Jest to chromosom powstały w wyniku translokacji fragmentu ramienia długiego chromosomu 9 na ramię długie chromosomu 22 46XX, t9-,22q+. W czasie translokacji fragment onkogenu ABL zostaje przeniesiony z chromosomu 9 na chromosom 22 w rejon BCR, powoduje to powstanie genu fuzyjnego BCR-ABL.
Mechanizm powstawania chromosomu Philadelphia
Gen ab/jest protoonkogenem kodującym białko cytopłazmatyczne i jądrowe z rodziny kinaztyrozynowych, które jest odpowiedzialne za różnicowanie, podział, adhezję i odpowiedź na uszkodzenia komórek. W warunkach normalnych ekspresja tego genu, a zatem produkcja białka, podlega ścisłej regulacji. Po połączeniu z fragmentem der powstały gen znajduje się ciągle w pozycji włączonej (staje się onkogenem) i wymyka się spod kontroli komórki. Produkowane nowe białko przyczynia się do wzrostu częstotliwości podziałów komórkowych. Dodatkowo blokując naprawę DNA, powoduje szybkie gromadzenie się mutacji w nowych pokoleniach komórek. Wżmoźona produkcja białka bcr/ablupośledza również zdolność komórek do apoptozy. Prowadzi do wzrostu masy nowotworu i w konsekwencji doprowadza do kryzy blastycznej, która niełeczona kończy się śmiercią pacjenta.
Chromosom ten występuje u 90% chorych na przewlekłą białaczkę szpikową, spotyka się go również w ostrych białaczkach limfoblastycznych.