Głównym substratem do syntezy kw. tłuszczowych jest AcCoA, który powstaje w wyniku dek. oksydacyjnej pirogronianu. Jednakże AcCoA nie może przenikać swobodnie do cytozolu- miejsca syntezy kw. tłuszczowych. Rolę przenośnika spełnia cytrynian, który swobodnie migruje przez błony mitochondrialne. Cytrynian tworzy się w matrix mitochondrfum- kondensacja AcCoA i sczawtooctanu, następnie przemieszcza się do cytoplazmy i ulega rozszczepieniu przez iiazę cytrynianową.