W zakażeniach OUN do badań należy pobrać płyn m-r w ilości 3-5 ml.
W zakażeniach układu moczowego i nerek materiałem do badań mykologicznych jest mocz pobrany ze środkowego strumienia, po dokładnym przygotowaniu chorego. U noworodków i niemowląt prefcrowna jest punkcja nadlonowa lub mocz pobrany przez cewnik.