Klinicznie następstwa tworzenia kompleksów immunologicznych mogą być bardzo podobne do IgE-zależnej reakcji anafilaktycznej. Krążące antygeny tworzą kompleksy z przeciwciałami szczególnie klasy IgG. Zostaje aktywowana kaskada dopełniacza co prowadzi do nacieku neutrofili, które uwalniają enzymy lizosomalne uszkadzające tkanki. Anafilatoksyny C3a C5a mają także zdolność do degranulacji komórek tucznych oraz skurczu mięśni gładkich.