Helicobacter pylori ma specyficzne powinowactwo do nabłonka gruczołowego żołądka
Nie wykazuje inwazji błony śluzowej - bakterie przenikają przez warstwę śluzu i przylegają do powierzchni nabłonka (> warunki mikroaerofilne)
Ochrona bakterii przed kwasem - produkty ureazy (amoniak)
Białka bakterii stymulują proces zapalny (napływanie i degranulacja neutrofili, naciek limfocytarny)