- siła elektromotoryczna zostaje najpierw przekształcona w siłę protonomotoryczną, a ta ulega przekształceniu w potencjał przenoszenia fosforanów.
Przepływ elektronów powoduje wypompowanie protonów z matrix mitochondrialnej i powstanie gradientu pH oraz transbłonowego potencjału elektrycznego. Fosforylacja zachodzi na skutek przypływu protonów przez kompleks enzymatyczny z powrotem do matriks.