - objawy często otrzymujemy po długim okresie (standard 1 - 3 tygodnie)

- Serologiczne:

robimy surowice uczuloną na konkretny wirus na przykład surowice na pstrość tulipana.

zalety - bardzo szybkie (wynik w ciągu 0,5 godziny), prostota

wady - słaba czułość testu

Test Lateksowy:

Na kulkach lateksowych umieszczone są przeciwciała

Test Eliza:

Eliza skrót od pierwszych liter test imano sorpcji enzymu

Etapy :

- nakładamy do studzienki surowice (przeciwciała) - 4 godz. w 37 st. C

- płuczemy , odpada to co nie jest związane z płytką

- dodajemy wirus - 12 godz. w 4 st. C

- płuczemy

- dodajemy koniugat (surowica + enzym) wiązany przez wirusa

- dodajemy substrat , który zmienia barwę (natężenie barwy = natężenie cząstek wirusa).

RODZAJ TESTU

granice wykrywania wirusa

biologiczny

0,3 pg/ml

techniki serologiczne

1 ng / ml

1 - 10 ng / ml

percypitacja

test lateksowy

test Eliza

techniki

WAKCYNIZACJA :

Wprowadzamy do organizmu osłabiony / atenuowany wirus :

Zakaża on ale nie wywołuje objawów. Obecność wirusa hamuje uwalnianie RNA z wirusa - z płaszcza białkowego

TERMOTERAPIA :

Program odwirusowania chryzantemy

Wirus źle się namnaża w temperaturze 38 - 42 st. C - to co wyrośnie jest wolne od wirusa ; hodowla merystemów.

Wiroidy - wolne kwasy nukleinowe

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 6 2006 - 05 - 22

WIROIDY:

Nagi kwas nukleinowy, pozbawiony okrywy białkowej, są to bardzo krótkie kwasy nukleinowe, nie są w stanie kodować żadnego białka, nawet własnej replikacji !!!

Struktura wiroidów:

- jedno niciowy RNA, zachowujący w sposób szczególny, końce RNA są ze sobą związane, wiroidy są w postaci kolistych cząsteczek kwasów nukleinowych - struktura spinki do włosów.

- struktura drugo rzędowa RNA; rozgałęzione nici - struktura główki młotka

W zależności od struktury powstaje klasyfikacja:

1. rodz. POSPOVIROIDE - struktura spinki do włosów

2. rodz. ASSUNVIROIDE - (nie ma tu wyróżnionych domen) struktura główki od młotka

WIROIDY STANOWIĄCE POTENCJALNE ZAGROŻENIE ROŚLIN UPRAWNYCH:

  1. ziemniak - wiroid wrzecionowatość bulw ziemniaka, straty do 65 % przez ten wiroidy (wykryty przez SGGW)

  2. pomidor - wiroid karłowatości wrzecionowatej pomidora

  3. złocień - wiroid karłowatości złocienia, wiroid chlorotycznej plamistości złocienia

  4. ogórek - wiroid bladości ogórka

  5. chmiel - wiroid karłowatości chmielu, utajniony wiroid chmielu (wykryty przez SGGW)

  6. jabłoń - wiroid bliznowatości skórki jabłek (wykryty przez SGGW)

  7. brzoskwinia - wiroid utajnione mozaiki brzoskwini (wykryty przez SGGW)

Namnażanie :

- wiroidów wykorzystują d namnażanie już istniejącą w komórce polimerarazę RNA II

- mechanizm toczącego się koła

Pochodzenie wirusów:

  1. hipoteza- profesor Dimer - „ wiroidy to zbite introny ”, gdyby się intron usamodzielnił to mogłyby się wiroidy replikować z RNA roślinnego - mało prawdopodobne

  2. hipoteza- są to żywe skamieliny - SA one początkami życia. RNA może istnieć odrębnie.

Patogeny układu transkrypcyjnego

Praktyczne cechy wiroidów jako patogenów:

- z komórki do komórki transportowane przez plazmodesmy, w roślinach na duże odległości przez floem

- w przeciwieństwie do wirusów, wiroidy mają zdolność do atakowania komórek merystematycznych

- nie można ich wyeliminować przez wycinanie merystemów, ani przez termoterapię, bo one w wysokich temperaturach dobrze się rozmnażają (około 30 st. C.)

Przenoszenie z rośliny na roślinę:

  1. Mechanicznie przez sok

  2. Nie są przenoszone przez wektory, ale są wyjątki np. wiroid wrzecionowatości bulw ziemniaka

  3. Wiroidy jako takie nie SA przenoszone przez ptaki, chyba kwas nukleinowy schowa się do kapsydu wirusa to może być przeniesiony przez jakiegoś wektora

  4. Przenoszone z nasionami i z pyłkiem np. na rośliny zapylane, stwarza to problemy w hodowli twórczej

Ochrona :

- musimy mieć zdrowy materiał wyjściowy

- istotną sprawą jest wykrywanie wiroidów,

Testy biologiczne

Testy serologiczne - nie możliwe do wykonania, bo nie można wykryć białka - bo go nie ma !

Elektroforeza na żelu poliakryloamidowym - wyrywanie kwasu nukleinowego

Przy pomocy sondy molekularnej - sonda molekularna powstaje podczas odwrotnej transkrypcji, ma DNA odwrotne do DNA wiroida, metoda cDNA:

- nanosi się próbki kwasu nukleinowego; zapieka się, potem taką sondę się kąpie w cDNA sonda wtedy jest autoreaktywna - robimy autoradiogram, metoda bardzo czuła, bardzo mało wydajna, np. przy teście Elizy można zrobić w 3 osoby 1000 próbek w dwa dni, tutaj tylko 12, tą metodą można wykrywać też RNA wirusowe. Bardzo długi czas oczekiwania, kłopotliwa ; dobra dla ziemniaka bo i tak przechowujemy.

5 st. C przez 6 miesięcy (przechowujemy rośliny) - wycinamy merystemy - 20-80% roślin zdrowych, termoterapia w niskich temperaturach

PCR - powielanie materiału wiroida, potem stosuje się elektroforezę

RT.PCR - powielanie RNA wiroidowego, potem elektroforeza - test trochę gorszy od biologicznego.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 7 2006 - 05 - 29

FITOPLAZMY :

OMP - Organizmy mykoplazmatyczne

Są to prymitywne bakterie, mają roślinokształtne komórki, nie mają ściany komórkowej, zamiast tego mają trójwarstwową

Fitoplazmy to organizmy, bardzo proste, bez ściany komórkowej, maja tylko błonę 3 warstwową - dlatego maja nie określony kształt, niektóre występują w postaci nitkowatych spiralnych komórek -> SPIROPLAZMY

- Posiadają genom ( 5 x 10 8 Da) w postaci DNA, genom piroplazmy 2 razy większy.

- Nie mają jądra.

- Poza floemem fitoplazm nie ma, fitoplazmy przemieszczają się przez sita.

- Trudno je znaleźć w roślinie.

Próba INAKULACJI MECHANICZNEJ - próba przeniesienia patogena przez sok. Jeżeli próba ta się powiedzie to znaczy że chorobę spowodował wirus nie fitoplazma.

OBJAWY:

- zablokowany transport asymilatów, żółtaczki np. żółtaczka astra

- karłowatość (może wynikać z zaburzeń transportu, np. karłowatość maliny

- proliferacja pędów - wybijanie pąków śpiących, np. proliferacja jabłoni, pędy te wyrastają w dużej ilości z jednego miejsca - miotlastość

- odwrotna ewolucja kwiatów - liście zamiast płatków, kwiat koloru zielonego.

Patogeny zimują w roślinach i w wektorach np. w roślinach zimotrwałych

OCHRONA :

- należy wprowadzać zdrowy materiał wyjściowy,

- ochrona przed wektorami (skoczki, mrówki)

- kuracja antybiotykowa np. antybiotyki tetracykliczne, po zastosowaniu objawy cofają się po zakończeniu podawania antybiotyku objawy wracają - czyli nie zwalczone są fitoplazmy, zostaje wstrzymane tylko ich rozmnażanie.

Stosowanie antybiotyków w Polsce jest zakazane, bo gdy człowiek zje roślinę z antybiotykiem to będzie przyjmował dawki antybiotyku i bakterie się uodpornią - człowieka nie da się potem wyleczyć.

UWALNIANIE ROŚLIN OD FITOPLAZM:

- zabieg termiczny - kąpiele sadzonek w trzcinie cukrowej w wodzie w temperaturze52 st. C. na 10 15 minut - dezynfekcja.

Metody wykrywania fitoplazm:

- test DAPI - odczynnik barwiący DNA, tam gdzie jest dużo fitoplazm tam gdzie występuje dużo fitoplazm występuje barwienie

- test Eliza - na określone białka

- metody rozdziału DNA na różnych podłożach - techniki molekularne

BAKTERIE WŁAŚCIWE:

Budowa:

- materiał genetyczny - chromosom, nukleotyd, genofor (brak jądra) + plazmidy drobne komórki DNA (ich obecność i rozmieszczenie przyczyną zmienności), do niedawna uważano, że na plazmidzie są mało istotne cechy, ale okazało się, że tak nie jest.

- posiadają rzęski, organelle ruchu,

- cytoplazma - rybosomy, brak mitochondriów, mezosomy, które powstają przez wpuklenie plazmolemmy, chromatofory,

- fimbrie - krótsze od rzęsek i grubsze, ich rola nie jest do końca wyjaśniona(rola w koniugacji, pobieraniu pokarmu),

- ściana białkowo-lipidowa

Rozmnażanie:

- podział prosty w 0,5 h

- pączkowanie

Nie rozmnażają się płciowo !!!

4 zmienności dziedziczne;

- KONIUGACJA - wymiana materiału genetycznego (nie musi być w całości) to przyczyna zmienności dziedzicznej, nie jest to forma rozmnażania bo nie powstają nowe organizmy.

- Najczęstszą przyczyną zmienności u bakterii są MUTACJE, zachodzą one bardzo często u bakterii i często są dla nich bardzo pozytywne.

- TRANSFORMACJA GENETYCZNA : bakteria może pochłonąć materiał genetyczny innej komórki ( to nie koniugacja)

- TRANSDUKCJA : przenoszenie bakterii, przez bakteriofagi i zakażanie nowej bakterii.

Tworzenie przetrwalników - tworzą je bakterie patogeniczne - nie wiemy czy stanowią źródło zakażenia

Bakterie jako patogeny roślin:

- mogą zakażać poprzez zranienia

- mogą wnikać przez szparki i hydatody (szparki wodne),

- mogą wnikać przez nektarniki w dnach kwiatowych, mają tu dużo cukru - pożywka,

- mogą wnikać przez włośniki,

- mogą wnikać przez znamię słupka

Wszędzie tam gdzie nie ma kutikuli, bądź została uszkodzona.

W roślinach występują w przestrzeniach międzykomórkowych w miękiszu, często też w tkance przewodzącej w naczyniach, w miejscu występowania w roślinie widoczne są objawy :

AGROBACTERUIM; narośle na korzeniach, łodygach i duża ilość korzeni,

CORYNEBACTER; brunatnienie wiązek przewodzących, więdnięcie, (bakteria naczyniówka)

ERVINIA; zgnilizna , zgorzele, bakterie występują w miękiszu.

PSEUDOMONAS; plamistości , więdnięcie

XANTOMONAS; plamistości nekrozy nerwów, zgnilizny

STREPTOMYCETES; parch zwykły ziemniaka, zewnętrzne uszkodzenia

Rozprzestrzenianie;

z wodą np. z deszczem

przez wiatr np. erwinia amylovora

przez owady

Zimowanie:

W glebie : saprotrofy głównie , wiele epifitami( zasiedlają liść nic mu nie robiąc, a po zmianie warunków na korzystne objawy)

Ochrona :

środków chemicznych się nie używa

antybiotyków się nie używa , tylko do ervinia amylovora

środki miedziowe

metody agrotechniczne

listy kwarantannowe

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 8 2006 - 06 - 05

Typy plechy u grzybów:

- plazmodium - śluźnia

- sorus - zespół komórek

- grzybnia cenocytyczna (celuloza)

- grzybnia mycelium (chityna)

Gromada OOMYCOTA:

Dominującą fazą jest diplofaza, proces płciowy typu oogamii, gametangia (wielojądrowe gamety) plemnia i lęgnia.

