84742

Interakcja białek z sekwencją ori (powoduje powstanie widełek replikacyjnych) - powstaje kompleks (plenitacyjny?) - wchodzą tam białka:

-    DnaC - które ma funkcję przekaźnika

-    DnaB - jest helikazą - rozrywa wiązania wodorowe

Po działaniu białka DnaA powstaje liniowy obszar, który ulega przemieszczeniu. Na tym inicjacja się kończy, powstają widełki replikacyjne.

Widełki replikacyine w komórce drożdżowei

Sekwencja ori drożdżowego posiada różne moduły. Miejsc do replikacji jest więcej (332). Sekwencje drożdżowe - sekwencje autonomicznie replikujące (ARS) - są krótsze od sekwencji bakteryjnej - nie przekraczają długości 200 par zasad.

Występują 4 segmenty - A, B_1# B₂, B₃.

Subdomeny A i Bi są rozpoznawane przez kompleks rozpoznający - kompleks ORC (wchodzi w jego skład 6 białek). Poprzez ten kompleks proces replikacji jest zsynchronizowany z cyklem komórkowym.

W subdomenach B₂ i B₃ zachodzą właściwe procesy inicjacyjne.

Subdomena B₂ ulega stopieniu, topnienie jest inicjowane przez napięcie torsyjne spowodowane przyłączeniem czynnika ABF1 z domeną B₃.

Dołączenie helikazy i innych białek kończy proces inicjacji replikacji.

2. Elongacja

Różnice między replikacją a transkrypcją.

-    enzymy odpowiadające za replikację syntezują nową nić w jednym kierunku od 5' do 3'. Na jednej nici synteza idzie zgodnie z widełkami, na 2 nici synteza idzie przeciwnie z widełkami.

-    polimeraza DNA nie jest zdolna do inicjacji transkrypcji bez obecności startera.

Polimerazy DNA

Mogą oprócz syntezy DNA degradować aktywności.

I    aktywność - aktywność 3'—>5'

Jest to aktywność korekcyjna - służy do usuwania nukleotydów błędnie zsyntezowanych.

II    aktywność - aktywność 5'—>3'

Występuje tylko w polimerazie DNA I. atakuje koniec 5', ważna w usuwaniu startera.

U bakterii występują 3 rodzaje polimeraz. Polimeraza II jest zaangażowana w procesy naprawcze.

Rozwiązanie 1 problemu.

Jedna nić jest syntezowana w sposób ciągły (nić wiodąca), 2 nić musi być syntezowana we fragmentach (nić opóźniona), które są potem łączone ze sobą.

Fragmenty Okazaki - długość ok. 1000-2000 nukleotydów u E. coli, u Eukaryota - ok. 200 nukleotydów.

Rozwiązanie 2 problemu U Procaryota

Starterem jest krótki fragment RNA, jest on syntezowany przez polimerazę RNA - prymazę, która syntezuje krótkie startery RNA, zawsze zaczynające się od pary A-G. syntezę kontynuuje polimeraza DNA 3 U Eucaryota

Syntezowany jest krótki starter DNA poprzez aktywność prymaty, która jest integralną częścią polimerazy DNA a. Dalej cząsteczka DNA jest syntezowana przez polimerazę d.

Na nici opóźnionej powtarza się synteza.

Zjawiska w widełkach replikacyjnych

Do matrycy dołączana jest helikaza. Po dołączeniu doczepia się prymasa.