1

Polimorfizm sekwencji mikrosatelitarnych i		Sekwencje mikrosatelitarne (SSR, STR): • krótkie tandemowe powtórzenia 1-6 nukleotydów
przykłady jego wykorzystania w kontroli		np. AAAA, CACACACA, GTAGTAGTA
pochodzenia psów		• powstają prawdopodobnie w wyniku duplikacji
Mgr Jakub Cieślak Katedra Genetyki i Podstaw Hodowli Zwierząt		sekwencji DNA •    występują w genomie co 6-10 kpz. •    90% z nich wykazuje polimorfizm tzn. w populacji może występować od kilku do kilkudziesięciu alleli
		danej sekwencji różniących się od siebie liczbą powtórzeń

Sekwencje mikrosatelitarne cd.

• jeden osobnik może posiadać maksymalnie dwa allele określonej sekwencji, jeden odziedziczony od ojca, a drugi od matki (mogą być to identyczne allele i wtedy osobnik jest homozygotyczny w danym locus)

Metodyka badań:

•    izolacja DNA

•    reakcja PCR - specyficzna amplifikacja in vitro wybranych odcinków DNA

•    badanie polimorfizmu długości sekwencji mikrosatelitarnych w automatycznym sekwenatorze ALFexpress II

Badanie polimorfizmu długości sekwencji mikrosatelitarnych

-    CA CA CA CA CA CA -

-    OTOTOTOTOTOr -

Genomowe DNA Sekwencje starter

-    CACACACACACAC

-    OTOTOTOTOTWTOTBTaTOT

Genomowe DNA Sekwencje starterów

Przesłanki do wykonania badań

weryfikacja zapisów rodowodowych

pomoc w ustalaniu ojca w przypadku podwójnych

kryć

podkładanie szczeniąt pochodzących z innych miotów

Identyfikacja znalezionych zwierząt (np.. pochodzących z kradzieży lub zaginionych) Podejrzenia o fałszerstwa w dokumentacji hodowlanej