Tylko 1 jądro plemni bierze udział w zapłodnieniu 1 jądra lęgni, reszta degeneruje - gruba błona - oospora(zarodnik przetrwalnik) - strzępka z zarodnią pływkową - zarodniki pływkowe diploidalne - podział redukcyjny R! - przy tworzeniu gametangiów.

Grzybnia wewnątrz tkanek między komórki przez szparkę, trzonki sporangialne przez dolną stronę liścia (chronią się przed zbyt dużym nasłonecznieniem)

Królestwo Fungi (grzyby właściwe) dominująca faza - haplofaza. Są to plechowce nie tworzą organów pełniących okrywową funkcję.

Klasyczna plech to grzybnia złożona ze strzępek i ma ona nie ograniczony wzrost, wszystkie utwory grzyba są wytworami grzyba.

Duża powierzchnia do pobierania pokarmu - okrągłe nitkowate rozgałęzienia.

Ssawki (haustoria) do pobierania pokarmu; wnikają do wewnątrz komórek, plektenchymatyczne (nibytkanka) strzępki mogą się poplątać, przekrój poprzez (podobne do tkanki ) sklerocjum zbudowane z plektenchymatycznej przetrwalnikowej grzybni.

Grzyby odżywiają się osmotroficznie - ciśnienie osmotyczne w ssawce jest bardzo duże - woda wpływa do ssawki, wszystko co z wodą dostaje się na powierzchnię ssawki ma błonę półprzepuszczalną. Może zostać wymienione na zasadzie jon na jon. Elementy nie rozpuszczalne muszą zostać rozłożone do postaci rozpuszczalnej i zostać pobrane (celuloza - glukoza).

Bezpłciowe rozmnażanie grzybów:

- chlamydiospory - tworzą się przez rozpad grzybni

- pączkowanie - (blastospory u Taphrina)

- sporangia - sporangiospory - zarodniki sporangialne (wiatr - Zygomycota)

- zarodniki konidialne

Tworzenie odiów - komórka macierzysta się dzieli u podstawy, starsze odpychane ku górze, odrywane i rozsiewane przez wiatr.

Trzonki konidialne - rozgałęzienie strzępek grzybni o szczególnych cechach - zakończony wzrost - określona liczba komórek ( w przybliżeniu) zarodniki zawsze na końcu strzępki, odrywa się strzępka , dalej nie rośnie; różne kształty pędzlowate (Penicilinum)

Rozmnażanie płciowe:

Tworzą gamety - proces płciowy - zapłodnienie - zygota

gamety nie różniące się morfologicznie - izogamia Chytrydiomycota

gamety różniące się morfologicznie - anizogamia

gamety ruchliwe - planogamia Chytrydiomycota

gamety nie ruchliwe - aplanogamia

Gromada ZYGOMYCOTA:

Zygogamia, gamety ze strzępek grzybni rozgałęziają się - zygogamety łączą się - diploid zygospora (przetrwalnik)

Ściana zależnie od typu grzyba (chityna, betaglukan)

Grzybnia cenocytyczna

Patogeny Rhizobus

Gromada ASCOMYCOTA:

Zarodnia (casus) worek, bezpłodne trzonki konidialne; lęgnia (askogonium)

W zapłodnieniu biorą udział wszystkie jądra lęgni, plemni (w przeciwieństwie do oogamii); tworzą one pary jąder sprzężonych (dikariofaza 2x) - zachodzi rozwój w dikariofazie lęgnia kiełkuje w strzępki workotwórcze w pewnym momencie kariofaza - po połączeniu mejoza 4 jąder 1 n - dalej podziały mitotyczne - 8 haploidalnych jąder (stworzyła się zarodnia casus - worek)

Ostatecznym wynikiem procesu płciowego są haploidalne utwory.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 9 2006 - 06 - 12

Worki mogą być nagie na powierzchni np. liścia albo w owocnikach

- kuliste bez zamknięcia - musi pęknąć (kleistotecjum) występują u mączniaków prawdziwych

- otocznie otwarte (perytecja) różnego kształtu

- płaskie owocniki miseczkowate (apotecjum) na nich worki - u workowców, niektóre mogą być od góry zamknięte

- pseudotecja

Parch jabłoni

Workowce, rozmnażanie bezpłciowe za pomocą zarodników konidialnych

- infekcja liści pod kutikulę, grzybnia na niej zarodniki konidialne ( od zarodnikowania do zarodnikowania 14 dni)

- liście spadają zachodzi proces płciowy - w pseudotecjach zarodniki w workach

- marzec początek kwietnia grzyb się rozwija otocznie są dojrzałe , zarodniki w końcu kwietnia zakażają

- stadium workowe saprotrofy, doskonałe, telomorfa (rozmnażanie płciowe)

- stadium konidialne, pasożyt, niedoskonałe, anamorfa (rozmnażanie bezpłciowe)

Klasa: BASIDIOMYCOTA (podstawczaki)

Zapłodnienie ma charakter somatogamii, grzybnia dikariotyczna (podstawowa forma życiowa) , zarodniki na podstawce.

Rząd :RDZE

Zarodniki zakażają roślinę na niej spermogonia ( w nich spermacja) tworzy się grzybnia dikariotyczna - rośnie w tkankach, rosną ecja i ecjospory ( zarodniki zakażają - grzybnia nowe zarodniki :

uredinia z urdiniosporami

telia z teliosporami

Przetrwalniki wiosną kiełkują w podstawkę.

Niektóre rdze cały cykl na jednym żywicielu (jednodomowe) lub dwudomowe.

WYKŁAD 1 02/10/2006

T: CHOROBY ROŚLIN

  1. infekcyjny proces chorobowy:

INFEKCJA: rozpoczyna się w momencie fizycznego kontaktu patogena z rośliną, a kończy rozwiązaniem kontaktu pasozytniczego

Drogi wnikania:

  1. przez nieuszkodzona kutykulę i skórkę (wnikanie bezpośrednie)

  2. przez miejsca nie okryte kutikulą

  1. przez zranienia

INKUBACJA: rozpoczęcie kosztem rośliny gospodarza i trwa do wystapienia pierwszych objawów chorobowych

CHOROBA WŁAŚCIWA: obejmuje kolejne widoczne zmiany wynikajace z pasożytowania patogena ( w tym POHJAWIENIE SIĘ OZNAK ETIOLOGICZNYCH SPRAWCY CHOROBY BĘDĄCE ZWYKLE FORMAMI ROZMNAŻANIA PATOGENA.)

Wykład 2 16/10/2006

Infekcyjny proces chorobowy

wykład 3

ODPORNOŚĆ - zjawisko braku porażenia rosliny zywicielskiej

~~*~~*~~*~~*~~

  1. więdnięcia

  2. nekrozy

  1. zmiany zabarwienia

  1. zniekształcenia

  1. Narośla

  2. Wydzieliny

  1. rany

roznoszenie grzybów: lęgniowców, workowców

roznoszenie bakterii

roznoszenie pyłky z wirusem nekrotycznej plam,istości wiśni i czereśni

przenoszenie zarodników rdzy na pszenicy

patogeny glebowe

zabiegi pielęgnacyjne, prez narzędzia do pielegnacji roślin,np. rak bakteryjny pomidora, wirusy

przenoszenie przez owady 9mszyce, miodówki przenosza wirusy, larwy- bakterie, pszczoły - bakterie, ptaki: zaraza ogniowa, wciornastek zachodni - wirus brązowej plamistości pomidora)

WYKŁAD 4

ŚroDowIsko

wykład 5

  1. współczynnik szkodliwości choroby

q=[ (Pz-Pch) : Pz ] * 100

Pz- plon z roslin zdrowych

PW- plon z roslin chorych

q- współczynnik szkodliwości choroby

  1. warunki opłacalności ochrony

Wu= Wo- Wch ; Wu>K

Wu- wartpsć uratowanego zbioru dzięki ochronie

Wo - rośliny ochrobnione

Wch rosliny chore

  1. wskaxnik ekonomicznej aktywności

E= Wu:K

K - koszty poniesione na ochronę

E- współcz. Ekonomicznej efektywności

wykład 8

ide sobie zrobic herbatke, a wy się uczcie

Fungicydy

Dawka efektyw

Krzywa toksyczności

Dawka efektywna

I

Ed50<1ppm

b. toksyczny

II

Ed50 1-50ppm

III

ED50- 51-100 ppm

IV

ED50>100ppm

Mało toksycny

0,25-0,3% - wyższe stężenia

określanie dawki toksycznej: 50-500mg/kg ciała- wysokosc dawki ustalamy (szczury, myszy)- efekt dermatologiczny i ustny

stosowanie fungicydu niesie za soba działanie toksyczne, podraznienie oczu, śluzówki, alergie

WP - proszek do sporzadzania zaiwsin

S.C.- roztwór skoncentrowany

SE - emulsja

SP - proszek rozpuszczalny

WG- granulaty

  1. działanie zapobiegawcze: ochronna wrstwa fungicydyu uniemozliwoa infekcje

  1. działanie interwencyjne: zahamowanie rozwoju grzyba

  2. działanie wyniszczające - zahamowanie lub zniszczenie grzybni rowijającej się na powierzchni

  3. działanie luznicze: zdolność do zniszczeniapatogena w tkankach, działanie w tkankach żywych możliwe, w tkankach martwuych niemozliwe

FITOTOKSYCZNOSĆ - toksyczne działanie na rośliny, stymuluja ją warynki zewnętrzne

Wykład 9

inne grupy organiczne:

wykład 10

wykład 11

OCHRONA jabłoni przed parchem:

Wykład 12 ciag dalszy 9ale nie mam ciągu nie dalszego od tego wykładu)

fitoauksyny

rozpuszcanie ścian komórkowych

synteza i pzremiany zw. Fenolowyych

enzymy

nadwrazliwość

####################### #########3 ##########

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 1 2006 - 02 - 20

FITOPATOLOGIA - nauka o chorobach roślin.

Choroba rośliny; negatywny wpływ pewnych czynników na organizmy roślinne powodujący zachwiania równowagi funkcjonowania organizmu roślinnego

Infekcyjne czynniki chorobotwórcze to główny obiekt zainteresowań fitopatologii. Jeden czynnik zakłóca równowagę biologiczną.

Patogeny to organiczne (żywe) czynniki chorobotwórcze rośliny

CZYNNIK CHOROBOTWÓRCZY - wszystko co nie jest rośliną, a występuje w środowisku rośliny,

PODZIAŁ:

TENDENCJE

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 2 2006 - 02 - 27

czynniki nieożywione chorobotwórcze;

zanieczyszczenia środowiska

chemiczne środki ochrony roślin

PATOGENY

żywe, chorobotwórcze czynniki infekcyjne.

- zakażają rośliny, żyją z nimi jako pasożyty

zachowanie patogenów:

- niektóre zakażają tylko jeden gatunek lub odmianę - Monofagi

- zakażają kilka gatunków lub kilkanaście - Oligofagi

- zakażają wszystkie rośliny - Polifagi

podział w zależności od miejsca występowania w roślinie:

- na powierzchni rośliny, do komórek skórki wrastają tylko ssawki itp. - PASOŻYTY ZEWNĘTRZNE

- wnikają do roślin i rozwijają się :

* wewnątrz komórek - INTRACERULARNE,

* rozwijają się między komórkami - INTERCELLULARNE

* takie które cały cykl rozwojowy odbywają wewnątrz komórek żywiciela - ENDOBIONY

Bardzo inwazyjne wnikanie patogenów do roślin powoduje groźne skutki uboczne

Podział ze względu na możliwość korzystania z roślin:

- pasożyty obligatoryjne, ścisłe, bezwzględne: żyją wyłącznie na żywych roślinach. Nie są padlinożercami, potrafią czerpać tylko pokarm z żywych komórek, dążą do tego aby nie zabić rośliny, bo nie miałyby z czego korzystać.

- pasożyty okolicznościowe, fakultatywne: są pasożytami wtedy tylko gdy część rośliny jest zabita, czerpią pokarm tylko z martwych roślin. Wydzielają substancje, które zabijają komórki roślinne, potem z tego korzystają.

