równanie w wędrówce i rozmieszczeniu nukleotydów pozwala na precyzyjne ustalenie np. etiologicznych szczepów w zachorowaniach związanych z wprowadzeniem nowej szczepionki. Można też przeprowadzić charakterystykę (mapowanie) DNA wirusów, posługując się określonymi restrykcyjnymi endo-nukleazami. Stosując hybrydyzację kwasów nukleinowych wirusów, wykrywa się swoiste dla danego wirusa sekwencje kwasów nukleinowych w komórkach w badanym materiale diagnozowanym.
Białkowe struktury wirusowe mogą być charakteryzowane przez migrację w żelach i następnie identyfikację przez mapowanie peptydów i ustalanie sekwencji aminokwasów.
Inny kierunek oparty jest na zastosowaniu przeciwciał monoklonalnych do identyfikacji antygenowych epitopów wirusów, niezależnie od metodyki: w reakcjach immunoenzymatycznych ukierunkowanych na wykrywanie wirusów i ich podjednostek strukturalnych, w reakcjach radioimmunologicznych o analogicznym zastosowaniu, w immunofluorescencji, w celu różnicowania typów i wariantów wirusowych, rozpoznawania mutantów termicznych i innych, umiejscowienia i jakości epitopów w rekombinantach diagnostycznych oraz w celach epidemicznych (np. grypa), przy opracowaniu szczepionek i różnicowaniu chorobotwórczych szczepów pochodzenia szczepionkowego (np. poliomyelitis, wścieklizna, grypa), w dochodzeniach epidemiologicznych. Przeciwciała monoklonalne stały się więc składnikiem powszechnie stosowanym w rozmaitych badaniach naukowych, w tym wirusologicznych, i w diagnostyce wirusologicznej. Metodologię ich otrzymywania oraz bliższe szczegóły ich wielorakiego (też poza wirusologią) zastosowania znajdzie zainteresowany Czytelnik w załączonym piśmiennictwie. Natomiast we wcześniej zamieszczonej tab. 18, współcześnie stosowane różne odmiany metod opartych na technikach biologii molekularnej zaopatrzono uwagami dotyczącymi możliwych ograniczeń ich przydatności i utrudnień interpretacyjnych. Co nie obniża ich atrakcyjności.
W tej metodzie antygeny i przeciwciała wędrują naprzeciw siebie w warunkach półpłynnego środowiska agarowego, a w miejscu zetknięcia powstaje linia precypitacji (wynik dodatni, wyraz reakcji homologicznych antygenów i przeciwciał); natężenie linii jest wykładnikiem stężenia reagujących składników, a liczebność linii precypitacji jest wyrazem ich zróżnicowania. Metoda przydatna do diagnozowania rozpuszczalnych antygenów wirusowych.
W wersji „radialnej” (single radial diffusion test) antygen jest umieszczony w żelu, a przeciwciała (różne surowice identyfikujące) - w wyciętych dołkach. W miejscach zetknięcia z antygenem dyfundującym homologicznych przeciwciał bezpośrednio wokół dołków następuje precypitacja, a jej natężenie jest wykładnikiem stężenia przeciwciał (możliwe pomiary ilościowe).
W wersji hemolitycznej (single radial diffusion hemolysis) do żelu dodane są krwinki czerwone związane z wirusową hemaglutyniną, do dołków dodaje się surowicę, a następnie komplement. W przypadku reakcji krwinka czerwona--hemaglutynina-przeciwdało-komplement dochodzi do hemolizy, a jej strefa jest wykładnikiem miana przeciwciał. Test jest przydatny w przypadkach diagnostyki zakażeń wirusami z epitopem hemaglutyninowym.
Zasada tej metody polega na wędrówce antygenu wirusowego do anody, a przeciwciała do katody. W miejscu zetknięcia powstają linie precypitacyjne. Metoda stosowana w badaniach naukowych, w pewnym stopniu i w diagnostyce.
Metody oparte na ustaleniu określonych odchyleń w reakcjach odpornościowych komórkowych budziły w niedalekiej przeszłości zainteresowanie również w aspekcie diagnostyki zakażeń wirusowych. Bez wątpienia prace te przyczyniły się do poznania imm unopatogenezy licznych chorób wirusowych i w tych aspektach są nadal przedmiotem zainteresowań, lecz nie weszły do szerszego stosowania w praktyce rozpoznawania zakażeń wirusowych.
W aspektach diagnostycznych były badane w licznych zakażeniach wirusowych u ludzi (grypa, odra, różyczka, nagminne zapalenie ślinianek przyusznych, wirusowe zapalenie wątroby B itd.), jak również w doświadczalnych zakażeniach na zwierzętach (myszy, świnki morskie, króliki, fretki, małpy), w odniesieniu do szerokiego zakresu wirusów. Stosowano rozmaite metody informujące o uruchomieniu komórkowych mechanizmów immunologicznych jako reakcji na wniknięcie wirusów lub wprowadzenie określonych antygenów wirusowych.
Wyniki badań wykazały największą zbieżność w przypadku ostrych zakażeń wirusowych, zwłaszcza w pierwszym okresie (1-3 tygodnie) po wniknięciu wirusa. Komórkowe reakq’e immunologiczne były dodatnie głównie w okresie pojawienia się pierwszych dodatnich odpowiedzi humoralnych, natomiast wartości klasycznych odczynów komórkowych (migracja, transformacja blastycz-na) wracały do normy w okresie narastania przeciwciał. Prowadzone badania miały głównie charakter metodyczny oraz poznawczy (swoistość, czułość, mechanizmy procesów komórkowych). Do rutynowej diagnostyki wirusologicznej nie weszły.
Do zwrócenia uwagi na to zagadnienie, również i w tym rozdziale, skłania coraz powszechniejsze stosowanie inhibitorów replikacji wirusów, co jest związane z zasadniczym postępem w rozwoju badań i produkcji chemioterapeuty-ków. Zdarza się niestety, że brak znajomości zakresu skutecznego działania określonego inhibitora replikacji wirusa (chemioterapeutyk) powoduje jego nadużywanie, stosowanie w zakażeniach wirusami, na które ten preparat nie ma działania lub ma działanie znikome, a więc nie powinien być zalecany. Poza tym istnieją (w tym m.in. w następstwie niewłaściwego podawania - dawkowanie!) odmiany (warianty) wirusów opornych na dany lek, polecany do leczenia tych zakażeń. Na przykład istnieją warianty TK~ szczepów wirusa Herpes simplex, nie kodujące wirusowej kinazy tymidynowej, których replikacja nie jest bloko-