28134

ZADANIA DO W YKONANIA

1.    Na podstawie danych z pliku dane.txt (z poprzednich zajęć) obliczyć frekwencje poszczególnych alleli dla każdego z markerów.

2.    Przedstawić frekwencje alleli na stosownym wykresie.

3.    Wyznaczyć i przedstawić na stosownym wykresie wartości MAF.

PRACA Z PROGRAM EM EMLD

4.    Utworzyć na dysku komputera katalog o nazwie EMLD i umieścić w nim pliki otrzymane drogą mailową.

5.    Zapoznać się z instrukcją obsługi programu EMLD, a w szczególności ze strukturą pliku wejściowego.

6.    Sprawdzić działanie programu na przykładowym pliku wejściowym TEST.dat (Jeżeli na komputerze nie ma zainstalowanego oprogramowania JAVA, wejść na stronę http://iava.com/pl/download/index.jsp oraz zainstalować program.)

7.    Przeanalizować pliki wyjściowe. Jak się nazywają? Co zawierają?

8.    Z pliku doEMLD.txt utworzyć plik wejściowy do programu EMLD oraz przeanalizować go z jego użyciem. DOBRA WIADOMOŚĆ: program działa też dla pliku wejściowego z rozszerzeniem txt Q

9.    Zinterpretować wyniki i zapisać wnioski.