- saprotrofy okolicznościowe: mogą pobierać pokarm zarówno z żywej jak i martwej rośliny. Są związane z cyklem rozwojowym roślin w sezonie wegetacji jest on pasożytem, a w zimie kiedy nie ma żywych roślin prowadzą saprotroficzny tryb życia, ich uzdolnienia pasożytnicze są bardzo duże, potrafią żyć z rośliną nie czyniąc jej dużej szkody, z reguły one wytwarzają najwięcej szkód np. nekrozy. ??

Rozpoznawanie patogenów

- to, że patogen jest obecny na roślinie to nie znaczy, że jest odpowiedzialny za chorobę,

Warunki świadczące o obecności prawdziwego patogenu, Postulaty kocha:

  1. za patogena można uznać organizm, który nie zawodnie jest izolowany ze wszystkich chorych roślin, zawsze jest na wszystkich chorych roślinach

  2. musimy wyizolowany organizm, hodować na pożywce, stworzyć jego kulturę i ją opisać.

  3. Organizmem pobranym z kultury musimy zarazić roślinę zdrową z tego samego gatunku i odtworzyć te same objawy

  4. Ze sztucznie zakażonej rośliny odzyskać patogena, utworzyć jego kulturę potwierdzić te same warunki.

- stosuje się je w przypadku chorób nowych

- nie dla wszystkich patogenów postulaty Kocha się spełniają np. przy wirusach, wiroidach, bo one nie żyją na pożywkach.

Wirusy

- Mejer (Niemcy)

- Iwanowski (Rosja)

- Bering (Holandia)

przepuścili sok z tytoniu przez filtry, okazało się, że sok wolny już od bakterii, był nadal zakażony i okazało się, że cos jeszcze mniejszego od bakterii infekuje rośliny - WIRUSY

Są to patogeny zwierząt, ludzi a także roślin. Wirusy są organizmami posiadającymi cech istot martwych i żywych, dlatego uznawane są za patogeny infekcyjne.

Wyróżniamy wirusy :

- pałeczkowate (sztywne, proste)

- nitkowate (wygięte, powyginane)

- kuliste - tak naprawdę wielościany - dwudziestościan foremny czyli IKOSAEDR.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 3 2006 - 03 - 06

WIRUSY:

mozaika tytoniu

Pałeczkowaty, trwały łatwo izolowany, posiada kanał w którym znajduje się kwas nukleinowy, związany z poszczególnymi jednostkami białkowymi, które tworzą okrywę i nadają kształt wirusowi (kapsyd). Wirus mozaiki tytoniu 64000 nukleotydów (RNA).

KONSTRUKCJA CZĄSTECZKI WIRUSA

CAŁA CZASTECZKA WIRUSA WIRION = KAPSYD + KWAS NUKLEINOWY

Niektóre wirusy posiadają dodatkową otoczkę glikoproteinową pożyczoną z komórki roślinnej.

Kapsomer, nukleokapsyd, podjednostka białkowa; peptyd o kowalencyjnych wiązaniach- pełni funkcję ochronną , zabezpiecza przed czynnikami np przed nukleazami. Składa się z 2300 podjednostek białkowych identycznych, w każdej z nich 158 aminokwasów. Struktura białka nie musi być zapisana w genomie - odtwarzana jest podczas namnażania.

Podjednostka morfologiczna, strukturalna - grupa podjednostek białkowych dających się wyróżnić w mikroskopie elektronowym lub w badaniach krystalograficznych (promieniowanie X)

izomeryczne wirusy:

IKOSAEDR (20 x 3 = 60) i podziały na 4 lub 9 co jest zmienione przez to, że podjednostki białkowe mogą układać się w polimerazy i heksametry tworzące podjednostki strukturalne b. dobrze zorganizowane wewnątrz cząsteczki wirusa.

pałeczki heliakalne, TMU:

6400 nukleotydów, 2130 podjednostek białkowych, 3 nukleotydy prawoskrętnej helisy ssRNA na I podjednostce, 15 - 18 mm średnicy kanał 2,3 nm, na 1 skok spirali 49 nukleotydów i 161/3 podjednostek białkowych

wirusy nitkowe:

powyginane ze względu na różnicę we wzajemnym oddziaływaniu, podjednostek białkowych w pobliżu małej i dużej średnicy,

WIRUSY

- występuje tu zjawisko rekombinacji genetycznej

- występuje tez pewna nieciągłość, różnice w sekwencjach kwasów nukleinowych,

Wirusy podobne do siebie różnią się w 10 % ustawieniem nukleotydów

Inne różnią się o 30 % sekwencją nukleotydów (innych różnic niż o 10 % i 30 % nie ma ) - czyli są homologiczne w 90 i 70 %.

Różnice w sekwencji to podstawa do wyróżniania gatunków, gatunki łączą się w rodzaje, rodzaje w rodziny i w rzędy.

Cechy wirusa są równo cenne, wirusy wielocząsteczkowe są podzielone - ich genom nie mieści się w jednej cząsteczce (dopiero po złączeniu cząsteczek tworzą całość).

Wyróżniamy

- dsDNA

- ssDNA

- dsRNA

- ssRNA(+)

- ssRNA(-)

ETAPY NAMNAŻANIA WIRUSÓW W GENOMIE (+) ssRNA;

  1. wirus wnika do komórki w czasie wnikania Lu zaraz potem RNA uwalnia się z okrywy białkowej.

  2. RNA wnika, wiąże się z rybosomami i ulega translacji do polimerazy RNA, a być może są tworzone i inne białka

  3. polimeraza RNA produkuje na wzorcu (+) RNA kopię (-) RNA

  4. kopia (-) RNA użytkowana jest przez polimerazę RNA do produkcji potomnych kopi (+) RNA i etapem pośrednim jest tzw. forma replikacyjna lub pośrednia; mogą być tworzone pełne kopie lub częściowe ( fragmenty) jednym z takich fragmentów może być Messenger dla białka kapsydu.

  5. Monocistronowy RNA będący messengerem dla białka kapsydu, ulega translacji i powstają duże ilości białka - kapsydu.

  6. podjednostki białka kapsydu i (+) RNA wirusa są montowane w nowe cząstki wirusa gromadzące się w cytoplazmie.

GENOM - zawsze DNA, fragmenty DNA przepisywane na RNA i na białka.

- ds. DNA Wirusy : Cullimovirus

Kolisty DNA 8 kb., ulega transkrypcji, druga nić jest niekodująca, ma dwa pękniecia, co tworzy dwie nici .

SORF zidentyfikowano funkcje;

I. transportowa

  1. wektory

III. kapsyd

IV. odwrotna transkryptaza

VI. inkluzje typu wirioklazmy

DNA replikuje się w procesie odwrotnej transkrypcji z pośrednią formą. RNA ds. RNA dostaje się do jądra komórkowego, pęknięcia zamykają się i jest używany jako mikrochromosom przez polimerazę RNA, z których jest mRNA dla ORF VI

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 4 2006 - 03 - 13

JAK WIRUS KORZYSTA ZE SWOJEGO ŻYWICIELA

Korzysta z aminokwasów i nukleotydów do budowy własnych cząstek, czasem z innych substancji (poliamidy, lipidy inne).

Do budowy cząstek wirusa jest potrzebna energii ATP.

Wirus angażuje układ translacyjny komórki (rybosomy, ARNA i inne związane z tym układem enzymy i czynniki) wykorzystywany jest układ rybosomów cytoplazmatycznych (80s) - nie ma dowodów by wirusy roślin były w stanie korzystać z innych układów rybosomów (np.. mitochondrialnych).

Wszelkie przemiany post translacyjne angażują również enzymy żywiciela

Transkrypcja, wirus buduje własne enzymy, ale np. replikacja TYMU-RNA składa się częściowo z peptydów gospodarza i CAUUMOWIRUSY- DNA; wnika do jądra i ulega transkrypcji do RNA przy zaangażowaniu polimerazy RNA zależy od DNA gospodarza.

Do biosyntezy wirusa wykorzystywane są też układy błon gospodarza - synteza RNA odbywa się w układzie związanych z błonami MMOVIRUS np. w inwaginacjach błon chloroplastów, białko wirusowe na retikulum endoplazmatycznym

Przemieszczanie wirusów na terenie komórki oraz we floemie też wymaga użytkowania mechanizmów transportowych gospodarza.

SZKODLIWOŚĆ WIRUSÓW POLEGA PRZEDE WSZYSTKIM NA TYM , ŻE UKŁAD TRANSLACYJNY GOSPODARZA, KTÓRY ZAMIAST BUDOWAĆ WŁASNE BIAŁKA BUDUJE PRZEDE WSZYSTKIM BIAŁKO KAPSYDU WIRUSA !!!

TRANSKAPSYDACJA : wymiana kapsydów po miedzy 2 cząsteczkami wirusa, MIESZANIEC FENOTYPOWY: powstaje nowa fenotypowo jednostka, ale nie dziedziczą się te cechy.

NAMNAŻANIE WIRUSÓW :

  1. etap -namnażanie kopi wirusa- czasem mogą zajść mutacje = przyczyna zmienności wirusa / dziedziczna.

- u wirusów może dochodzić do rekombinacji pomimo tego iż nie namnażają się one płciowo, dlatego w stosunku do wirusów używamy pojęcia gatunek.

- produkty mutacji i rekombinacji są zmiennością dziedziczną to prowadzi do dziedzicznej zmienności genetycznej, są również zmienności niedziedziczne w wyniku.

# zamiany płaszczami białkowymi podczas namnażanie - transkapsydacja

# mieszańce fenotypowe

- przenoszenie wirusa przez nicienie i owady zleży od budowy białka. Produkt transkapsydacji jest nowa jakością, ale nie jest to cecha dziedziczna. Transkapsydacja zmienność niedziedziczna, namnażanie się wirusa.

II. proces, produkty - mieszańce fenotypowe; nie całe kapsydy ulegają wymianie, tylko ich fragmenty, może to spowodować jednorazowe skutki ale nie jest to dziedziczne, namnażanie wirusa.

WYWOŁYWANIE CHORB PRZEZ WIRUSY

- zakażanie dużej liczby komórek naraz- mało prawdopodobne

- zakażanie małej liczby komórek i wirus przenosi się tez do innych komórek

TRANSPORT WIRUSA W ROŚLINIE

- wirus dostaje się do komórek skórki potem do komórek miękiszu palisadowego albo gąbczastego, potem do wiązek przewodzących hipoteza

- z komórek do komórek transportowane są przez plazmodesmy hipoteza

- zostało odkryte białko, które służy do transportowania przez plazmodesmy

# funkcje białka - struktura białka transportowego, pasuje do struktury błon komórkowych, plazmodesmy. Jeżeli doczepi się tu kwas nukleinowy wirusa zostaje przeciągnięty przez plasmodesmę ( pierwszy raz wykryto to w przypadku wirusa mozaiki tytoniu). Modyfikacja plasmodesm - białka transportowe poszerzają błony. Plazmodesmy się poszerzają.

8 GODZIN - tyle czasu wirus opanowuje 1 komórkę

- wirus może być transportowany przez Felom, najpierw do korzeni a potem dopiero do organów nadziemnych, doświadczenie Samuela

- niektóre wirusy mogą być transportowane przez Ksylem

Transport przez wiązki przewodzące przyspiesz czas w którym wirus opanowuje komórkę- kilka lub kilkanaście na godzinę.

