Stosunek zasad C+G do A EJ’ powinien zawierać sic w przedziale 40% - 50% i być zbliżony dla obu primerów jednej pary (F i R) co zapewnia jednocześnie odpowiednią temperaturę hybrydyzacji (anncaling).
Primery nic powimiy być komplementarne do siebie (self-annealing), ani tworzyć stabilnych struktur drugorzędowyeh typu „spinka do włosów" (liairpin).
Powinny mieć odpowiednią długość (zwykle 18 do 28 nuklcotydów)
Na końcu 3' nic powimiy znajdować .się nukleotydy Ti A.
Primery można projektować przy użyciu programów dostępnych w
IN 1IIRNHCIK. Na przykład pod adresem hltp://gcnomc www2.Stantord.edu/
egi-bin/SG D/wch-pri mer
5-