Koordynacją działań antyterrorystycznych od grudnia 2004 roku zajmuje się Narodowe Centrum Antyterrorystyczne ł(NCTC - National Counterterrorism Center). NCTC jest to podstawowa organizacja rządu USA dla integrowania i analizowania wszystkich informacji wywiadowczych dotyczących terroryzmu. Jednostka opracowuje również plany strategiczne dotyczące walk z tego typu zagrożeniami. NCTC stara się wykrywać na jak najwcześniejszym etapie planowane zamachy oraz identyfikować terrorystów jak i osoby lub organizacje wspomagające terroryzm. Organizacja utrzymuje krajowe repozytorium terrorystów znanych i podejrzanych. Jest to bank wiedzy w tym zakresie. Popiera rząd w kwestii szerokich działań antyterrorystycznych zapewniając dostęp do wszelkich informacji. NCTC jest organizacją doradzającą DNI (Director of National Intelligence) w sprawach operacji wywiadowczych i analiz odnoszących się do walki z tego typu zagrożeniami. Organizacja zdaje relacje z działalności wywiadu, daje również programy i propozycje budżetowe związane z terroryzmem - zgodne z priorytetami ustalonymi przez prezydenta. NCTC także służy jako podstawowa organizacja strategicznego planowania operacyjnego. Działając w ramach polityki prezydenta Stanów Zjednoczonych i Rady Bezpieczeństwa Narodowego organizacja cały czas prowadzi integracyjne forum między organami (Federalne Biuro Śledcze (FBI), Departament Obrony, Centralna Agencja Wywiadowcza (CIA), Departament Bezpieczeństwa Ojczyzny, Departament Stanu). Organizacja rozdziela między wyżej wymienione organy zadania i obowiązki, prowadzić wydziały lub agencje na działania antyterrorystyczne według strategicznych planów operacyjnych oraz zgodnie z obowiązującymi przepisami prawa, przez co zwiększa się skuteczność działań operacyjnych. Współpracuje ze służbami specjalnymi USA w celu aresztowania, likwidacji osób przygotowujących lub wspierających przygotowane zamachy terrorystyczne. Współpraca dotyczy instytucji takich jak: Federalne Biuro Śledcze (FBI), Departament Obrony, Centralna Agencja Wywiadowcza (CIA), Departament Bezpieczeństwa Ojczyzny, Departament Stanu.