ELEMENT WOLNY OD WIRUSA W ROŚLINIE - MERYSTEMY WIERZCHOŁKOWE , zarówno na łodydze jak i na korzeniu.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 5 2006 - 05 - 15

Ochrona roślin przed wirusami

  1. zdrowy materiał wyjściowy - rośliny z nasion i rozmnażane wegetatywnie

  2. ochrona przed wektorami

- gleba wolna od grzybów i nicieni

- chemiczna ochrona przed mszycami - przypadki przenoszenia trwałego i nietrwałego

- rośliny ochronne na obszarach pól

- folia odblaskowa

- opryskiwanie olejami,

odmiany odporne ( TOMU, PUX, PUV, PVM )

ochrona plantacji nasiennych i matecznych:

- absolutnie zdrowy materiał wyjściowy

- dostatecznie częsta i skuteczna kontrola zawartości

- izolacja od źródeł infekcji wektorów (przestrzeń i bariery; szklarnie )

- wyspecjalizowany personel, wyposażenie i świadomość

ciekawostki:

- wirycydy - inhibitory (Viarazol, chitozom)

- wakcynizacja (szczepienie ochronne)

- merystemy

- termoterapia

PRODUKCJA ZDROWYCH SADZONEK CHRYZANTEMY:

RODZAJE TESTÓW

- Biologiczne:

wykorzystywanie bioindykatorów, roślin wskaźnikowych, które zawsze dają(roślin wzorcowych)

zalety - prosty, bardzo wysoka czułość testu,

wady - objawy często otrzymujemy po długim okresie (standard 1 - 3 tygodnie)

- Serologiczne:

robimy surowice uczuloną na konkretny wirus na przykład surowice na pstrość tulipana.

zalety - bardzo szybkie (wynik w ciągu 0,5 godziny), prostota

wady - słaba czułość testu

Test Lateksowy:

Na kulkach lateksowych umieszczone są przeciwciała

Test Eliza:

Eliza skrót od pierwszych liter test imano sorpcji enzymu

Etapy :

- nakładamy do studzienki surowice (przeciwciała) - 4 godz. w 37 st. C

- płuczemy , odpada to co nie jest związane z płytką

- dodajemy wirus - 12 godz. w 4 st. C

- płuczemy

- dodajemy koniugat (surowica + enzym) wiązany przez wirusa

- dodajemy substrat , który zmienia barwę (natężenie barwy = natężenie cząstek wirusa).

RODZAJ TESTU

granice wykrywania wirusa

biologiczny

0,3 pg/ml

techniki serologiczne

1 ng / ml

1 - 10 ng / ml

percypitacja

test lateksowy

test Eliza

techniki

WAKCYNIZACJA :

Wprowadzamy do organizmu osłabiony / atenuowany wirus :

Zakaża on ale nie wywołuje objawów. Obecność wirusa hamuje uwalnianie RNA z wirusa - z płaszcza białkowego

TERMOTERAPIA :

Program odwirusowania chryzantemy

Wirus źle się namnaża w temperaturze 38 - 42 st. C - to co wyrośnie jest wolne od wirusa ; hodowla merystemów.

Wiroidy - wolne kwasy nukleinowe

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 6 2006 - 05 - 22

WIROIDY:

Nagi kwas nukleinowy, pozbawiony okrywy białkowej, są to bardzo krótkie kwasy nukleinowe, nie są w stanie kodować żadnego białka, nawet własnej replikacji !!!

Struktura wiroidów:

- jedno niciowy RNA, zachowujący w sposób szczególny, końce RNA są ze sobą związane, wiroidy są w postaci kolistych cząsteczek kwasów nukleinowych - struktura spinki do włosów.

- struktura drugo rzędowa RNA; rozgałęzione nici - struktura główki młotka

W zależności od struktury powstaje klasyfikacja:

1. rodz. POSPOVIROIDE - struktura spinki do włosów

2. rodz. ASSUNVIROIDE - (nie ma tu wyróżnionych domen) struktura główki od młotka

WIROIDY STANOWIĄCE POTENCJALNE ZAGROŻENIE ROŚLIN UPRAWNYCH:

  1. ziemniak - wiroid wrzecionowatość bulw ziemniaka, straty do 65 % przez ten wiroidy (wykryty przez SGGW)

  2. pomidor - wiroid karłowatości wrzecionowatej pomidora

  3. złocień - wiroid karłowatości złocienia, wiroid chlorotycznej plamistości złocienia

  4. ogórek - wiroid bladości ogórka

  5. chmiel - wiroid karłowatości chmielu, utajniony wiroid chmielu (wykryty przez SGGW)

  6. jabłoń - wiroid bliznowatości skórki jabłek (wykryty przez SGGW)

  7. brzoskwinia - wiroid utajnione mozaiki brzoskwini (wykryty przez SGGW)

Namnażanie :

- wiroidów wykorzystują d namnażanie już istniejącą w komórce polimerarazę RNA II

- mechanizm toczącego się koła

Pochodzenie wirusów:

  1. hipoteza- profesor Dimer - „ wiroidy to zbite introny ”, gdyby się intron usamodzielnił to mogłyby się wiroidy replikować z RNA roślinnego - mało prawdopodobne

  2. hipoteza- są to żywe skamieliny - SA one początkami życia. RNA może istnieć odrębnie.

Patogeny układu transkrypcyjnego

Praktyczne cechy wiroidów jako patogenów:

- z komórki do komórki transportowane przez plazmodesmy, w roślinach na duże odległości przez floem

- w przeciwieństwie do wirusów, wiroidy mają zdolność do atakowania komórek merystematycznych

- nie można ich wyeliminować przez wycinanie merystemów, ani przez termoterapię, bo one w wysokich temperaturach dobrze się rozmnażają (około 30 st. C.)

Przenoszenie z rośliny na roślinę:

  1. Mechanicznie przez sok

  2. Nie są przenoszone przez wektory, ale są wyjątki np. wiroid wrzecionowatości bulw ziemniaka

  3. Wiroidy jako takie nie SA przenoszone przez ptaki, chyba kwas nukleinowy schowa się do kapsydu wirusa to może być przeniesiony przez jakiegoś wektora

  4. Przenoszone z nasionami i z pyłkiem np. na rośliny zapylane, stwarza to problemy w hodowli twórczej

Ochrona :

- musimy mieć zdrowy materiał wyjściowy

- istotną sprawą jest wykrywanie wiroidów,

Testy biologiczne

Testy serologiczne - nie możliwe do wykonania, bo nie można wykryć białka - bo go nie ma !

Elektroforeza na żelu poliakryloamidowym - wyrywanie kwasu nukleinowego

Przy pomocy sondy molekularnej - sonda molekularna powstaje podczas odwrotnej transkrypcji, ma DNA odwrotne do DNA wiroida, metoda cDNA:

- nanosi się próbki kwasu nukleinowego; zapieka się, potem taką sondę się kąpie w cDNA sonda wtedy jest autoreaktywna - robimy autoradiogram, metoda bardzo czuła, bardzo mało wydajna, np. przy teście Elizy można zrobić w 3 osoby 1000 próbek w dwa dni, tutaj tylko 12, tą metodą można wykrywać też RNA wirusowe. Bardzo długi czas oczekiwania, kłopotliwa ; dobra dla ziemniaka bo i tak przechowujemy.

5 st. C przez 6 miesięcy (przechowujemy rośliny) - wycinamy merystemy - 20-80% roślin zdrowych, termoterapia w niskich temperaturach

PCR - powielanie materiału wiroida, potem stosuje się elektroforezę

RT.PCR - powielanie RNA wiroidowego, potem elektroforeza - test trochę gorszy od biologicznego.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 7 2006 - 05 - 29

FITOPLAZMY :

OMP - Organizmy mykoplazmatyczne

Są to prymitywne bakterie, mają roślinokształtne komórki, nie mają ściany komórkowej, zamiast tego mają trójwarstwową

Fitoplazmy to organizmy, bardzo proste, bez ściany komórkowej, maja tylko błonę 3 warstwową - dlatego maja nie określony kształt, niektóre występują w postaci nitkowatych spiralnych komórek -> SPIROPLAZMY

- Posiadają genom ( 5 x 10 8 Da) w postaci DNA, genom piroplazmy 2 razy większy.

- Nie mają jądra.

- Poza floemem fitoplazm nie ma, fitoplazmy przemieszczają się przez sita.

- Trudno je znaleźć w roślinie.

Próba INAKULACJI MECHANICZNEJ - próba przeniesienia patogena przez sok. Jeżeli próba ta się powiedzie to znaczy że chorobę spowodował wirus nie fitoplazma.

OBJAWY:

- zablokowany transport asymilatów, żółtaczki np. żółtaczka astra

- karłowatość (może wynikać z zaburzeń transportu, np. karłowatość maliny

- proliferacja pędów - wybijanie pąków śpiących, np. proliferacja jabłoni, pędy te wyrastają w dużej ilości z jednego miejsca - miotlastość

- odwrotna ewolucja kwiatów - liście zamiast płatków, kwiat koloru zielonego.

Patogeny zimują w roślinach i w wektorach np. w roślinach zimotrwałych

OCHRONA :

- należy wprowadzać zdrowy materiał wyjściowy,

- ochrona przed wektorami (skoczki, mrówki)

- kuracja antybiotykowa np. antybiotyki tetracykliczne, po zastosowaniu objawy cofają się po zakończeniu podawania antybiotyku objawy wracają - czyli nie zwalczone są fitoplazmy, zostaje wstrzymane tylko ich rozmnażanie.

Stosowanie antybiotyków w Polsce jest zakazane, bo gdy człowiek zje roślinę z antybiotykiem to będzie przyjmował dawki antybiotyku i bakterie się uodpornią - człowieka nie da się potem wyleczyć.

UWALNIANIE ROŚLIN OD FITOPLAZM:

- zabieg termiczny - kąpiele sadzonek w trzcinie cukrowej w wodzie w temperaturze52 st. C. na 10 15 minut - dezynfekcja.

Metody wykrywania fitoplazm:

- test DAPI - odczynnik barwiący DNA, tam gdzie jest dużo fitoplazm tam gdzie występuje dużo fitoplazm występuje barwienie

- test Eliza - na określone białka

- metody rozdziału DNA na różnych podłożach - techniki molekularne

BAKTERIE WŁAŚCIWE:

Budowa:

- materiał genetyczny - chromosom, nukleotyd, genofor (brak jądra) + plazmidy drobne komórki DNA (ich obecność i rozmieszczenie przyczyną zmienności), do niedawna uważano, że na plazmidzie są mało istotne cechy, ale okazało się, że tak nie jest.

- posiadają rzęski, organelle ruchu,

- cytoplazma - rybosomy, brak mitochondriów, mezosomy, które powstają przez wpuklenie plazmolemmy, chromatofory,

- fimbrie - krótsze od rzęsek i grubsze, ich rola nie jest do końca wyjaśniona(rola w koniugacji, pobieraniu pokarmu),

- ściana białkowo-lipidowa

Rozmnażanie:

- podział prosty w 0,5 h

- pączkowanie

Nie rozmnażają się płciowo !!!

4 zmienności dziedziczne;

- KONIUGACJA - wymiana materiału genetycznego (nie musi być w całości) to przyczyna zmienności dziedzicznej, nie jest to forma rozmnażania bo nie powstają nowe organizmy.

- Najczęstszą przyczyną zmienności u bakterii są MUTACJE, zachodzą one bardzo często u bakterii i często są dla nich bardzo pozytywne.

- TRANSFORMACJA GENETYCZNA : bakteria może pochłonąć materiał genetyczny innej komórki ( to nie koniugacja)

- TRANSDUKCJA : przenoszenie bakterii, przez bakteriofagi i zakażanie nowej bakterii.

Tworzenie przetrwalników - tworzą je bakterie patogeniczne - nie wiemy czy stanowią źródło zakażenia

Bakterie jako patogeny roślin:

- mogą zakażać poprzez zranienia

- mogą wnikać przez szparki i hydatody (szparki wodne),

- mogą wnikać przez nektarniki w dnach kwiatowych, mają tu dużo cukru - pożywka,

- mogą wnikać przez włośniki,

- mogą wnikać przez znamię słupka

Wszędzie tam gdzie nie ma kutikuli, bądź została uszkodzona.

W roślinach występują w przestrzeniach międzykomórkowych w miękiszu, często też w tkance przewodzącej w naczyniach, w miejscu występowania w roślinie widoczne są objawy :

AGROBACTERUIM; narośle na korzeniach, łodygach i duża ilość korzeni,

CORYNEBACTER; brunatnienie wiązek przewodzących, więdnięcie, (bakteria naczyniówka)

ERVINIA; zgnilizna , zgorzele, bakterie występują w miękiszu.

