enzymy są nieaktywne gdy brak mg2 + i mn2+
Mg i mn tworzy kombpleks z substratem całe atp w komórkach związane z megnezem
zazwyczaj dwa atomy tlenu i czetry czateczki wody są związane w ten sposób z mg2+ jon mangezu stanowi dodatkowy punkt odziaływania między atp-mg
wiązanie atp indukuje zmiany konformacyjne
normalnie ma lid domain (domena pokrywka)
pętla p po związniu atp zamyka się ciągnąc domenę pokrywy
penda p odziaływuje z grupą fosforanową atp
wiązanie woddorowe łączą atp
działanie kinazy adenylowej jest kalsycznym przykładem indukowanego dopasowania to jest kataliza przez przybliżenie, centrum aktywne powstaje pdzieki ... białka z domeną pętli p to sprężyny motory i zegary
domenty p są zdolne do zmian kon formacyjnych w wyniku wiązania y hydrolizy tri fosforanu nukleozydu
podjednostaka p syntazy atp
nie zawsze można używać równań M-M do analizy inhibicji odwracalnej można gdy;
inhibitory wiążą się i uwalniają szybko w |
poówniau z liczbą obrotów enzymów | |
stęż wolnego inh jest równe |
stężeniu inhibitora kory nie został związany z enzymem | |
typ |
zależność |
prędkość ustalania równowagi między E I Oraz El |
kalsyczne |
I»E |
szybkie |
ciasno wiązane |
I~= E |
szybkie |
powoli wiązane |
I»E |
powolne |
powoli ciasno wiązane |
I~= E |
powolne |
jeśli nie zastosuje się wysokich stężeń substratu to można wyciągać mylące wnioski i zgnorować zjawisko inliibicji casnego wiązania
podwojenei odwrotności wykres w przypadku inliib ciasneo wiązanych wydaje się podobny do wykresu klasycznej inhibijic nie kompetycyjnej niezależnie od prawdziwego sposobu działania tych inhb
w początkowym czasie niezahamownym jeszcze enzymu prezentuje quasi-liniowy przebiega reakcji by w miarę upływu czasu zmeniać go liniowość o innym charaktereze