100 Ro/dziai. 8
/// etap polimcraza DNA I (poi I) (kodowana przez gen po!A) uzupełnia brakujący odcinek, rozpoczynając od końca 3 przerwanej nici, a jako matrycę wykorzystuje nieuszkodzoną nić DNA. Ligaza DNA łączy nowo powstałą nić z pozostałą cząsteczką.
Naprawa długich łat
Proces ten jest słabiej poznany, przebiega podobnie jak opisany powyżej, różni się jedynie długością wycinanych fragmentów.
U Eukariota nie występuje system krótkich łat, a system długich łat obejmuje fragmenty 24-29-nukleotydowe. Enzymy biorące udział w naprawie nic są homo-logami białek Uvr. U człowieka w procesie tym uczestniczy ponad 16 białek.
uszkodzony nukleotyd zagina helisę
UvrB wypełnia lukę
nacięcie fragmentu przez UvrB i UvrC
usunięcie pojedynczej nici przez helikazę DNA (UvrD)
polimeraza DNA I + ligaza DNA
Uli 111 i 1 III 11111111111 m lim
Ryc. 8.4. Wycinanie uszkodzonych nukleotydów u E. coli - naprawa krótkich lat
System ten poprawia błędy replikacji, rozpoznaje miejsca niekomplementame, wycina odcinek DNA i wypełnia lukę.
U E. coli możemy wyróżnić trzy systemy porcplikacyjnej naprawy niedopasowanych nukleotydów:
a) system długich łat (więcej niż lkpz),
b) system krótkich łat (mniej niż 10 nukleotydów),
c) system bardzo krótkich łat.
System naprawy (llii|*lcli lat
System ten wymaga wielu różnych enzymów i przebiega wieloetapowo
(ryc. 8.5):
- / etap - przyłączenie białek MutS, MutH i MutL,
- iYlutS wykrywa brak komplementamości,
MutH odróżnia nić metylowaną od niemetylowanej, wiąże się w sąsiedztwie niekomplcmentarnych sekwencji (zidentyfikowanych wcześniej przez MutS) i tnie wiązanie fosfodiestrowe w nici niemetylowanej,
MutL rola tego białka nie została dostatecznie wyjaśniona, prawdopodobnie koordynuje ono funkcje białek MutS i MutH.
// etap helikaza DNA II oddziela nici DNA, a egzonukleaza degraduje nić naciętą,
III etap — polimeraza DNA III wypełnia lukę, a ligaza DNA odtwarza wiązanie fosfodiestrowe i łączy nić.
brak komplementamości w nici potomnej
przyłączenie MutL
nacięcie przez MutH i usunięcie nici przez helikazę i egzonukleazę
hełikaza DNA II
Ryc. 8.5. Naprawa niedopasowanych nukleotydów u £. coli - system długich lat