PSEUDOMONAS; plamistości , więdnięcie

XANTOMONAS; plamistości nekrozy nerwów, zgnilizny

STREPTOMYCETES; parch zwykły ziemniaka, zewnętrzne uszkodzenia

Rozprzestrzenianie;

z wodą np. z deszczem

przez wiatr np. erwinia amylovora

przez owady

Zimowanie:

W glebie : saprotrofy głównie , wiele epifitami( zasiedlają liść nic mu nie robiąc, a po zmianie warunków na korzystne objawy)

Ochrona :

środków chemicznych się nie używa

antybiotyków się nie używa , tylko do ervinia amylovora

środki miedziowe

metody agrotechniczne

listy kwarantannowe

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 8 2006 - 06 - 05

Typy plechy u grzybów:

- plazmodium - śluźnia

- sorus - zespół komórek

- grzybnia cenocytyczna (celuloza)

- grzybnia mycelium (chityna)

Gromada OOMYCOTA:

Dominującą fazą jest diplofaza, proces płciowy typu oogamii, gametangia (wielojądrowe gamety) plemnia i lęgnia.

Tylko 1 jądro plemni bierze udział w zapłodnieniu 1 jądra lęgni, reszta degeneruje - gruba błona - oospora(zarodnik przetrwalnik) - strzępka z zarodnią pływkową - zarodniki pływkowe diploidalne - podział redukcyjny R! - przy tworzeniu gametangiów.

Grzybnia wewnątrz tkanek między komórki przez szparkę, trzonki sporangialne przez dolną stronę liścia (chronią się przed zbyt dużym nasłonecznieniem)

Królestwo Fungi (grzyby właściwe) dominująca faza - haplofaza. Są to plechowce nie tworzą organów pełniących okrywową funkcję.

Klasyczna plech to grzybnia złożona ze strzępek i ma ona nie ograniczony wzrost, wszystkie utwory grzyba są wytworami grzyba.

Duża powierzchnia do pobierania pokarmu - okrągłe nitkowate rozgałęzienia.

Ssawki (haustoria) do pobierania pokarmu; wnikają do wewnątrz komórek, plektenchymatyczne (nibytkanka) strzępki mogą się poplątać, przekrój poprzez (podobne do tkanki ) sklerocjum zbudowane z plektenchymatycznej przetrwalnikowej grzybni.

Grzyby odżywiają się osmotroficznie - ciśnienie osmotyczne w ssawce jest bardzo duże - woda wpływa do ssawki, wszystko co z wodą dostaje się na powierzchnię ssawki ma błonę półprzepuszczalną. Może zostać wymienione na zasadzie jon na jon. Elementy nie rozpuszczalne muszą zostać rozłożone do postaci rozpuszczalnej i zostać pobrane (celuloza - glukoza).

Bezpłciowe rozmnażanie grzybów:

- chlamydiospory - tworzą się przez rozpad grzybni

- pączkowanie - (blastospory u Taphrina)

- sporangia - sporangiospory - zarodniki sporangialne (wiatr - Zygomycota)

- zarodniki konidialne

Tworzenie odiów - komórka macierzysta się dzieli u podstawy, starsze odpychane ku górze, odrywane i rozsiewane przez wiatr.

Trzonki konidialne - rozgałęzienie strzępek grzybni o szczególnych cechach - zakończony wzrost - określona liczba komórek ( w przybliżeniu) zarodniki zawsze na końcu strzępki, odrywa się strzępka , dalej nie rośnie; różne kształty pędzlowate (Penicilinum)

Rozmnażanie płciowe:

Tworzą gamety - proces płciowy - zapłodnienie - zygota

gamety nie różniące się morfologicznie - izogamia Chytrydiomycota

gamety różniące się morfologicznie - anizogamia

gamety ruchliwe - planogamia Chytrydiomycota

gamety nie ruchliwe - aplanogamia

Gromada ZYGOMYCOTA:

Zygogamia, gamety ze strzępek grzybni rozgałęziają się - zygogamety łączą się - diploid zygospora (przetrwalnik)

Ściana zależnie od typu grzyba (chityna, betaglukan)

Grzybnia cenocytyczna

Patogeny Rhizobus

Gromada ASCOMYCOTA:

Zarodnia (casus) worek, bezpłodne trzonki konidialne; lęgnia (askogonium)

W zapłodnieniu biorą udział wszystkie jądra lęgni, plemni (w przeciwieństwie do oogamii); tworzą one pary jąder sprzężonych (dikariofaza 2x) - zachodzi rozwój w dikariofazie lęgnia kiełkuje w strzępki workotwórcze w pewnym momencie kariofaza - po połączeniu mejoza 4 jąder 1 n - dalej podziały mitotyczne - 8 haploidalnych jąder (stworzyła się zarodnia casus - worek)

Ostatecznym wynikiem procesu płciowego są haploidalne utwory.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 9 2006 - 06 - 12

Worki mogą być nagie na powierzchni np. liścia albo w owocnikach

- kuliste bez zamknięcia - musi pęknąć (kleistotecjum) występują u mączniaków prawdziwych

- otocznie otwarte (perytecja) różnego kształtu

- płaskie owocniki miseczkowate (apotecjum) na nich worki - u workowców, niektóre mogą być od góry zamknięte

- pseudotecja

Parch jabłoni

Workowce, rozmnażanie bezpłciowe za pomocą zarodników konidialnych

- infekcja liści pod kutikulę, grzybnia na niej zarodniki konidialne ( od zarodnikowania do zarodnikowania 14 dni)

- liście spadają zachodzi proces płciowy - w pseudotecjach zarodniki w workach

- marzec początek kwietnia grzyb się rozwija otocznie są dojrzałe , zarodniki w końcu kwietnia zakażają

- stadium workowe saprotrofy, doskonałe, telomorfa (rozmnażanie płciowe)

- stadium konidialne, pasożyt, niedoskonałe, anamorfa (rozmnażanie bezpłciowe)

Klasa: BASIDIOMYCOTA (podstawczaki)

Zapłodnienie ma charakter somatogamii, grzybnia dikariotyczna (podstawowa forma życiowa) , zarodniki na podstawce.

Rząd :RDZE

Zarodniki zakażają roślinę na niej spermogonia ( w nich spermacja) tworzy się grzybnia dikariotyczna - rośnie w tkankach, rosną ecja i ecjospory ( zarodniki zakażają - grzybnia nowe zarodniki :

uredinia z urdiniosporami

telia z teliosporami

Przetrwalniki wiosną kiełkują w podstawkę.

Niektóre rdze cały cykl na jednym żywicielu (jednodomowe) lub dwudomowe.

WYKŁAD 1 02/10/2006

T: CHOROBY ROŚLIN

  1. infekcyjny proces chorobowy:

INFEKCJA: rozpoczyna się w momencie fizycznego kontaktu patogena z rośliną, a kończy rozwiązaniem kontaktu pasozytniczego

Drogi wnikania:

  1. przez nieuszkodzona kutykulę i skórkę (wnikanie bezpośrednie)

  2. przez miejsca nie okryte kutikulą

  1. przez zranienia

INKUBACJA: rozpoczęcie kosztem rośliny gospodarza i trwa do wystapienia pierwszych objawów chorobowych

CHOROBA WŁAŚCIWA: obejmuje kolejne widoczne zmiany wynikajace z pasożytowania patogena ( w tym POHJAWIENIE SIĘ OZNAK ETIOLOGICZNYCH SPRAWCY CHOROBY BĘDĄCE ZWYKLE FORMAMI ROZMNAŻANIA PATOGENA.)

Wykład 2 16/10/2006

Infekcyjny proces chorobowy

wykład 3

ODPORNOŚĆ - zjawisko braku porażenia rosliny zywicielskiej

~~*~~*~~*~~*~~

  1. więdnięcia

  2. nekrozy

  1. zmiany zabarwienia

  1. zniekształcenia

  1. Narośla

  2. Wydzieliny

  1. rany

roznoszenie grzybów: lęgniowców, workowców

roznoszenie bakterii

roznoszenie pyłky z wirusem nekrotycznej plam,istości wiśni i czereśni

przenoszenie zarodników rdzy na pszenicy

patogeny glebowe

zabiegi pielęgnacyjne, prez narzędzia do pielegnacji roślin,np. rak bakteryjny pomidora, wirusy

przenoszenie przez owady 9mszyce, miodówki przenosza wirusy, larwy- bakterie, pszczoły - bakterie, ptaki: zaraza ogniowa, wciornastek zachodni - wirus brązowej plamistości pomidora)

WYKŁAD 4

ŚroDowIsko

wykład 5

  1. współczynnik szkodliwości choroby

q=[ (Pz-Pch) : Pz ] * 100

Pz- plon z roslin zdrowych

PW- plon z roslin chorych

q- współczynnik szkodliwości choroby

  1. warunki opłacalności ochrony

Wu= Wo- Wch ; Wu>K

Wu- wartpsć uratowanego zbioru dzięki ochronie

Wo - rośliny ochrobnione

Wch rosliny chore

  1. wskaxnik ekonomicznej aktywności

E= Wu:K

K - koszty poniesione na ochronę

E- współcz. Ekonomicznej efektywności

wykład 8

ide sobie zrobic herbatke, a wy się uczcie

Fungicydy

Dawka efektyw

Krzywa toksyczności

Dawka efektywna

I

Ed50<1ppm

b. toksyczny

II

Ed50 1-50ppm

III

ED50- 51-100 ppm

IV

ED50>100ppm

Mało toksycny

0,25-0,3% - wyższe stężenia

określanie dawki toksycznej: 50-500mg/kg ciała- wysokosc dawki ustalamy (szczury, myszy)- efekt dermatologiczny i ustny

stosowanie fungicydu niesie za soba działanie toksyczne, podraznienie oczu, śluzówki, alergie

WP - proszek do sporzadzania zaiwsin

S.C.- roztwór skoncentrowany

SE - emulsja

SP - proszek rozpuszczalny

WG- granulaty

  1. działanie zapobiegawcze: ochronna wrstwa fungicydyu uniemozliwoa infekcje

  1. działanie interwencyjne: zahamowanie rozwoju grzyba

  2. działanie wyniszczające - zahamowanie lub zniszczenie grzybni rowijającej się na powierzchni

  3. działanie luznicze: zdolność do zniszczeniapatogena w tkankach, działanie w tkankach żywych możliwe, w tkankach martwuych niemozliwe

FITOTOKSYCZNOSĆ - toksyczne działanie na rośliny, stymuluja ją warynki zewnętrzne

Wykład 9

inne grupy organiczne:

wykład 10

wykład 11

OCHRONA jabłoni przed parchem:

Wykład 12 ciag dalszy 9ale nie mam ciągu nie dalszego od tego wykładu)

fitoauksyny

rozpuszcanie ścian komórkowych

synteza i pzremiany zw. Fenolowyych

enzymy

nadwrazliwość

klklklklklklklklklklklk

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 1 2006 - 02 - 20

FITOPATOLOGIA - nauka o chorobach roślin.

Choroba rośliny; negatywny wpływ pewnych czynników na organizmy roślinne powodujący zachwiania równowagi funkcjonowania organizmu roślinnego

Infekcyjne czynniki chorobotwórcze to główny obiekt zainteresowań fitopatologii. Jeden czynnik zakłóca równowagę biologiczną.

Patogeny to organiczne (żywe) czynniki chorobotwórcze rośliny

CZYNNIK CHOROBOTWÓRCZY - wszystko co nie jest rośliną, a występuje w środowisku rośliny,

PODZIAŁ:

TENDENCJE

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 2 2006 - 02 - 27

czynniki nieożywione chorobotwórcze;

zanieczyszczenia środowiska

chemiczne środki ochrony roślin

PATOGENY

żywe, chorobotwórcze czynniki infekcyjne.

- zakażają rośliny, żyją z nimi jako pasożyty

zachowanie patogenów:

- niektóre zakażają tylko jeden gatunek lub odmianę - Monofagi

- zakażają kilka gatunków lub kilkanaście - Oligofagi

- zakażają wszystkie rośliny - Polifagi

podział w zależności od miejsca występowania w roślinie:

- na powierzchni rośliny, do komórek skórki wrastają tylko ssawki itp. - PASOŻYTY ZEWNĘTRZNE

- wnikają do roślin i rozwijają się :

* wewnątrz komórek - INTRACERULARNE,

* rozwijają się między komórkami - INTERCELLULARNE

* takie które cały cykl rozwojowy odbywają wewnątrz komórek żywiciela - ENDOBIONY

Bardzo inwazyjne wnikanie patogenów do roślin powoduje groźne skutki uboczne

Podział ze względu na możliwość korzystania z roślin:

- pasożyty obligatoryjne, ścisłe, bezwzględne: żyją wyłącznie na żywych roślinach. Nie są padlinożercami, potrafią czerpać tylko pokarm z żywych komórek, dążą do tego aby nie zabić rośliny, bo nie miałyby z czego korzystać.

