W oparciu o wymagania pokarmowe i środowiskowe mikroorganizmy dzieli się na liczne grupy fizjologiczne, obrazujące możliwości ich wzrostu w określonych warunkach, co z kolei jest konsekwencją określonego ..wyposażenia enzymatycznego" mikroorganizmów.
Określony gatunek, w zależności od rozpatrywanych kryteriów, można zaklasyfikować do kilku różnych grup fizjologicznych.