Macierz
■ Zawiera enzymy związane z utlenianiem kwasów tłuszczowych i pirogronianu, a również cyklem kwasu cytrynowego. W wyniku tego utleniania powstają końcowe produkty - C02 i zredukowany dinukleotyd nikotynamidoadeninowy (NADH). Pierwszy jest usuwany z komórki, a drugi jest głównym źródłem elektronów w łańcuchu oddechowym.
■ Zawiera mitochondrialny DNA i enzymy mitochondiialne do transkrypcji mitochondriałnego DNA.
■ Znajdują się tu wolne rybosomy oraz kilka kopii mtDNA (koduje niektóre białka łańcucha oddechowego i syntazy ATP oraz tRNA i rRNA).
Przestrzeń
międzyblonowa
Zawiera:
■ substraty metaboliczne, dyfundujące poprzez błonę zewnętrzną;
■ ATP wytworzone przez mitochondrium;
* jony wypompowane z przestrzeni macierzy podczas oksydatywnej fosforylacji (oddychanie wewnątrzkomórkowe);