- pasożyty okolicznościowe, fakultatywne: są pasożytami wtedy tylko gdy część rośliny jest zabita, czerpią pokarm tylko z martwych roślin. Wydzielają substancje, które zabijają komórki roślinne, potem z tego korzystają.

- saprotrofy okolicznościowe: mogą pobierać pokarm zarówno z żywej jak i martwej rośliny. Są związane z cyklem rozwojowym roślin w sezonie wegetacji jest on pasożytem, a w zimie kiedy nie ma żywych roślin prowadzą saprotroficzny tryb życia, ich uzdolnienia pasożytnicze są bardzo duże, potrafią żyć z rośliną nie czyniąc jej dużej szkody, z reguły one wytwarzają najwięcej szkód np. nekrozy. ??

Rozpoznawanie patogenów

- to, że patogen jest obecny na roślinie to nie znaczy, że jest odpowiedzialny za chorobę,

Warunki świadczące o obecności prawdziwego patogenu, Postulaty kocha:

  1. za patogena można uznać organizm, który nie zawodnie jest izolowany ze wszystkich chorych roślin, zawsze jest na wszystkich chorych roślinach

  2. musimy wyizolowany organizm, hodować na pożywce, stworzyć jego kulturę i ją opisać.

  3. Organizmem pobranym z kultury musimy zarazić roślinę zdrową z tego samego gatunku i odtworzyć te same objawy

  4. Ze sztucznie zakażonej rośliny odzyskać patogena, utworzyć jego kulturę potwierdzić te same warunki.

- stosuje się je w przypadku chorób nowych

- nie dla wszystkich patogenów postulaty Kocha się spełniają np. przy wirusach, wiroidach, bo one nie żyją na pożywkach.

Wirusy

- Mejer (Niemcy)

- Iwanowski (Rosja)

- Bering (Holandia)

przepuścili sok z tytoniu przez filtry, okazało się, że sok wolny już od bakterii, był nadal zakażony i okazało się, że cos jeszcze mniejszego od bakterii infekuje rośliny - WIRUSY

Są to patogeny zwierząt, ludzi a także roślin. Wirusy są organizmami posiadającymi cech istot martwych i żywych, dlatego uznawane są za patogeny infekcyjne.

Wyróżniamy wirusy :

- pałeczkowate (sztywne, proste)

- nitkowate (wygięte, powyginane)

- kuliste - tak naprawdę wielościany - dwudziestościan foremny czyli IKOSAEDR.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 3 2006 - 03 - 06

WIRUSY:

mozaika tytoniu

Pałeczkowaty, trwały łatwo izolowany, posiada kanał w którym znajduje się kwas nukleinowy, związany z poszczególnymi jednostkami białkowymi, które tworzą okrywę i nadają kształt wirusowi (kapsyd). Wirus mozaiki tytoniu 64000 nukleotydów (RNA).

KONSTRUKCJA CZĄSTECZKI WIRUSA

CAŁA CZASTECZKA WIRUSA WIRION = KAPSYD + KWAS NUKLEINOWY

Niektóre wirusy posiadają dodatkową otoczkę glikoproteinową pożyczoną z komórki roślinnej.

Kapsomer, nukleokapsyd, podjednostka białkowa; peptyd o kowalencyjnych wiązaniach- pełni funkcję ochronną , zabezpiecza przed czynnikami np przed nukleazami. Składa się z 2300 podjednostek białkowych identycznych, w każdej z nich 158 aminokwasów. Struktura białka nie musi być zapisana w genomie - odtwarzana jest podczas namnażania.

Podjednostka morfologiczna, strukturalna - grupa podjednostek białkowych dających się wyróżnić w mikroskopie elektronowym lub w badaniach krystalograficznych (promieniowanie X)

izomeryczne wirusy:

IKOSAEDR (20 x 3 = 60) i podziały na 4 lub 9 co jest zmienione przez to, że podjednostki białkowe mogą układać się w polimerazy i heksametry tworzące podjednostki strukturalne b. dobrze zorganizowane wewnątrz cząsteczki wirusa.

pałeczki heliakalne, TMU:

6400 nukleotydów, 2130 podjednostek białkowych, 3 nukleotydy prawoskrętnej helisy ssRNA na I podjednostce, 15 - 18 mm średnicy kanał 2,3 nm, na 1 skok spirali 49 nukleotydów i 161/3 podjednostek białkowych

wirusy nitkowe:

powyginane ze względu na różnicę we wzajemnym oddziaływaniu, podjednostek białkowych w pobliżu małej i dużej średnicy,

WIRUSY

- występuje tu zjawisko rekombinacji genetycznej

- występuje tez pewna nieciągłość, różnice w sekwencjach kwasów nukleinowych,

Wirusy podobne do siebie różnią się w 10 % ustawieniem nukleotydów

Inne różnią się o 30 % sekwencją nukleotydów (innych różnic niż o 10 % i 30 % nie ma ) - czyli są homologiczne w 90 i 70 %.

Różnice w sekwencji to podstawa do wyróżniania gatunków, gatunki łączą się w rodzaje, rodzaje w rodziny i w rzędy.

Cechy wirusa są równo cenne, wirusy wielocząsteczkowe są podzielone - ich genom nie mieści się w jednej cząsteczce (dopiero po złączeniu cząsteczek tworzą całość).

Wyróżniamy

- dsDNA

- ssDNA

- dsRNA

- ssRNA(+)

- ssRNA(-)

ETAPY NAMNAŻANIA WIRUSÓW W GENOMIE (+) ssRNA;

  1. wirus wnika do komórki w czasie wnikania Lu zaraz potem RNA uwalnia się z okrywy białkowej.

  2. RNA wnika, wiąże się z rybosomami i ulega translacji do polimerazy RNA, a być może są tworzone i inne białka

  3. polimeraza RNA produkuje na wzorcu (+) RNA kopię (-) RNA

  4. kopia (-) RNA użytkowana jest przez polimerazę RNA do produkcji potomnych kopi (+) RNA i etapem pośrednim jest tzw. forma replikacyjna lub pośrednia; mogą być tworzone pełne kopie lub częściowe ( fragmenty) jednym z takich fragmentów może być Messenger dla białka kapsydu.

  5. Monocistronowy RNA będący messengerem dla białka kapsydu, ulega translacji i powstają duże ilości białka - kapsydu.

  6. podjednostki białka kapsydu i (+) RNA wirusa są montowane w nowe cząstki wirusa gromadzące się w cytoplazmie.

GENOM - zawsze DNA, fragmenty DNA przepisywane na RNA i na białka.

- ds. DNA Wirusy : Cullimovirus

Kolisty DNA 8 kb., ulega transkrypcji, druga nić jest niekodująca, ma dwa pękniecia, co tworzy dwie nici .

SORF zidentyfikowano funkcje;

I. transportowa

  1. wektory

III. kapsyd

IV. odwrotna transkryptaza

VI. inkluzje typu wirioklazmy

DNA replikuje się w procesie odwrotnej transkrypcji z pośrednią formą. RNA ds. RNA dostaje się do jądra komórkowego, pęknięcia zamykają się i jest używany jako mikrochromosom przez polimerazę RNA, z których jest mRNA dla ORF VI

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 4 2006 - 03 - 13

JAK WIRUS KORZYSTA ZE SWOJEGO ŻYWICIELA

Korzysta z aminokwasów i nukleotydów do budowy własnych cząstek, czasem z innych substancji (poliamidy, lipidy inne).

Do budowy cząstek wirusa jest potrzebna energii ATP.

Wirus angażuje układ translacyjny komórki (rybosomy, ARNA i inne związane z tym układem enzymy i czynniki) wykorzystywany jest układ rybosomów cytoplazmatycznych (80s) - nie ma dowodów by wirusy roślin były w stanie korzystać z innych układów rybosomów (np.. mitochondrialnych).

Wszelkie przemiany post translacyjne angażują również enzymy żywiciela

Transkrypcja, wirus buduje własne enzymy, ale np. replikacja TYMU-RNA składa się częściowo z peptydów gospodarza i CAUUMOWIRUSY- DNA; wnika do jądra i ulega transkrypcji do RNA przy zaangażowaniu polimerazy RNA zależy od DNA gospodarza.

Do biosyntezy wirusa wykorzystywane są też układy błon gospodarza - synteza RNA odbywa się w układzie związanych z błonami MMOVIRUS np. w inwaginacjach błon chloroplastów, białko wirusowe na retikulum endoplazmatycznym

Przemieszczanie wirusów na terenie komórki oraz we floemie też wymaga użytkowania mechanizmów transportowych gospodarza.

SZKODLIWOŚĆ WIRUSÓW POLEGA PRZEDE WSZYSTKIM NA TYM , ŻE UKŁAD TRANSLACYJNY GOSPODARZA, KTÓRY ZAMIAST BUDOWAĆ WŁASNE BIAŁKA BUDUJE PRZEDE WSZYSTKIM BIAŁKO KAPSYDU WIRUSA !!!

TRANSKAPSYDACJA : wymiana kapsydów po miedzy 2 cząsteczkami wirusa, MIESZANIEC FENOTYPOWY: powstaje nowa fenotypowo jednostka, ale nie dziedziczą się te cechy.

NAMNAŻANIE WIRUSÓW :

  1. etap -namnażanie kopi wirusa- czasem mogą zajść mutacje = przyczyna zmienności wirusa / dziedziczna.

- u wirusów może dochodzić do rekombinacji pomimo tego iż nie namnażają się one płciowo, dlatego w stosunku do wirusów używamy pojęcia gatunek.

- produkty mutacji i rekombinacji są zmiennością dziedziczną to prowadzi do dziedzicznej zmienności genetycznej, są również zmienności niedziedziczne w wyniku.

# zamiany płaszczami białkowymi podczas namnażanie - transkapsydacja

# mieszańce fenotypowe

- przenoszenie wirusa przez nicienie i owady zleży od budowy białka. Produkt transkapsydacji jest nowa jakością, ale nie jest to cecha dziedziczna. Transkapsydacja zmienność niedziedziczna, namnażanie się wirusa.

II. proces, produkty - mieszańce fenotypowe; nie całe kapsydy ulegają wymianie, tylko ich fragmenty, może to spowodować jednorazowe skutki ale nie jest to dziedziczne, namnażanie wirusa.

WYWOŁYWANIE CHORB PRZEZ WIRUSY

- zakażanie dużej liczby komórek naraz- mało prawdopodobne

- zakażanie małej liczby komórek i wirus przenosi się tez do innych komórek

TRANSPORT WIRUSA W ROŚLINIE

- wirus dostaje się do komórek skórki potem do komórek miękiszu palisadowego albo gąbczastego, potem do wiązek przewodzących hipoteza

- z komórek do komórek transportowane są przez plazmodesmy hipoteza

- zostało odkryte białko, które służy do transportowania przez plazmodesmy

# funkcje białka - struktura białka transportowego, pasuje do struktury błon komórkowych, plazmodesmy. Jeżeli doczepi się tu kwas nukleinowy wirusa zostaje przeciągnięty przez plasmodesmę ( pierwszy raz wykryto to w przypadku wirusa mozaiki tytoniu). Modyfikacja plasmodesm - białka transportowe poszerzają błony. Plazmodesmy się poszerzają.

8 GODZIN - tyle czasu wirus opanowuje 1 komórkę

- wirus może być transportowany przez Felom, najpierw do korzeni a potem dopiero do organów nadziemnych, doświadczenie Samuela

- niektóre wirusy mogą być transportowane przez Ksylem

Transport przez wiązki przewodzące przyspiesz czas w którym wirus opanowuje komórkę- kilka lub kilkanaście na godzinę.

