W organizmach prokariotycznych mogą przemieszczać się z plazmidu na chromosom i odwrotnie; występują transpozony złożone i proste elementy transpozycyjne (IS), które zawierają jedynie gen kodujący transpozazę i są oflankowane na końcach odwróconymi powtórzeniami sekwencji rozpoznawanych przez transpozazę.
W organizmach eukariotycznych w obrębie chromosomu lub z jednego chromosomu do drugiego