Cag A - białko będące markerem obecności zespołu genów nazwanych wyspą patogenności (cag-PAI = cag patogenicity island); Cag A indukuje stan zapalny, prowokuje chemotaksję neutrofili; występuje u 60% szczepów; obecność CAG-PAI determinuje większą zjadliwość szczepu
Vac A - cytotoksyna wakuolizująca; występuje u 40% szczepów
Lipopolischarydy bakteryjne: identyczne z niektórymi antygenami grup krwi.
Mogą indukować reakcję autoimmunologiczna przeciwko komórkom okładzinowym