ELEMENT WOLNY OD WIRUSA W ROŚLINIE - MERYSTEMY WIERZCHOŁKOWE , zarówno na łodydze jak i na korzeniu.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 5 2006 - 05 - 15

Ochrona roślin przed wirusami

  1. zdrowy materiał wyjściowy - rośliny z nasion i rozmnażane wegetatywnie

  2. ochrona przed wektorami

- gleba wolna od grzybów i nicieni

- chemiczna ochrona przed mszycami - przypadki przenoszenia trwałego i nietrwałego

- rośliny ochronne na obszarach pól

- folia odblaskowa

- opryskiwanie olejami,

odmiany odporne ( TOMU, PUX, PUV, PVM )

ochrona plantacji nasiennych i matecznych:

- absolutnie zdrowy materiał wyjściowy

- dostatecznie częsta i skuteczna kontrola zawartości

- izolacja od źródeł infekcji wektorów (przestrzeń i bariery; szklarnie )

- wyspecjalizowany personel, wyposażenie i świadomość

ciekawostki:

- wirycydy - inhibitory (Viarazol, chitozom)

- wakcynizacja (szczepienie ochronne)

- merystemy

- termoterapia

PRODUKCJA ZDROWYCH SADZONEK CHRYZANTEMY:

RODZAJE TESTÓW

- Biologiczne:

wykorzystywanie bioindykatorów, roślin wskaźnikowych, które zawsze dają(roślin wzorcowych)

zalety - prosty, bardzo wysoka czułość testu,

wady - objawy często otrzymujemy po długim okresie (standard 1 - 3 tygodnie)

- Serologiczne:

robimy surowice uczuloną na konkretny wirus na przykład surowice na pstrość tulipana.

zalety - bardzo szybkie (wynik w ciągu 0,5 godziny), prostota

wady - słaba czułość testu

Test Lateksowy:

Na kulkach lateksowych umieszczone są przeciwciała

Test Eliza:

Eliza skrót od pierwszych liter test imano sorpcji enzymu

Etapy :

- nakładamy do studzienki surowice (przeciwciała) - 4 godz. w 37 st. C

- płuczemy , odpada to co nie jest związane z płytką

- dodajemy wirus - 12 godz. w 4 st. C

- płuczemy

- dodajemy koniugat (surowica + enzym) wiązany przez wirusa

- dodajemy substrat , który zmienia barwę (natężenie barwy = natężenie cząstek wirusa).

RODZAJ TESTU

granice wykrywania wirusa

biologiczny

0,3 pg/ml

techniki serologiczne

1 ng / ml

1 - 10 ng / ml

percypitacja

test lateksowy

test Eliza

techniki

WAKCYNIZACJA :

Wprowadzamy do organizmu osłabiony / atenuowany wirus :

Zakaża on ale nie wywołuje objawów. Obecność wirusa hamuje uwalnianie RNA z wirusa - z płaszcza białkowego

TERMOTERAPIA :

Program odwirusowania chryzantemy

Wirus źle się namnaża w temperaturze 38 - 42 st. C - to co wyrośnie jest wolne od wirusa ; hodowla merystemów.

Wiroidy - wolne kwasy nukleinowe

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 6 2006 - 05 - 22

WIROIDY:

Nagi kwas nukleinowy, pozbawiony okrywy białkowej, są to bardzo krótkie kwasy nukleinowe, nie są w stanie kodować żadnego białka, nawet własnej replikacji !!!

Struktura wiroidów:

- jedno niciowy RNA, zachowujący w sposób szczególny, końce RNA są ze sobą związane, wiroidy są w postaci kolistych cząsteczek kwasów nukleinowych - struktura spinki do włosów.

- struktura drugo rzędowa RNA; rozgałęzione nici - struktura główki młotka

W zależności od struktury powstaje klasyfikacja:

1. rodz. POSPOVIROIDE - struktura spinki do włosów

2. rodz. ASSUNVIROIDE - (nie ma tu wyróżnionych domen) struktura główki od młotka

WIROIDY STANOWIĄCE POTENCJALNE ZAGROŻENIE ROŚLIN UPRAWNYCH:

  1. ziemniak - wiroid wrzecionowatość bulw ziemniaka, straty do 65 % przez ten wiroidy (wykryty przez SGGW)

  2. pomidor - wiroid karłowatości wrzecionowatej pomidora

  3. złocień - wiroid karłowatości złocienia, wiroid chlorotycznej plamistości złocienia

  4. ogórek - wiroid bladości ogórka

  5. chmiel - wiroid karłowatości chmielu, utajniony wiroid chmielu (wykryty przez SGGW)

  6. jabłoń - wiroid bliznowatości skórki jabłek (wykryty przez SGGW)

  7. brzoskwinia - wiroid utajnione mozaiki brzoskwini (wykryty przez SGGW)

Namnażanie :

- wiroidów wykorzystują d namnażanie już istniejącą w komórce polimerarazę RNA II

- mechanizm toczącego się koła

Pochodzenie wirusów:

  1. hipoteza- profesor Dimer - „ wiroidy to zbite introny ”, gdyby się intron usamodzielnił to mogłyby się wiroidy replikować z RNA roślinnego - mało prawdopodobne

  2. hipoteza- są to żywe skamieliny - SA one początkami życia. RNA może istnieć odrębnie.

Patogeny układu transkrypcyjnego

Praktyczne cechy wiroidów jako patogenów:

- z komórki do komórki transportowane przez plazmodesmy, w roślinach na duże odległości przez floem

- w przeciwieństwie do wirusów, wiroidy mają zdolność do atakowania komórek merystematycznych

- nie można ich wyeliminować przez wycinanie merystemów, ani przez termoterapię, bo one w wysokich temperaturach dobrze się rozmnażają (około 30 st. C.)

Przenoszenie z rośliny na roślinę:

  1. Mechanicznie przez sok

  2. Nie są przenoszone przez wektory, ale są wyjątki np. wiroid wrzecionowatości bulw ziemniaka

  3. Wiroidy jako takie nie SA przenoszone przez ptaki, chyba kwas nukleinowy schowa się do kapsydu wirusa to może być przeniesiony przez jakiegoś wektora

  4. Przenoszone z nasionami i z pyłkiem np. na rośliny zapylane, stwarza to problemy w hodowli twórczej

Ochrona :

- musimy mieć zdrowy materiał wyjściowy

- istotną sprawą jest wykrywanie wiroidów,

Testy biologiczne

Testy serologiczne - nie możliwe do wykonania, bo nie można wykryć białka - bo go nie ma !

Elektroforeza na żelu poliakryloamidowym - wyrywanie kwasu nukleinowego

Przy pomocy sondy molekularnej - sonda molekularna powstaje podczas odwrotnej transkrypcji, ma DNA odwrotne do DNA wiroida, metoda cDNA:

- nanosi się próbki kwasu nukleinowego; zapieka się, potem taką sondę się kąpie w cDNA sonda wtedy jest autoreaktywna - robimy autoradiogram, metoda bardzo czuła, bardzo mało wydajna, np. przy teście Elizy można zrobić w 3 osoby 1000 próbek w dwa dni, tutaj tylko 12, tą metodą można wykrywać też RNA wirusowe. Bardzo długi czas oczekiwania, kłopotliwa ; dobra dla ziemniaka bo i tak przechowujemy.

5 st. C przez 6 miesięcy (przechowujemy rośliny) - wycinamy merystemy - 20-80% roślin zdrowych, termoterapia w niskich temperaturach

PCR - powielanie materiału wiroida, potem stosuje się elektroforezę

RT.PCR - powielanie RNA wiroidowego, potem elektroforeza - test trochę gorszy od biologicznego.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 7 2006 - 05 - 29

FITOPLAZMY :

OMP - Organizmy mykoplazmatyczne

Są to prymitywne bakterie, mają roślinokształtne komórki, nie mają ściany komórkowej, zamiast tego mają trójwarstwową

Fitoplazmy to organizmy, bardzo proste, bez ściany komórkowej, maja tylko błonę 3 warstwową - dlatego maja nie określony kształt, niektóre występują w postaci nitkowatych spiralnych komórek -> SPIROPLAZMY

- Posiadają genom ( 5 x 10 8 Da) w postaci DNA, genom piroplazmy 2 razy większy.

- Nie mają jądra.

- Poza floemem fitoplazm nie ma, fitoplazmy przemieszczają się przez sita.

- Trudno je znaleźć w roślinie.

Próba INAKULACJI MECHANICZNEJ - próba przeniesienia patogena przez sok. Jeżeli próba ta się powiedzie to znaczy że chorobę spowodował wirus nie fitoplazma.

OBJAWY:

- zablokowany transport asymilatów, żółtaczki np. żółtaczka astra

- karłowatość (może wynikać z zaburzeń transportu, np. karłowatość maliny

- proliferacja pędów - wybijanie pąków śpiących, np. proliferacja jabłoni, pędy te wyrastają w dużej ilości z jednego miejsca - miotlastość

- odwrotna ewolucja kwiatów - liście zamiast płatków, kwiat koloru zielonego.

Patogeny zimują w roślinach i w wektorach np. w roślinach zimotrwałych

OCHRONA :

- należy wprowadzać zdrowy materiał wyjściowy,

- ochrona przed wektorami (skoczki, mrówki)

- kuracja antybiotykowa np. antybiotyki tetracykliczne, po zastosowaniu objawy cofają się po zakończeniu podawania antybiotyku objawy wracają - czyli nie zwalczone są fitoplazmy, zostaje wstrzymane tylko ich rozmnażanie.

Stosowanie antybiotyków w Polsce jest zakazane, bo gdy człowiek zje roślinę z antybiotykiem to będzie przyjmował dawki antybiotyku i bakterie się uodpornią - człowieka nie da się potem wyleczyć.

UWALNIANIE ROŚLIN OD FITOPLAZM:

- zabieg termiczny - kąpiele sadzonek w trzcinie cukrowej w wodzie w temperaturze52 st. C. na 10 15 minut - dezynfekcja.

Metody wykrywania fitoplazm:

- test DAPI - odczynnik barwiący DNA, tam gdzie jest dużo fitoplazm tam gdzie występuje dużo fitoplazm występuje barwienie

- test Eliza - na określone białka

- metody rozdziału DNA na różnych podłożach - techniki molekularne

BAKTERIE WŁAŚCIWE:

Budowa:

- materiał genetyczny - chromosom, nukleotyd, genofor (brak jądra) + plazmidy drobne komórki DNA (ich obecność i rozmieszczenie przyczyną zmienności), do niedawna uważano, że na plazmidzie są mało istotne cechy, ale okazało się, że tak nie jest.

- posiadają rzęski, organelle ruchu,

- cytoplazma - rybosomy, brak mitochondriów, mezosomy, które powstają przez wpuklenie plazmolemmy, chromatofory,

- fimbrie - krótsze od rzęsek i grubsze, ich rola nie jest do końca wyjaśniona(rola w koniugacji, pobieraniu pokarmu),

- ściana białkowo-lipidowa

Rozmnażanie:

- podział prosty w 0,5 h

- pączkowanie

Nie rozmnażają się płciowo !!!

4 zmienności dziedziczne;

- KONIUGACJA - wymiana materiału genetycznego (nie musi być w całości) to przyczyna zmienności dziedzicznej, nie jest to forma rozmnażania bo nie powstają nowe organizmy.

- Najczęstszą przyczyną zmienności u bakterii są MUTACJE, zachodzą one bardzo często u bakterii i często są dla nich bardzo pozytywne.

- TRANSFORMACJA GENETYCZNA : bakteria może pochłonąć materiał genetyczny innej komórki ( to nie koniugacja)

- TRANSDUKCJA : przenoszenie bakterii, przez bakteriofagi i zakażanie nowej bakterii.

Tworzenie przetrwalników - tworzą je bakterie patogeniczne - nie wiemy czy stanowią źródło zakażenia

Bakterie jako patogeny roślin:

- mogą zakażać poprzez zranienia

- mogą wnikać przez szparki i hydatody (szparki wodne),

- mogą wnikać przez nektarniki w dnach kwiatowych, mają tu dużo cukru - pożywka,

- mogą wnikać przez włośniki,

- mogą wnikać przez znamię słupka

Wszędzie tam gdzie nie ma kutikuli, bądź została uszkodzona.

W roślinach występują w przestrzeniach międzykomórkowych w miękiszu, często też w tkance przewodzącej w naczyniach, w miejscu występowania w roślinie widoczne są objawy :

AGROBACTERUIM; narośle na korzeniach, łodygach i duża ilość korzeni,

CORYNEBACTER; brunatnienie wiązek przewodzących, więdnięcie, (bakteria naczyniówka)

ERVINIA; zgnilizna , zgorzele, bakterie występują w miękiszu.

PSEUDOMONAS; plamistości , więdnięcie

XANTOMONAS; plamistości nekrozy nerwów, zgnilizny

STREPTOMYCETES; parch zwykły ziemniaka, zewnętrzne uszkodzenia

Rozprzestrzenianie;

z wodą np. z deszczem

przez wiatr np. erwinia amylovora

przez owady

Zimowanie:

W glebie : saprotrofy głównie , wiele epifitami( zasiedlają liść nic mu nie robiąc, a po zmianie warunków na korzystne objawy)

Ochrona :

środków chemicznych się nie używa

antybiotyków się nie używa , tylko do ervinia amylovora

środki miedziowe

metody agrotechniczne

listy kwarantannowe

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 8 2006 - 06 - 05

Typy plechy u grzybów:

- plazmodium - śluźnia

- sorus - zespół komórek

- grzybnia cenocytyczna (celuloza)

- grzybnia mycelium (chityna)

Gromada OOMYCOTA:

Dominującą fazą jest diplofaza, proces płciowy typu oogamii, gametangia (wielojądrowe gamety) plemnia i lęgnia.

Tylko 1 jądro plemni bierze udział w zapłodnieniu 1 jądra lęgni, reszta degeneruje - gruba błona - oospora(zarodnik przetrwalnik) - strzępka z zarodnią pływkową - zarodniki pływkowe diploidalne - podział redukcyjny R! - przy tworzeniu gametangiów.

Grzybnia wewnątrz tkanek między komórki przez szparkę, trzonki sporangialne przez dolną stronę liścia (chronią się przed zbyt dużym nasłonecznieniem)

Królestwo Fungi (grzyby właściwe) dominująca faza - haplofaza. Są to plechowce nie tworzą organów pełniących okrywową funkcję.

Klasyczna plech to grzybnia złożona ze strzępek i ma ona nie ograniczony wzrost, wszystkie utwory grzyba są wytworami grzyba.

Duża powierzchnia do pobierania pokarmu - okrągłe nitkowate rozgałęzienia.

Ssawki (haustoria) do pobierania pokarmu; wnikają do wewnątrz komórek, plektenchymatyczne (nibytkanka) strzępki mogą się poplątać, przekrój poprzez (podobne do tkanki ) sklerocjum zbudowane z plektenchymatycznej przetrwalnikowej grzybni.

Grzyby odżywiają się osmotroficznie - ciśnienie osmotyczne w ssawce jest bardzo duże - woda wpływa do ssawki, wszystko co z wodą dostaje się na powierzchnię ssawki ma błonę półprzepuszczalną. Może zostać wymienione na zasadzie jon na jon. Elementy nie rozpuszczalne muszą zostać rozłożone do postaci rozpuszczalnej i zostać pobrane (celuloza - glukoza).

Bezpłciowe rozmnażanie grzybów:

- chlamydiospory - tworzą się przez rozpad grzybni

- pączkowanie - (blastospory u Taphrina)

- sporangia - sporangiospory - zarodniki sporangialne (wiatr - Zygomycota)

- zarodniki konidialne

Tworzenie odiów - komórka macierzysta się dzieli u podstawy, starsze odpychane ku górze, odrywane i rozsiewane przez wiatr.

Trzonki konidialne - rozgałęzienie strzępek grzybni o szczególnych cechach - zakończony wzrost - określona liczba komórek ( w przybliżeniu) zarodniki zawsze na końcu strzępki, odrywa się strzępka , dalej nie rośnie; różne kształty pędzlowate (Penicilinum)

Rozmnażanie płciowe:

Tworzą gamety - proces płciowy - zapłodnienie - zygota

gamety nie różniące się morfologicznie - izogamia Chytrydiomycota

gamety różniące się morfologicznie - anizogamia

gamety ruchliwe - planogamia Chytrydiomycota

gamety nie ruchliwe - aplanogamia

Gromada ZYGOMYCOTA:

Zygogamia, gamety ze strzępek grzybni rozgałęziają się - zygogamety łączą się - diploid zygospora (przetrwalnik)

Ściana zależnie od typu grzyba (chityna, betaglukan)

Grzybnia cenocytyczna

Patogeny Rhizobus

Gromada ASCOMYCOTA:

Zarodnia (casus) worek, bezpłodne trzonki konidialne; lęgnia (askogonium)

W zapłodnieniu biorą udział wszystkie jądra lęgni, plemni (w przeciwieństwie do oogamii); tworzą one pary jąder sprzężonych (dikariofaza 2x) - zachodzi rozwój w dikariofazie lęgnia kiełkuje w strzępki workotwórcze w pewnym momencie kariofaza - po połączeniu mejoza 4 jąder 1 n - dalej podziały mitotyczne - 8 haploidalnych jąder (stworzyła się zarodnia casus - worek)

Ostatecznym wynikiem procesu płciowego są haploidalne utwory.

FITOPATOLOGIA WYKŁAD 9 2006 - 06 - 12

Worki mogą być nagie na powierzchni np. liścia albo w owocnikach

- kuliste bez zamknięcia - musi pęknąć (kleistotecjum) występują u mączniaków prawdziwych

- otocznie otwarte (perytecja) różnego kształtu

- płaskie owocniki miseczkowate (apotecjum) na nich worki - u workowców, niektóre mogą być od góry zamknięte

- pseudotecja

Parch jabłoni

Workowce, rozmnażanie bezpłciowe za pomocą zarodników konidialnych

- infekcja liści pod kutikulę, grzybnia na niej zarodniki konidialne ( od zarodnikowania do zarodnikowania 14 dni)

- liście spadają zachodzi proces płciowy - w pseudotecjach zarodniki w workach

- marzec początek kwietnia grzyb się rozwija otocznie są dojrzałe , zarodniki w końcu kwietnia zakażają

- stadium workowe saprotrofy, doskonałe, telomorfa (rozmnażanie płciowe)

- stadium konidialne, pasożyt, niedoskonałe, anamorfa (rozmnażanie bezpłciowe)

Klasa: BASIDIOMYCOTA (podstawczaki)

Zapłodnienie ma charakter somatogamii, grzybnia dikariotyczna (podstawowa forma życiowa) , zarodniki na podstawce.

Rząd :RDZE

Zarodniki zakażają roślinę na niej spermogonia ( w nich spermacja) tworzy się grzybnia dikariotyczna - rośnie w tkankach, rosną ecja i ecjospory ( zarodniki zakażają - grzybnia nowe zarodniki :

uredinia z urdiniosporami

telia z teliosporami

Przetrwalniki wiosną kiełkują w podstawkę.

Niektóre rdze cały cykl na jednym żywicielu (jednodomowe) lub dwudomowe.

WYKŁAD 1 02/10/2006

T: CHOROBY ROŚLIN

  1. infekcyjny proces chorobowy:

INFEKCJA: rozpoczyna się w momencie fizycznego kontaktu patogena z rośliną, a kończy rozwiązaniem kontaktu pasozytniczego

Drogi wnikania:

  1. przez nieuszkodzona kutykulę i skórkę (wnikanie bezpośrednie)

  2. przez miejsca nie okryte kutikulą

  1. przez zranienia

INKUBACJA: rozpoczęcie kosztem rośliny gospodarza i trwa do wystapienia pierwszych objawów chorobowych

CHOROBA WŁAŚCIWA: obejmuje kolejne widoczne zmiany wynikajace z pasożytowania patogena ( w tym POHJAWIENIE SIĘ OZNAK ETIOLOGICZNYCH SPRAWCY CHOROBY BĘDĄCE ZWYKLE FORMAMI ROZMNAŻANIA PATOGENA.)

Wykład 2 16/10/2006

Infekcyjny proces chorobowy

wykład 3

ODPORNOŚĆ - zjawisko braku porażenia rosliny zywicielskiej

~~*~~*~~*~~*~~

  1. więdnięcia

  2. nekrozy

  1. zmiany zabarwienia

  1. zniekształcenia

  1. Narośla

  2. Wydzieliny

  1. rany

roznoszenie grzybów: lęgniowców, workowców

roznoszenie bakterii

roznoszenie pyłky z wirusem nekrotycznej plam,istości wiśni i czereśni

przenoszenie zarodników rdzy na pszenicy

patogeny glebowe

zabiegi pielęgnacyjne, prez narzędzia do pielegnacji roślin,np. rak bakteryjny pomidora, wirusy

przenoszenie przez owady 9mszyce, miodówki przenosza wirusy, larwy- bakterie, pszczoły - bakterie, ptaki: zaraza ogniowa, wciornastek zachodni - wirus brązowej plamistości pomidora)

WYKŁAD 4

ŚroDowIsko

wykład 5

  1. współczynnik szkodliwości choroby

q=[ (Pz-Pch) : Pz ] * 100

Pz- plon z roslin zdrowych

PW- plon z roslin chorych

q- współczynnik szkodliwości choroby

  1. warunki opłacalności ochrony

Wu= Wo- Wch ; Wu>K

Wu- wartpsć uratowanego zbioru dzięki ochronie

Wo - rośliny ochrobnione

Wch rosliny chore

  1. wskaxnik ekonomicznej aktywności

E= Wu:K

K - koszty poniesione na ochronę

E- współcz. Ekonomicznej efektywności

wykład 8

ide sobie zrobic herbatke, a wy się uczcie

Fungicydy

Dawka efektyw

Krzywa toksyczności

Dawka efektywna

I

Ed50<1ppm

b. toksyczny

II

Ed50 1-50ppm

III

ED50- 51-100 ppm

IV

ED50>100ppm

Mało toksycny

0,25-0,3% - wyższe stężenia

określanie dawki toksycznej: 50-500mg/kg ciała- wysokosc dawki ustalamy (szczury, myszy)- efekt dermatologiczny i ustny

stosowanie fungicydu niesie za soba działanie toksyczne, podraznienie oczu, śluzówki, alergie

WP - proszek do sporzadzania zaiwsin

S.C.- roztwór skoncentrowany

SE - emulsja

SP - proszek rozpuszczalny

WG- granulaty

  1. działanie zapobiegawcze: ochronna wrstwa fungicydyu uniemozliwoa infekcje

  1. działanie interwencyjne: zahamowanie rozwoju grzyba

  2. działanie wyniszczające - zahamowanie lub zniszczenie grzybni rowijającej się na powierzchni

  3. działanie luznicze: zdolność do zniszczeniapatogena w tkankach, działanie w tkankach żywych możliwe, w tkankach martwuych niemozliwe

FITOTOKSYCZNOSĆ - toksyczne działanie na rośliny, stymuluja ją warynki zewnętrzne

Wykład 9

inne grupy organiczne:

wykład 10

wykład 11

OCHRONA jabłoni przed parchem:

Wykład 12 ciag dalszy 9ale nie mam ciągu nie dalszego od tego wykładu)

fitoauksyny

rozpuszcanie ścian komórkowych

synteza i pzremiany zw. Fenolowyych

enzymy

nadwrazliwość

1



Wyszukiwarka

Podobne podstrony:
EGZAMIN Z FITOPATOLOGII, Ogrodnictwo UP Lbn, fittopatologia, ściągi testy egzaminy
fitopatologia material, Ogrodnictwo UP Lbn, fittopatologia
sciagi z metod, Ogrodnictwo UP Lbn, Ochrona roślin. Metody i środki
sciaga z gleboznawstwa 2, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sciaga z glebozmnawstwa, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc10, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc9, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc3, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc11, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc8, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc5, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc4, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc3a, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
sc7, Ogrodnictwo UP Lbn, Gleboznawstwo, Materialy i sciagi z gleboznawstwa
Doniczkowe zestawy, Ogrodnictwo UP Lbn, ROŚLINY OZDOBNE, ozdobne 5 semestr, Doniczkowe

więcej podobnych podstron